新品推荐 | 人全谱甲基化Methylome-seq,临床样本高质量甲基化检查方案!

文摘   2024-10-17 18:08   广东  
基于微量DNA甲基化建库技术和液相捕获测序技术,艾斯基因研发团队开发了Acegen MethylDesign甲基化捕获系统——先转化后正负链同时捕获的技术策略,推出了人全谱甲基化测序产品(Methylome-seq)!解决了微量cfDNA的建库效率问题,集合酶转化(EM-seq)最小损伤和艾斯基因核心单链微量建库技术双技术优势,实现满足低至5-40ng的液体活检cfDNA甲基化精准检测及临床转化应用!广泛用于临床样本的全基因组范围甲基化研究,包含全血、新鲜冷冻组织、石蜡切片、液体活检样本,例如血浆/血清cfDNA、尿液、各类灌洗液等。

全谱甲基化测序了覆盖 >2M个CpG位点, >25,000个CpG Island/基因,是20Mb位点区域的大Panel, 全面覆盖UCSC, Ensembl, ENCODE等数据库关注启动子, CG岛, 增强子等区域;用于疾病甲基化谱、Biomarker筛选、液体活检、肿瘤早检、MRD、治疗预后评估等所有应用场景。一次性解决全基因组范围biomarker筛选和诊断模型构建、验证及转化应用的组织/液体活检方案

技术特点

  • 适用于所有临床样本

  • 数量丰富,数百万可检测的CpG位点
  • 准确性高,单碱基分辨率,高度覆盖CG富集区(>100X);
  • 重要价值,关键调控区域覆盖,涵盖大部分基因启动子和CpG岛

送样要求 

案例文章

1

血浆cfDNA甲基化用于卵巢癌早检和预后‍‍‍‍‍‍


文章标题:Plasma cfDNA methylation markers for the detection and prognosis of ovarian cancer.

发表期刊:EBioMedicine

研究样本:147例组织、 267例血浆

研究结果:基于液相甲基化捕获技术开发了cfDNA甲基化的卵巢癌检测模型(OC-D模型)和预后模型(OC-P模型),OC-D模型在独立验证队列中显示出94.7%的灵敏度和88.7%的特异性,优于传统肿瘤标志物CA 125。OC-P模型则可有效区分高级别浆液性卵巢癌(HG-SOC)患者的预后,与更好的生存率相关。研究还发现,低风险组患者具有更高的同源重组缺陷(HRD)和免疫细胞浸润,为卵巢癌的治疗提供了新的分子层面见解。

2

通过cfDNA液相捕获甲基化无创检测前列腺癌


文章标题:Noninvasive Detection of Neuroendocrine Prostate Cancer through Targeted Cell-free DNA Methylation 

发表期刊Cancer Discovery

研究样本:四种不同类型的前列腺癌组织共42例,独立血浆样本222例

研究样本:基于cfDNA液相捕获开发了模型检测去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中的神经内分泌亚型(CRPC-NE),能够准确量化肿瘤含量,并区分CRPC的不同表型,其检测性能在独立临床队列中得到了验证,显示出较高的准确性(AUC > 0.93),在CRPC-NE的诊断和预后评估中具有重要应用价值。

3

cfDNA甲基化多模态表观遗传特征提高结直肠癌检测准确性‍‍‍‍‍‍‍‍‍‍


文章标题:Multimodal epigenetic sequencing analysis (MESA) of cell-free DNA for non-invasive colorectal cancer detection
发表期刊:Genome Medicine
样本类型:690例血浆
研究结果:研究团队开发了多模态表观遗传测序分析方法MESA,结合cfDNA甲基化、核小体占有率、核小体模糊性以及跨基因启动子和多聚腺苷酸化位点的WPS。研究应用该方法到690个来自3个结直肠癌临床队列的cfDNA样本,并发现包括cfDNA甲基化、核小体模糊度在内的新模态,以及围绕基因启动子和多聚腺苷酸位点的基因组特征,能显著提高癌症检测的准确性。

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🌟项目经验丰富

艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商,每通量>10万例,已经成功完成对人临床样本,大小鼠,猪,牛,食蟹猴,南芥,大豆,水稻,桃,白菜等近百个物种的甲基化测序分析,每年服务100+海外和国内企业及200+高校和医院等客户。

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关于艾斯基因

创建于2016年,隶属于国家高新技术企业和创新型中小企业。核心团队是国内最早一批表观多组学科研技术开拓者之一,在Nature、Cell 等顶级期刊发表论文数十篇。公司全力打造赋能基础科研、精准医学及人群队列研究的 “创新多组学1+N” 技术服务体系,服务于每一个合作项目。


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艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商,专注表观创新多组学,提供表观全景解决方案:DNA甲基化/羟甲基化、DNA染色质互作、RNA甲基化等技术服务,年为 100+海外和国内企业客户、200+ 高校和医院等客户提供10万+ 例样本的技术服务。
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