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分享团队:
南昌大学第一附属医院邱嘉旋团队
所刊杂志:
Translational Cancer Research(点击查看杂志详情与影响因子)
文章标题:
基于甲基化驱动基因预测口腔鳞状细胞癌患者预后情况(Analysis of methylation‐driven genes for predicting the prognosis of patients with oral squamous cell carcinoma )
内容亮点
本研究从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中获取口腔鳞状细胞癌甲基化数据、RNA-seq数据和临床预后信息。用MethylMix R包分析肿瘤组织和正常组织的差异甲基化状态,获得374个与口腔鳞状细胞癌相关的甲基化驱动基因。利用clusterProfiler R包对上述基因进行功能和通路富集分析。然后通过单因素和多因素Cox回归分析构建了基于4个甲基化驱动基因表达谱的线性预后风险评估模型。最后,通过DNA甲基化和mRNA表达联合生存分析进一步确定与口腔鳞状细胞癌患者预后相关的三个甲基化驱动基因(ZKSCAN7,MFF和ZNF134)。本研究为口腔鳞状细胞癌的早期诊断、靶向治疗和患者预后评估提供新的潜在标志物。(论著中文信息由第一作者整理提供,欲览英文原文请扫描下方二维码)
第一作者:陈俊
陈俊,南昌大学第一临床医学院2021级博士研究生。师从邱嘉旋教授。参加2023中国口腔颌面肿瘤整合医学大会青年医师大赛(青委会专场)并获得优秀报告奖。
通讯作者:邱嘉旋
资讯
排版编辑:袁 舒 AME Publishing Company
j.01.2024.10.02.01
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