肿瘤驻留微生物群通过乳酸化和免疫调节促进结直肠癌的肝脏转移。
研究发现瘤细菌（如大肠杆菌）导致结直肠癌肝脏转移（CRLM），该作用是通过增加乳酸产生、视黄酸诱导基因1（RIG-I）的乳酸化、抑制NF-κB从而介导M2型巨噬细胞极化、Tregs以及CD8+T细胞发挥作用。
我们可以看出来这项研究的亮点有：肿瘤驻留微生物群、乳酸化和免疫调节。
2. Plexin D1 emerges as a novel target in the development of neural lineage plasticity in treatment-resistant prostate cancer. Oncogene. 2024 Jun 14.
Plexin D1 作为在治疗抵抗性前列腺癌中发展神经谱系可塑性的新靶点。
研究发现PLXND1在神经内分泌前列腺癌（NEPC）患者中高度表达，并与神经内分泌标志物呈正相关。PLXND1的敲低或敲除抑制了神经谱系途径，从而抑制了NEPC细胞增殖、PDX肿瘤类器官活性和异种移植肿瘤生长。HSP70通过降解调节PLXND1蛋白稳定性，HSP70的抑制降低了PLXND1表达和NEPC类器官生长。
我们可以看出来这项研究的亮点有：神经内分泌肿瘤、神经谱系可塑性、PDX肿瘤类器官。
3. Bone-metastatic lung adenocarcinoma cells bearing CD74-ROS1 fusion interact with macrophages to promote their dissemination. Oncogene. 2024 May 27
携带CD74-ROS1融合蛋白的骨转移性肺腺癌细胞与巨噬细胞相互作用，促进癌细胞播散。
研究发现骨转移性肺腺癌细胞（BoM细胞）具有CD74-ROS1融合突变，通过激活STAT3信号募集巨噬细胞，诱导巨噬细胞M2极化，分泌CCL5，介导BoM细胞与巨噬细胞。
我们可以看出来这项研究的亮点有：肺腺癌骨转移、基因融合突变、巨噬细胞。
4. tRF-33-P4R8YP9LON4VDP inhibits gastric cancer progression via modulating STAT3 signaling pathway in an AGO2-dependent manner. Oncogene. 2024 May 23.
tRF-33-P4R8YP9LON4VDP通过AGO2依赖方式调节STAT3信号通路抑制胃癌进展。
研究发现tRF-33从正常对照样品到胃炎组织、胃癌早期和潜伏期组织，tRF-33的表达呈逐渐改变；tRF-33过表达抑制胃癌生长，并诱导细胞凋亡；tRF-33结合AGO2蛋白，通过靶向STAT mRNA的3 'UTR负向调控STAT3的表达，最终抑制胃癌的发生。
我们可以看出来这项研究的亮点有：tsRNAs、AGO2依赖途径。
5. Epstein-Barr virus causes vascular abnormalities in epithelial malignancies through upregulating ANXA3-HIF-1α-VEGF pathway. Oncogene. 2024 May 22.
Epstein-Barr病毒通过上调ANXA3-HIF-1α-VEGF通路导致上皮恶性肿瘤血管异常。
研究发现：与EBV阴性肿瘤相比，EBV阳性肿瘤具有更强的血管生成能力，这种新生血管大多为没有周细胞附着的不成熟血管；由EBV感染引起的血管异常加剧了肿瘤缺氧，并导致肿瘤生长加速；EBV感染上调了ANXA3-HIF-1α-VEGF通路；ANXA3阻断和NK细胞+PD1抗体的新疗法在小鼠体内显著抑制了EBV感染的异种移植物的生长。
我们可以看出来这项研究的亮点有：EBV病毒感染、血管生成和血管功能异常，ANXA3阻断和NK细胞+PD1抗体疗法。
综合以上5篇Oncogene期刊上的研究，大家应该能看出来一些特点了：
虽然研究主题都是肿瘤，但共同的特点就是“非套路”；
虽然研究的主题和亮点不同，但各有各的“创新点”：1是“瘤内菌”，2是“神经内分泌肿瘤”，3是“肺腺癌骨转移、基因融合、巨噬细胞互作”、4是“tsRNAs”，5是“EBV病毒与血管功能异常”。
虽然关注临床问题和角度不同，但大致主题基本是围绕肿瘤的发生发展这个大的主题进行。
接下来我们看Cancer Research，同样还是挑选5篇文章作为案例来分析：
1. RUVBL1/2 Blockade Targets YTHDF1 Activity to Suppress m6A-Dependent Oncogenic Translation and Colorectal Tumorigenesis. Cancer Res. 2024 Jun 20.
RUVBL1/2抑制剂靶向YTHDF1活性并抑制m6A依赖的致癌翻译和结直肠癌发生。
研究从m6A RNA结合蛋白YTHDF1在结直肠癌(CRC)中过度表达并导致化疗耐药这一临床问题出发，以鉴定YTHDF1的可成药靶点为目的，采用CRISPR/Cas9筛选策略，发现RUVBL1和RUVBL2可能是潜在的靶点。
发现YTHFD1和RUVBL1/2形成正反馈环路，加速了癌基因翻译：YTHDF1与m6A修饰的RUVBL1/2 mRNA结合，促进翻译起始和蛋白质表达， RUVBL1/2与YTHDF1在40S翻译起始复合物中相互作用；RUVBL1/2的缺失阻断了YTHDF1-驱动的癌基因翻译和新生蛋白质合成，导致细胞增殖停滞和细胞凋亡；RUVBL1/2的缺失会阻碍YTHDF1诱导的MAPK、RAS和PI3K-AKT信号通路的激活。
使用药物抑制剂CB6644或囊泡状纳米颗粒包裹的siRNA，可以特异性地阻断RUVBL1/2的功能，从而在体外和体内抑制YTHDF1表达的CRC的生长。
我们可以看出来这项研究的特点和亮点有：
YTHDF1高表达结直肠癌的靶向性；
YTHFD1和RUVBL1/2的正反馈环路；
靶向RUVBL1/2的药物抑制剂CB6644或囊泡状纳米颗粒包裹的siRNA。
2. WNK1 Interaction with KEAP1 Promotes NRF2 Stabilization to Enhance the Oxidative Stress Response in Hepatocellular Carcinoma. Cancer Res. 2024 Jun 17.
研究从细胞氧化应激在肝细胞癌中的关键作用出发，以靶向活性氧(ROS)稳态过程为目的，发现WNK1是HCC的抗氧化因子和治疗靶点。 WNK1表达升高并与患者预后不良相关，WNK1敲低显著抑制细胞增殖和异种移植物肿瘤生长。WNK1与NRF2竞争结合KEAP1的部分Kelch结构域，减少NRF2泛素化，促进NRF2积累和核易位，从而增加抗氧化反应；WNK1沉默增加H2O2诱导的细胞凋亡，并通过提高活性氧(ROS)水平抑制细胞生长，这可以通过抗氧化剂n-乙酰半胱氨酸(NAC)和NRF2激活剂tBHQ处理来恢复。肝脏特异性WNK1敲除小鼠肝癌模型证实WNK1通过调节ROS水平促进HCC的发展。 WNK463是一种WNK激酶家族的抑制剂，可以抑制HCC的进展并改变氧化还原状态。WNK1在HCC的发生和进展中起着关键作用，WNK1-氧化应激轴可能是HCC的一个有希望的治疗靶点。
靶向细胞氧化应激治疗肝癌的角度； WNK1与NRF2竞争结合KEAP1后促进NRF2积累和核易位的机制； 以及WNK463作为WNK抑制剂改变氧化还原状态抑制HCC潜在应用价值。
乳腺癌中，抑制CENP-E可诱导染色体不稳定并与多种微管靶向药物协同作用。
研究从抗微管药物治疗乳腺癌的大约只有50%的有效率这一临床问题出发，以鉴定改善抗微管药物抵抗的靶点为目的，发现有丝分裂运动蛋白CENP-E可能是潜在的靶点。
发现有丝分裂运动蛋白CENP-E的抑制克服了由聚焦多极纺锤体引起的抗性，CENP-E抑制增加了聚焦纺锤体上的染色体不稳定性（CIN），使后期纺锤体极点的染色体保持错位，从而大大增加了子细胞的死亡。
CENP-E抑制与多种临床微管毒物协同作用，增强细胞系的细胞死亡并抑制肿瘤生长，对微管靶向药物的初级耐药可以通过同时抑制CENP-E来克服。
我们可以看出来这项研究的特点和亮点有：
靶向抗微管药物有效率低和抵抗的角度；
抑制CENP-E增加了聚焦纺锤体上的染色体不稳定性（CIN），使后期纺锤体极点的染色体保持错位并增加细胞死亡；
CENP-E抑制与微管毒物协同作用。
4. Comprehensive Transcriptomic Analysis of EWSR1::WT1 Targets Identifies CDK4/6 Inhibitors as an Effective Therapy for Desmoplastic Small Round Cell Tumors. Cancer Res. 2024 May 2;84(9):1426-1442.
转录组学分析EWSR1::WT1靶点发现CDK4/6抑制剂治疗促结缔组织增生性小圆细胞瘤。
研究从以EWSR1::WT1基因融合为特征的结缔组织增生小圆细胞瘤(DSRCT)的靶向治疗策略不足出发，以鉴定DSRCT的靶点为目的，发现CDK4/6可能是潜在的靶点。
发现与WT1和其他融合癌蛋白相比，EWSR1::WT1诱导了独特的转录改变，并且EWSR1::WT1结合直接介导基因上调。EWSR1::WT1的E-KTS亚型在转录中起主导作用，它与CCND1启动子结合，通过周期蛋白D-CDK4/6-RB轴刺激DSRCT生长。
使用CDK4/6抑制剂palbociclib治疗成功地降低了两种DSRCT异种移植模型的生长。由于palbociclib已被FDA批准用于治疗乳腺癌，这些发现证明了DSRCT对palbociclib的敏感性，并支持palbociclib治疗这种侵袭性儿童癌症的立即临床研究。
我们可以看出来这项研究的特点和亮点有：
以EWSR1::WT1基因融合为特征的DSRCT的靶向性；
EWSR1::WT1的E-KTS亚型与CCND1启动子结合，通过周期蛋白D-CDK4/6-RB轴刺激DSRCT生长；
靶向CDK4/6抑制剂palbociclib对EWSR1::WT1融合DSRCT的潜在治疗意义。
5. Proteogenomic Characterization Reveals Estrogen Signaling as a Target for Never-Smoker Lung Adenocarcinoma Patients without EGFR or ALK Alterations. Cancer Res. 2024 May 2;84(9):1491-1503.
蛋白基因组学揭示雌激素信号是无EGFR或ALK改变的从吸烟肺腺癌患者的靶标
研究从“无EGFR和ALK改变的NSLA（NSLA从不吸烟的肺腺癌）即NENA”的靶向治疗策略不足出发，以鉴定NENA的靶点为目的，通过蛋白基因组学分析发现雌激素信号可能是潜在的靶点。
研究发现TP53(25%)、KRAS(22%)、SETD2(11%)突变和ROS1融合(14%)是NENA患者中最常见的遗传改变；STK11和ERBB2体细胞突变对NENA的癌症相关基因有广泛的影响；基因集富集分析显示雌激素信号通路是NENA激活的关键通路。雌激素信号的增加与蛋白质基因组改变有关。
Src抑制剂saracatinib被确定为一种潜在的靶向NENA活化雌激素信号的药物，并在体外进行了实验验证，研究提出saracatinib作为缺乏有效靶向治疗的NENA患者潜在治疗方法。
我们可以看出来这项研究的特点和亮点有：
以无EGFR和ALK改变的NENA患者靶向治疗策略；
NENA患者的基因突变和通路活化等特征；
靶向Src抑制剂saracatinib抑制对NENA患者的潜在治疗意义。
下面我们总结一下Cancer Research这5项研究的主要特点：
从临床治疗的难题出发：不管是响应率低、耐药还是没有靶向治疗靶点，研究的目的就是为解决这个难题提供潜在的策略；
以找靶点为第一目的，第二部分是作用和相关机制，三是干预；
最后我们比较案例中Oncogene和Cancer Research的特点：
Oncogene更偏重于发生发展的“新主题”，这种新主题的创新可以是新临床问题、新现象、新机制、新角度等等；而Cancer Research则更偏重于新“解决方案”，即从临床上遇到的问题出发，以解决该问题为目的；
两者一般讲故事的逻辑不同：Oncogene一般从新主题的角度着手，而Cancer Research则一般直接切入临床问题；
如果两者都涉及到机制探索，则多数情况下都需要做的比较清楚和深入，但Oncogene要求略微高一些；
从与转化的远近来看，一般Cancer Research的研究更近一些，对于支持临床研究可提供更直接的证据，有的Cancer Research的研究可直接为Clinical Cancer Research的临床试验提供支持，而Oncogene的研究一般早一些；
由于挑选案例的原因，且在分析期刊的时候有一定的主观性，不是所有的研究都是这种结构，也不是所有的案例都是这种类型，请大家理解，勿杠！
所以……下一篇文章要不要试试投这两本刊？
作者
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