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近日一项发表在Nature的工作主要通过在胰腺癌（Pancreatic
ductal adenocarcinoma (PDAC)；胰管腺癌·）病人样本富集糖基化修饰的蛋白（主要是分泌蛋白和膜蛋白）并用质谱鉴定，结合deconvolution区分来源的细胞类型[1]，进而分析胰腺癌微环境细胞间的互作[2], [3]。
通过这种称为TMEPro的策略，研究人员集中分析了酪氨酸磷酸化（tyrosine
phosphorylation）介导的胰腺癌细胞（pancreatic
cancer cells (PCCs)）细胞与胰腺星形细胞（pancreatic
stellate cells (PSCs)）之间的互作；以及发现了一种基质金属蛋白酶(Matrix
metalloproteinases)介导的AXL受体酪氨酸激酶（AXL
receptor tyrosine kinase）胞外段脱落现象，并利用这种机制在小鼠模型（xenograft
mouse model）实现了药物协同作用抑制胰腺癌[3]。
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TMEPro通过在胰腺癌病人样本用质谱分析糖基化修饰的蛋白来解析细胞间互作[3]。
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基于胰腺癌细胞互作新机制实现药物协同作用[3]。
该项工作的通讯作者是南方科技大学的Ruijun Tian，Salk Institute的Yu Shi，华中科技大学的Renyi Qin以及上海生化与细胞所的Dong Gao等研究人员；2024年11月13日发表在Nature[3]。
研究人员认为该方法可通用分析其它类型的肿瘤，该资源可以帮助人们挖掘胰腺癌诊断和治疗的新策略[3]。
Comment(s):
该方法的一个关键看来是deconvolution，将来结合胰腺癌分细胞类型的蛋白质组数据或许有更好的deconvolution质量。
[1] J.
Peng et al., “Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heterogeneity
and malignant progression in pancreatic
ductal adenocarcinoma.,” Cell Res., vol. 29, no. 9, pp. 725–738, Sep.
2019, doi: 10.1038/s41422-019-0195-y.[2] P.
Huang, W. Gao, C. Fu, and R. Tian, “Functional and Clinical Proteomic
Exploration of Pancreatic Cancer,” Mol. Cell. Proteomics, vol. 22, no.
7, Jul. 2023, doi: 10.1016/j.mcpro.2023.100575.[3] P.
Huang et al., “Clinical functional proteomics of intercellular
signalling in pancreatic cancer,” Nature, 2024, doi:
10.1038/s41586-024-08225-y.https://www.nature.com/articles/s41586-024-08225-y商务合作：mss@pku.edu.cn (要求：1. 过审核；2. 标题明确标注)
