据我了解，是经验。是基于微生物学研究中的经验，一代代的实验积累得出的结论，目的就是减少由于长期传代导致的菌种退化或变异，确保研究和生产中使用的菌种具有稳定的遗传特性和生物活性。这篇文章介绍了相关内容，可以阅读一下。
Reference Strains How many passages are too many.pdf
众所周知，传代次数越多变异率越高，并没人说5代以上的菌种就不能使用，而是，越容易出现问题。如果5代以上菌种形态结构、生理生化性状等均未发生变化，还是可以使用的。但，在实验过程中，并不建议过多传代。（难听话，明知不可为而为之，自讨苦吃。）
1代是指将活的培养物接种到微生物生长的新鲜培养基中培养，任何形式的转种均被认为是传代1次。必要时，实验室应对工作菌株的特性和纯度进行确认。
5.菌种如何保藏？
在药典中9203药品微生物实验室质量管理指导原则中的规定如下：建议采用低温冷冻干燥、液氮贮存、超低温冷冻（低于-30℃)等方法保存。低于-70℃或低温冷冻干燥方法可以延长菌种保存时间。标准储备菌株可用于制备每月或每周1次转种的工作菌株。冷冻菌种一旦解冻转种制备工作菌株后，不得重新冷冻和再次使用。也可参照微生物菌种保藏与活化技术指南：收藏必备手册相关内容。
6.实际操作中，如何确认是哪一代菌种？
部分实验室对菌种管理严格，而一部分实验估计乱成一锅粥了。实验的学生或职工一拨又一拨，菌种之间来回穿梭，早就不知道那代菌种，如何鉴定菌种代数？
这种情况本身就经常存在，那我们只能以接受到菌种的那一代作为0代。接到菌种后，简单地进行形态学鉴定和生理生化特性检测菌株活力。如果没有问题的话，这就是F0，母代菌种。但有一点一定清楚，它确实不是药典中规定的0代菌种。（不标准，只供参考。）
7.“传代次数”到底是什么意思？
8.发酵菌种“传代次数”是不是也是5代？
实际生产中，发酵菌种要尽量控制在3代以内，尤其从种子开始。从保藏菌种开始，复苏、转种、扩大培养到生产，不得超过5代。我们针对的也是大多数微生物，而不是所有的微生物。但很多时候，都不是绝对的，没有绝对说超过5代就不能用，没人这么说过。
9.“菌种来源”有没有问题？
保藏机构的菌种有没有问题？会不会私自传代？这些问题不应该在我们的考虑范围内，本就无法估计。大小保藏机构那么多，选购菌种的时候，一定要考虑具体需求和目的。值得注意的是，保藏机构的菌种并不等于生产菌种，所以别指望买到的菌种就是高活性菌种。
10.购买的菌种，用没了，怎么办？再购买？
购买的菌种，保藏后，总有用完的一天，还要继续购买吗？实际应用中，就不可能出现这种情况。还是上面所述，保藏机构的菌种并不等于生产菌种，所以别指望买到的菌种就是高活性菌种。
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