![]()
范德堡大学医学中心(Vanderbilt
University Medical Center) Ken S. Lau以及Robert J.
Coffey等研究人员基于持续内源表达的sgRNA与Cas9在基因组 “自身位点” 连续引入突变，结合sgRNA位点靶向测序+单细胞转录组，开发新方法-NSC–seq (native single-guide RNA capture and sequencing) 来用于谱系追踪和细胞时序记录，相对之前方法带来更精细和持久的追踪/记录[1]–[3]。
![]()
NSC–seq通过连续引入自身突变来谱系追踪和时序记录[3]。
进一步，充分利用该方法精细持久追踪的特点，研究人员分析发育过程中的谱系动态；并进一步结合自发性结直肠癌小鼠模型( ApcMin/+ mice)和人散发性结肠癌前病变样本来解析癌细胞的起源，支持了部分肿瘤多克隆起源（但是随着癌进展克隆数下降，更多的来自单个克隆）的假说[3]。
![]()
自发性结直肠癌小鼠模型的癌前克隆动态，和人散发性结肠癌前病变样本的克隆组成支持部分肿瘤存在多克隆起源[3]。
该项工作2024年 10月20日发表在Nature[3]。
Comment(s):
看起来挺强大的方法；就是需要引入很多内源barcodes之类序列，过程比较繁琐，并且在某些时候可能会影响功能。
[1] S. D.
Perli, C. H. Cui, and T. K. Lu, “Continuous genetic recording with
self-targeting CRISPR-Cas in human cells.,” Science, vol. 353, no. 6304,
Sep. 2016, doi: 10.1126/science.aag0511.[2] M. M.
Chan et al., “Molecular recording of mammalian embryogenesis.,” Nature,
vol. 570, no. 7759, pp. 77–82, Jun. 2019, doi: 10.1038/s41586-019-1184-5.[3] M.
Islam et al., “Temporal recording of mammalian development and
precancer,” Nature, vol. 634, no. 8036, pp. 1187–1195, 2024, doi:
10.1038/s41586-024-07954-4.https://www.nature.com/articles/s41586-024-07954-4商务合作：mss@pku.edu.cn(要求：1. 过审核；2. 标题明确标注)
