DNA羟甲基化5hmC是被认为是哺乳动物基因组上的第六碱基，在发育、衰老、神经退行性疾病、复杂疾病及肿瘤发生过程中起重要作用。尽管氧化亚硫酸盐测序（oxBS-seq）能够区分5hmC和5mC进行羟甲基化的研究，但两个文库的制备测序成本依然过高。为推动羟甲基化高质量研究，艾斯基因隆重推出DNA羟甲基化检测技术5hmC-seq，可在单碱基分辨率上特异性、高精度检测基因组上5hmC修饰水平，可广泛用于1）模式动物发育和疾病羟甲基化机制；2）复杂疾病与肿瘤分子分型研究；3）液体活检（cfDNA羟甲基化）等临床应用。
原理上，利用β-葡糖基转移酶(β-GT)将5hmC加上葡糖基，转变成5ghmC，脱氨酶（APOBEC3A）能够特异地脱去C及5mC的氨基使其变为U，而糖基化的5hmC则不被该酶识别，测序时仍被识别为C，因此特异性地检测基因组上的单碱基水平的5hmC修饰。
技术特点
全基因组范围，单碱基分辨率
样本低起始量，酶转法DNA损失小
可用于液体活检，血清/血浆/cfDNA羟甲基化
数据质控
转换率＞99%（lambda DNA）
送样要求
应用领域
1
小鼠胚胎发育中DNA羟甲基化和甲基化研究
文章标题：Dynamics of DNA hydroxymethylation and methylation during mouse embryonic and germline development.
发表期刊：Nature Genetic （IF=31.7）
技术平台：5hmC-seq、WGBS
样本类型：小鼠配子、合子、早期胚胎以及原始生殖细胞
研究结果：揭示了小鼠胚胎和胚系发育过程中DNA羟甲基化和甲基化的动态变化。使用亲本等位基因特异性表征了了小鼠早期胚胎和生殖细胞中的5hmC位点，为胚胎和胚系发育过程中5hmC的调控和功能提供了见解。
图1研究流程设计
图2不同阶段小鼠胚胎的羟甲基化差异
2
人植入前胚胎中DNA羟甲基化的起源，命运与功能
图3 胚胎不同时期的全局羟甲基化图谱
图4 人和小鼠卵母细胞高hmDMRs受精过程中5hmCpG和5mCpG水平的动态变化
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