本文改写自Phylogenetic Classification of Living and Fossil Ray-Finned Fishes (Actinopterygii),作者 Thomas J. Near & Christine E.Thacker
35000余种辐鳍鱼类代表着脊椎动物中最高的多样性,也为生物演化乃至人类起源的研究提供了绝佳的范本和材料。对于一个如此庞大的类群的研究,一个可靠的系统发育框架变得至关重要。
2016年尼尔逊《世界鱼类》的出版,标志上一个较为综合的鱼类分类系统的提出,距今已有近十年的时间了。这近十年来分子生物学手段的大量应用,使得越来越多鱼类的遗传密码被揭开,辐鳍鱼类的传统分类系统经历了一次又一次的洗牌。其中最著名的例子,应属传统鱼类分类系统的第一大目鲈形目,在引入分子系统发育之后被拆得七零八落,成为棘鳍类中一个普普通通的存在。分子手段的应用解决了基于形态的系统发育时期的一些颇具争议的分类难题。虽然序列的选择和算法一定程度上影响着生命之树的拓扑结构,但无可否认的是,随着研究数量的不断增加,现有的系统发育框架已变得越来越稳健。为了将这些研究的结果更好地加以应用,对已有的系统发育框架加以整理,是必要且有意义的。
2024年4月19日,来自耶鲁大学生态与演化生物学系的Thomas Near团队,综合了21世纪以来对于辐鳍鱼类的一系列分子系统学研究,在《耶鲁大学皮博迪自然博物馆刊》上发表了一个较为综合与全面的辐鳍鱼类系统发育框架。该系统发育框架仅对于类群之间的关系加以梳理,但并不涉及分类阶元的变动,也避免了一系列的分类学争议。现在基于演化视角的鱼类系统学中文资料比较少,我们将最近发表的这个工作的主要结果以中文的形式呈现,方便研究人员和爱好者的日常参考。由于工作量大时间有限,无法避免有些疏漏,也敬请读者加以指正。
正文图来源原文,对主要现生类群,主要参考伍汉霖等《拉汉世界鱼类系统名典》作了汉语名称标注。为避免争议,标有十字架的化石类群暂不翻译。
英文原标题:Phylogenetic Classification of Living and Fossil Ray-Finned Fishes (Actinopterygii),作者Thomas J. Near & Christine E.Thacker
原文开放下载,doi: https://doi.org/10.3374/014.065.0101,也可联系本推文作者索取。
原文中的树文件也已公开在Dryad:https://datadryad.org/stash/dataset/doi:10.5061/dryad.80gb5mkwp
以下为对原文的整理:
到目前为止已被描述的辐鳍鱼类(Actinopterygii)物种数量已经超过了35085种,是脊椎动物中最多样的类群。最初对辐鳍鱼类多样性的研究集中在基于比较解剖学的形态分类。20世纪60年代,基于已有形态学数据的系统发育成为辐鳍鱼类多样性研究的主流。
然而,形态学也有其局限性,如对有着极高多样性的鲈形目鱼类内部各类群之间的关系,仅仅依赖形态学难以解析。分子系统发育方法的引入提高了系统发育研究的可靠性,也对传统分类框架产生了不小的挑战。但不同辐鳍鱼类类群之间存在着多样性上的差异,使多样性的分布在基于分类阶元等级的分类系统中极不均匀,导致分类等级难以划分。
本文并不考虑分类系统中较高阶元的等级高低,综合了34项系统发育研究,将所有已知的辐鳍鱼类分成了830个单系,其中还包含287个化石类群。同时,本文还为97个类群名称提供了系统发育定义,提出了一个基于过去200年辐鳍鱼类系统学研究的全面分类体系。
正文图2 辐鳍鱼类的主要现生类群之间的系统发育关系。译:罗腾达
正文图3 辐鳍鱼类的主要现生与化石类群之间的系统关系。译:罗腾达
正文图4 多鳍鱼科(Polypteridae)各主要类群的系统发育关系。译:罗腾达
正文图5 鲟形目(Acipenseriformes)以及全骨鱼类(Holostei)主要类群的系统发育关系。译:罗腾达
正文图6 骨舌海鲢总群(Elopomorpha)内部的系统发育关系。包含骨舌鱼、海鲢、北梭鱼、鳗鲡和背棘鱼等类群。译:罗腾达
正文图7 正真骨鱼群(Euteleostei)和骨鲱类为姊妹群关系,包含新真骨鱼类和多个基部类群。这些基部类群包含巨口鱼、胡瓜鱼、南乳鱼、狗鱼、鲑、水珍鱼、鳞南乳鱼等。译:罗腾达
正文图8 骨鲱群(Otocephala)包含物种数量众多的鲤形目、鲇形目、脂鲤目和多个基部类群。这些基部类群包含鲱、黑头鱼、鼠鱚、裸背鱼等。译:罗腾达
正文图9 鲤形目(Cypriniformes)各主要类群的系统发育关系。注意鳅、鲤和双孔鱼、亚口鱼之间的关系没有得到较好解析。译:罗腾达
正文图10 鲇形目(Siluriformes)各主要类群的系统发育关系。译:罗腾达
正文图11 脂鲤目(Characiformes)各主要类群的系统发育关系。译:罗腾达
正文图12 新真骨鱼亚群(Neoteleostei)包含棘鳍类、副棘鳍类、月鱼和包含仙女鱼和辫鱼等的多个基部类群。译:罗腾达
正文图13 副棘鳍类(Paracanthopterygii)中主要包含鳕、海鲂和一些基部物种。译:罗腾达
正文图14 棘鳍类(Acanthopterygii)中的一些主要类群,包含燧鲷、金眼鲷、鼬鳚、蟾鱼、虾虎鱼等一些基部类群和其余一些大目。译:陈景轩
正文图15 鲭形目(Scombriformes)和海龙目(Syngnathiformes)内部的系统关系。译:陈景轩
正文图16 附卵系(Ovalentaria)包含银汉鱼、颌针鱼、鳉、丽鱼、雀鲷、鳚等类群。图展示附卵系内部的系统关系。译:陈景轩
正文图17 合鳃目(Synbranchiformes)和鲹形目(Carangiformes)内部的系统关系。译:陈景轩
正文图18 鲈形目(Perciformes)内部的系统关系。包含鲈、鲉、南极鱼、石斑鱼等类群。译:陈景轩
正文图19 太阳鱼目(Centrarchiformes)、隆头鱼目(Labriformes)、刺尾鱼目(Acanthuriformes)和发光鲷目(Acropomatiformes)的系统关系。译:陈景轩
正文图20 刺尾鱼目(Acanthuriformes)的系统关系。本目下各类群形态差异巨大,包含石首鱼、松鲷、银鲈、笛鲷、刺尾鱼、篮子鱼、赤刀鱼、鮟鱇和鲀等。译:陈景轩
正文图21 鮟鱇亚目(Lophioidei)和鲀亚目(Tetraodontoidei)为刺尾鱼目下的一对姊妹类群,本图展示鮟鱇和鲀内部的系统关系。译:陈景轩
论文信息
论文标题:Phylogenetic Classification of Living and Fossil Ray-Finned Fishes (Actinopterygii)
上线时间:2024年4月19日
发表期刊:Bulletin of the Peabody Museum of Natural History
DOI:https://doi.org/10.3374/014.065.0101
URL:https://bioone.org/journals/bulletin-of-the-peabody-museum-of-natural-history/volume-65/issue-1/014.065.0101/Phylogenetic-Classification-of-Living-and-Fossil-Ray-Finned-Fishes-Actinopterygii/10.3374/014.065.0101.full
作者署名:
Thomas J. Near:Department of Ecology and Evolutionary Biology, Osborn Memorial Labs, Yale University, New Haven CT 06520-8106 USA; and Yale Peabody Museum, Yale University, New Haven CT 06520-8118 USA
Christine E. Thacker:Vertebrate Zoology, Santa Barbara Museum of Natural History, Santa Barbara CA 93105 USA; and Research and Collections, Department of Ichthyology, Natural History Museum of Los Angeles County, Los Angeles CA 90007 USA