干货 | 怎样选择合适的农杆菌

文摘   2024-10-31 09:24   北京  


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怎样选择合适的农杆菌

农杆菌简介请移步至推文《农杆菌 侵染效率的王》(点击直达)

根据所用质粒选择合适的农杆菌


市面上商品化的农杆菌有多种,以农杆菌GV3101为例,搜索名称后会出现GV3101、GV3101(pSoup)、GV3101(pSoup-P19)等,那么到底应该选择哪一种农杆菌来进行实验的呢?一些刚接触农杆菌的同学可能只知道GV3101是一种农杆菌,但并不明白后面括号内pSoup、pSoup-P19的含义及功能,因此在产品选择方面经常一头雾水。


图1 GV3101农杆菌搜索页面(https://www.coolaber.com/search?Column_ID=1269&keyword=GV3101)


其实,这类农杆菌的选择与实验所需载体密切相关。

如果使用的载体元件完整,如pCambia系列载体,载体中的pVS1 RepA和pVS1 StaA两种元件能够帮助质粒在农杆菌中进行稳定的复制。若使用的是此类型的载体,直接选择GV3101即可。

如果载体中元件不完整,没有在农杆菌中复制相关元件,进而载体不能在普通的GV3101中进行自我复制,因此需要help质粒的帮助。在GV3101菌株中转入help质粒pSoup,得到GV3101(pSoup)菌株,可帮助pGreen,62SK,pGs2系列质粒在农杆菌中复制。在GV3101菌株中转入另一种help质粒pJIC SA_Rep就得到了GV3101(pJIC SA_Rep)菌株,这类菌株可帮助pgR106、pgR107、pGreen、pGs2系列质粒在农杆菌中复制。

那pSoup-P19这个载体比起pSoup又多了什么功能呢?P19蛋白来源于番茄丛矮病毒,可抑制宿主对外源基因的RNA沉默效应,提高异源基因转录本的稳定性,进而促进异源蛋白的表达,所以在不少实验中都会选择将P19共转进农杆菌内或者将目标农杆菌菌液与含有P19的农杆菌菌液混合应用于瞬时表达体系中。而选择GV3101(pSoup-P19)感受态就可以省去上面的复杂步骤,一步达成实验目的。

图2 两种不同的质粒图谱


根据植物类型选择所需农杆菌

农杆菌在自然状态下就能通过伤口感染大部分的双子叶植物和裸子植物。80%的双子叶植物可以利用农杆菌GV3101进行转化,但是单子叶植物的遗传转化在早期却是一个难题。近些年遗传转化逐步在水稻、小麦、玉米上应用成功,使用侵染更强的EHA105可以在单子叶植物中达到更好的侵染效果。在研究中应用的农杆菌种类繁多,而不同的物种有其转化最适农杆菌,一般可以参考已发表的文献。

通过知网分析近些年发表的500篇有关论文,我们总结了不同农杆菌在植物转化中的使用频次,供您参考。


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