新品发布|一步层析法快速制备高纯度超螺旋质粒

文摘   2024-09-14 17:08   江苏  

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简介

超螺旋质粒DNA (scDNA)是DNA重组技术中常用的载体。载体是指把一个有用的外源基因通过基因工程手段,送进受体细胞中去进行增殖和表达的工具。将某种目标基因片段重组到质粒中,构成重组基因或重组体。然后将这种重组体经微生物学的转化技术,转入受体细胞(如大肠杆菌)中,使重组体中的目标基因在受体菌中得以繁殖或表达,从而改变寄主细胞原有的性状或产生新的物质。
随着mRNA药物,细胞及基因治疗的发展,质粒DNA得到广泛的应用。质粒DNA也可作为核酸药物单独使用,也可以作为在重组病毒载体生产中作为病毒包装的原料。质粒DNA的广泛应用使得GMP级别大规模生产需求急速扩增。

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scDNA的制备

1.大肠杆菌高密度发酵
常用DH5a用改良TB培养基高密度发酵,通过补料及过程控制,通常培养20-24 h,OD600可到150-180左右。
2. 菌体收集
根据发酵液的体积可以选择离心或者0.1-0.2um的切向流过滤膜组件进行菌体收集和清洗。
3. 菌体裂解
离心收集的菌体重悬后的菌液或者切向流过滤膜组件收集的菌液加入0.2M NaOH 1% SDS处理4-10min,注意加入碱后要缓慢搅拌。碱裂解的过程要注意碱的加入方式及接触时间,既要保证菌体充分裂解又要保证裂解后pDNA的收率,避免不可逆损伤的发生而影响回收率。
4. 裂解液中和
   用3M KAc pH5.5 中和裂解液,30min。
5. 裂解液澄清
   中和后的裂解液用离心加深层过滤或者用离心加TFF膜组件进行澄清处理,去除固形物。
6. UF/DF
   澄清后的裂解液用TFF膜组件UF/DF,减少体积并去除部分杂质,减少层析纯化阶段的负荷。根据pDNA的大小选择不同膜孔径的TFF进行UF/DF,通常pDNA是1Kbp 时选择100 KDa 的膜孔径而大于10 Kbp 时选择500 KDa 的膜孔径。

scDNA一步层析法纯化

蓝晓科技Pd oneS填料与质粒 DNA能高效特异性的结合,通过洗杂将 RNA、内毒素和 HCP等物质去除,此外可有效分离开环质粒和超螺旋质粒,提高超螺旋质粒的浓度。质粒 DNA经过 Pd oneS填料纯化后,用异丙醇沉淀法进行沉淀,最后再使用 70%乙醇洗涤和沉淀,能够获得高质量质粒 DNA,可直接用于酶切、PCR、测序、转化等分子生物学实验。Pd oneS填料不仅可以实现一步纯化scDNA,同时还能够有效去除内毒素与其他杂质,操作简便,可充分提高实验效率。


使用 Pd oneS树脂填料纯化不同质粒效果如下图所示。(注:P为质粒 Plasmid简写)

使用 50mL重力柱进行纯化可得到约10~20mg质粒 DNA(不同质粒 DNA收率略有差异),纯化效果良好证明 Pd oneS树脂填料具有良好的放大效应,纯化效果如下图所示


1 装柱

按照重力柱的装填流程操作。依次将下筛板,填料,上筛板装入重力柱管中。

2 平衡

使用 2~5倍柱床体积(CV)的平衡缓冲液平衡柱子,平衡缓冲液:50mM Tris-HCl,0.25M NaCl,10mM EDTA,pH 7.5,务必使流出液的电导和 pH同上样缓冲液的电导和 pH完全一致。

3 上样

(1)样品前处理:使用碱裂解法制备样品,浑浊的样品要离心和过滤后上样。建议 5:1 重悬菌泥(体积质量比),然后加入 0.2M NaOH,1% SDS处理 4-10min,注意加入碱后要缓慢搅拌。碱裂解的过程要注意碱的加入方式及接触时间,避免质粒发生不可逆损伤而影响质粒 DNA的回收率。最后使用 3M醋酸钾pH5.5中和裂解液,静置 30min后,将裂解液离心取上清或者使用膜过滤澄清后上样。

(2)上样:上样样品一般使用现制现用,不建议使用久置样品,影响纯化效果。上样结束后使用 1~2CV的平衡缓冲液进行淋洗。

4 洗杂 :

使用洗杂缓冲液去除RNA、内毒素和 HCP等物质,为了尽量提高样品纯度,建议使用 3~5CV清洗或更高。洗杂缓冲液:50mM Tris-HCl,0.45 M NaCl,10mM EDTA,pH 7.5。

5 洗脱

(1)使用洗脱缓冲液进行洗脱,建议用1~2CV的洗脱缓冲液洗涤,确保质粒 DNA的洗脱效率。洗脱缓冲液:50mM Tris-HCl,1.25M NaCl,10mM EDTA,15%的异丙醇,pH 8.5。

(2)样品后处理:在洗脱液中加入终浓度大于 30%的异丙醇进行沉淀,4℃静置30min后,≥10000g离心 20min,然后去上清(禁止晃动,减小损失),迅速加入 1/4洗脱体积的 70%或无水乙醇洗涤质粒 DNA样品,4℃静置 30min后,≥10000g离心 30min,最后温和的移去上清禁止晃动,避免固体颗粒移除,尽量减小损失),待离心管乙醇完全挥发后使用超纯水或核酸保藏 Buffer进行复溶,保藏备用。

6 原位清洗(CIP)

质粒纯化结束后,首先用超纯水清洗重力柱 3CV,然后使用 0.5M NaOH溶液对重力柱进行原位清洗,使用 2CV的氢氧化钠溶液浸泡 15~30min,或者使用 5CV的氢氧化钠溶液动态清洗。

7 存储

密封保存在 4~30℃(保存溶液为20%乙醇)干燥、通风、清洁处,不可冷冻;用过的重力柱保存在 4~8℃,20%乙醇溶液。

8 运输

运输中避免日晒、雨淋、重压,严禁与有毒、有害物品混运。


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scDNA一步层析法纯化填料订购信息
 
产品牌号货号 包装规格包装规格
Pd  oneSPS10335M2-2 25ml
PS10335M2-3 100ml
PS10335M2-4 500ml
PS10335M2-5 1L
PS10335M2-6 5L
PS10335M2-7 10L

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