可用于检测类器官的PKC活性的荧光生物传感器---Nature Chemical Biology

文摘   2024-10-15 11:56   德国  

欢迎关注类器官前言(沿)进展,第一时间了解类器官领域(生物学、人工智能、材料学、仿生学)的新进展

本文由加利福尼亚大学圣地亚哥分校药理学系的科研人员10月11日在线发表于Nature Chemical Biology志。原文衔接请点击文章最后的阅读原文。知识星球号也提供原文下载。

灵敏的荧光生物传感器揭示 PKC 的差异亚细胞调控

文章创新点

本论文开发和应用了一种高度敏感的荧光生物传感器 ExRai-CKAR2,能够检测到不同亚细胞位置上 PKC(蛋白激酶C) 活性极其细微的变化。主要创新点包括:

  1. 提高的敏感度:ExRai-CKAR2 展现出了极高的敏感度,能够检测到 PKC 活性极其微小的变化——最低可以检测到最大刺激的 0.2%。这种敏感度水平比先前的生物传感器如 ExRai-CKAR1 和 CKAR2 提高了约 5 至 50 倍,证明其甚至能在低剂量 PMA(0.1 ng/ml)条件下检测到活性。

  2. 亚细胞特异性:该论文展示了该生物传感器的多功能性,可以针对特定亚细胞位置(如内质网和溶酶体)进行 PKC 活性检测。这使研究人员能够更精确地绘制出局部化的 PKC 调节图谱。该研究发现了不同 PKC 异构体(如 cPKC 和 nPKC)在这些细胞器上的差异性调控,这是以前未充分研究的领域。

  3. 在复杂系统中检测内源性 PKC 活性:ExRai-CKAR2 使得能够检测到以前难以获取的内源性 aPKC 活性,即使在 3D 类器官培养中,这相较于以前动态范围较低、无法捕捉到 PKC 信号传导动态细节的 FRET 生物传感器来说是一个显著的进步。

  4. 广泛的适用性和动态范围:ExRai-CKAR2 增强的动态范围(约为之前版本的 57 倍)使其适用性更广,能够在生理条件下同时研究微小和显著的 PKC 活性变化。

这些创新使 ExRai-CKAR2 成为探索 PKC 时空调节的强大工具,提供了以往通过敏感度较低的生物传感器无法获取的全新见解。

文章解析

蛋白激酶C(PKC)家族在调节多种细胞过程(如细胞生长、分化和凋亡)中起着至关重要的作用。PKC 家族分为三大亚家族——传统型(cPKC)、新型(nPKC)和非典型(aPKC),每个亚家族通过不同的信号通路激活。异常的 PKC 信号传导与癌症、神经退行性疾病和糖尿病等疾病密切相关,突显了在特定亚细胞位置上对 PKC 进行精确调节的重要性。尽管之前的生物传感器(包括基于弗雷斯特共振能量转移(FRET)的报告分子)提供了对 PKC 活性的一些洞察,但它们缺乏足够的灵敏度来检测细胞内的精细局部化的 PKC 信号传导。

研究结果本论文介绍了 ExRai-CKAR2,一种第二代激发比率型 C 激酶活性报告分子,旨在提供高度敏感且空间特异性的 PKC 活性追踪。该生物传感器的主要结果包括:

  1. 增强的灵敏度:ExRai-CKAR2 能够检测到相当于最大刺激 0.2% 的 PKC 活性变化。与之前的 CKAR2 和 ExRai-CKAR1 等生物传感器相比,ExRai-CKAR2 的动态范围提高了多达 57 倍。

  2. 亚细胞 PKC 调节:通过将 ExRai-CKAR2 定位于特定亚细胞区域(胞质、质膜、内质网(ER)、溶酶体),该研究揭示了不同 PKC 异构体的调控方式。特别地,研究显示:

  • 在 ER 上,钙介导的 PKCα(传统型 PKC)活性持续存在。

  • 溶酶体上则表现出 DAG(甘油二酯)依赖的 PKCδ(新型 PKC)活性。

  • 这些细胞器中的 PKC 调节此前未被广泛研究,因此这些发现具有重要意义。

  • 检测内源性 aPKC 活性:ExRai-CKAR2 能够检测到以前无法获得的 3D 类器官培养中的内源性 aPKC 活性,这是早期生物传感器无法完成的重大成就。


  • 技术方法ExRai-CKAR2 生物传感器的开发该生物传感器基于 cpEGFP(环状排列的增强型绿色荧光蛋白)设计,结合了特异性底物肽。该设计通过 PKC 介导的磷酸化改变荧光强度,实时反馈 PKC 活性。

    • 荧光成像:通过将 ExRai-CKAR2 靶向不同的细胞内位置,研究人员使用荧光成像技术追踪了不同细胞结构中的 PKC 活性。

    • 3D 类器官模型:研究人员将 ExRai-CKAR2 应用于 3D 细胞培养(类器官),展示了其检测内源性 aPKC 活性的能力,这是旧工具难以实现的。

    • 抑制剂研究:研究人员使用 Gö6983(泛 PKC 抑制剂)、Gö6976(cPKC 特异性抑制剂)和 B106(nPKC 特异性抑制剂)来确定不同 PKC 异构体的具体贡献。


    讨论ExRai-CKAR2 的开发为研究人员提供了一种先进的工具,用于研究 PKC 活性,具有前所未有的灵敏度和空间分辨率。该工具揭示了:

    1. 局部调控:不同的 PKC 异构体在不同的亚细胞位置表现出独特的调控动态。例如,钙介导的 PKCα 激活在 ER 上更为显著,而 DAG 介导的 PKCδ 活性则局限于溶酶体。

    2. PKC 功能的新见解:ER 和溶酶体上持续的 PKC 活性揭示了 PKC 在这些细胞器功能中的新角色,超出了其在质膜上已知的活性。

    3. 潜在应用前景:生物传感器在类器官中检测基础 PKC 活性的能力表明,它可以应用于其他复杂的生物系统,深入理解 PKC 在细胞极性形成和癌症转移等过程中的作用。


    研究的局限性

    • 基础活性和磷酸酶效应:一项挑战是基础磷酸酶活性可能会在某些细胞环境中降低传感器的动态范围。虽然使用磷酸酶抑制剂可以缓解这一问题,但它们可能无法完全模拟自然的生理条件。

    • 细胞特异性反应:该研究主要使用了 Cos7 细胞和 3D 类器官模型,但 ExRai-CKAR2 的行为可能因不同的细胞类型而异。需要在更多种类的细胞系统中进行额外验证,以确认这些发现的普遍性。

    • 潜在的空间限制:在亚细胞位置上的传感器响应差异可能源于局部空间限制对传感器性能的影响。虽然这不会影响生物传感器的广泛应用,但可能会限制其在特定紧凑亚细胞区域中的表现。

    该论文将 ExRai-CKAR2 介绍为突破性的工具,克服了早期生物传感器的局限性,提供了对 PKC 活性高度敏感且局部化的检测。该进步为研究 PKC 异构体在各种亚细胞环境中的复杂调控打开了新途径,特别是在细胞极性、器官发生和疾病模型等需要精确时空控制 PKC 的系统中。然而,还需要进一步的研究来探索其在更广泛的细胞类型和生理条件下的表现。

    微信交流群(请扫描群主二维码,经验证后邀请入群,添加时请注明单位姓名等信息)

    星球号二维码

     

    特别提示微信公众号更改推送机制了,不是星标的订阅号,收到推送内容的时间会有延迟,甚至根本无法收到最新推送!快来设为星标吧!方法超简单,只需3秒钟


    类器官前言进展
    类器官及其相关领域最新最新最新的重要研究进展分享,由类器官领域一线科研人员的专业解读!!主题包括与类器官相关的干细胞,AI人工智能,生物物理,生物材料,仿生学,再生医学等等。
     最新文章