Nature合辑 | 人类细胞图谱倡议迈向首个草图

学术   2024-11-25 23:59   北京  

近日,Nature总结包括7篇Nature在内的39篇文章,介绍人类细胞图谱倡议(Human Cell Atlas (HCA) initiative)的关键进展,并表示已经接近首个草图。

这些文章主要涉及人类发育过程细胞图谱(皮肤、骨骼系统等等)细胞注释、整合(不同数据集的整合,以及与空间组学数据的整合[1]等)搜索(类似BLAST,跨平台/器官/系统/组织搜索类似的细胞[2])工具的开发,以及(类)器官特异的数据集整合来分析发育过程与疾病/衰老机制(注重多组学与空间组学的结合,以及细胞互作)

该合辑2024年11月20日发表在Nature。

另外,Nature将于北京时间2025年1月10日凌晨0点组织网络研讨会,邀请HCA共同主席Genentech的Aviv Regev与Wellcome Sanger Institute的Sarah  Teichmann讨论HCA近来关键进展、新见解与挑战,欢迎注册参与(https://www.workcast.com/register?cpak=6287130254674182)。

Comment(s):

非常厚重的合辑。

HCA倡议相比人类基因组计划(Human Genome Project)总体看起来是比较松散,大部分项目其实还是从科学问题出发;现有的六千多万单细胞数据和HCA中期规划的健康人100亿单细胞数据[3],以及人类体内的37.2万亿单细胞[4]还有不小的距离。

后续或许可以,类似人类基因组计划,在小型的模式生物有个 “预演” ;并侧重更高通量低成本自动化的单细胞技术开发。

合辑链接:

https://www.nature.com/collections/jccbbdahji

参考文献:

[1] T. Liet al., “WebAtlas pipeline for integrated single-cell and spatial transcriptomic data,” Nat. Methods, 2024, doi: 10.1038/s41592-024-02371-x.

[2] G. Heimberg et al., “A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells,” Nature, 2024, doi: 10.1038/s41586-024-08411-y.

[3] A. Regev et al., “The Human Cell Atlas,” Elife, vol. 6, Dec. 2017, doi: 10.7554/eLife.27041.

[4] J. E. Rood et al., “The Human Cell Atlas from a cell census to a unified foundation model,” Nature, pp. 0–1, Nov. 2024, doi: 10.1038/s41586-024-08338-4.

商务合作:mss@pku.edu.cn(要求:1. 过审核;2. 标题明确标注)

CNS导读
关注有广泛深远影响的顶刊工作 Rigorous \x26amp; Elegant Science for Everyone
 最新文章