技术升级|人935K甲基化芯片——队列研究高性价比技术

文摘   2024-10-09 18:06   广东  

Infinium MethylationEPIC v2.0 BeadChip Kit (935K)芯片是Illumina在Infinium MethylationEPIC v1.0 BeadChip Kit(850K)基础上推出的新一代全基因组甲基化筛选工具。可检测人全基因组约950,000个CpG位点的甲基化状态,以单碱基分辨率定量分析全基因组CpG,同时提供高度准确和精确的甲基化测量。935K芯片不但保持了对CpG岛,基因启动子区的全面覆盖,还特别加强了增强子区以及基因编码区的探针覆盖。目前已广泛应用于癌症肿瘤、复杂疾病和衰老甲基化时钟等研究。

艾斯基因作为国内表观遗传的领航者,专注表观组学十余年,为建立更加全面的多组学技术服务平台,强力引入Illumina DNA甲基化芯片,为表观基因组研究员提供全面的甲基化解决方案。


技术特点

  • 全基因组范围CpG位点覆盖
  • 适用于常见癌症和肿瘤研究

  • 便宜实惠,适用于大样本队列研究

  • 兼容多种样本类型,样本间重复性高

案例文章

1

19种常见疾病的全血表观基因组分析(苏格里18K队列)‍‍‍‍‍‍


文章标题:Blood-based epigenome-wide analyses of 19 common disease states: A longitudinal, population-based linked cohort study of 18,413 Scottish individuals

发表期刊:PLoS Medicine (IF:10.5)

技术平台:甲基化芯片

研究样本:18,413例全血样本

研究结果:发现了超过100个新的CpG位点与常见疾病状态(如乳腺癌、慢性肾病、缺血性心脏病和2型糖尿病)的关联,表明血液DNA甲基化可作为多种常见疾病状态的监查标志物。研究还发现了56个新的CpG位点与慢性阻塞性肺病(COPD)和2型糖尿病的发病率相关,发现强调了在EWAS研究中提高标准化和重现性的必要性。


2

甲基化群体定量性状遗传位点精细图谱绘制(中国5K队列)


文章标题:Analysis of blood methylation quantitative trait loci in East Asians reveals ancestry-specific impacts on complex traits
发表期刊:Nature Genetics (IF:31.7)

技术平台:甲基化芯片

究样本:3个队列,共超5000例全血样本

研究结果:揭示了东亚人群血液mQTL特征,填补亚洲人群EWAS研究的空白,对理解群体特异性遗传与表观遗传的关联,以及人类群体遗传多样性都具有重要影响。


送样要求 

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🌟项目经验丰富

艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商,每通量>10万例,已经成功完成对人临床样本,大小鼠,猪,牛,食蟹猴,南芥,大豆,水稻,桃,白菜等近百个物种的甲基化测序分析,每年服务100+海外和国内企业及200+高校和医院等客户。

🌟交付流程稳定

艾斯基因已实现甲基化全自动化测序,标准化流程、拥有低成本优势,项目30天极速交付

🌟高分文章支撑

团队专注表观多组学15年,拥有资深的表观研究经验,多篇CNS及子刊研究成果,助力客户在Nature Communications、Genome Biology、Cell Research等国际期刊上累计发表百余篇论文。

🌟专业的服务团队

艾斯基因有专业的技术与生信分析团队,项目配备一对一专项解答

🌟可选干冰邮寄或上门取样服务

在北京 、上海 、广州 、深圳均可上门取样。其余地区提供免费的干冰寄样服务。


关于艾斯基因

创建于2016年,隶属于国家高新技术企业和创新型中小企业。核心团队是国内最早一批表观多组学科研技术开拓者之一,在Nature、Cell 等顶级期刊发表论文数十篇。公司全力打造赋能基础科研、精准医学及人群队列研究的 “创新多组学1+N” 技术服务体系,服务于每一个合作项目。每年为100+海外和国内企业客户、200+ 高校和医院等客户提供10万 例样本的技术服务。


参考文献


1、Blood-based epigenome-wide analyses of 19 common disease states: A longitudinal, population-based linked cohort study of 18,413 Scottish individuals. PLoS Medicine. 2023.
2、Analysis of blood methylation quantitative trait loci in East Asians reveals ancestry-specific impacts on complex traits. Nature Genetics. 2024.

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艾斯基因
艾斯基因是国内最大的表观组甲基化服务商,专注表观创新多组学,提供表观全景解决方案:DNA甲基化/羟甲基化、DNA染色质互作、RNA甲基化等技术服务,年为 100+海外和国内企业客户、200+ 高校和医院等客户提供10万+ 例样本的技术服务。
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