降本增效,细胞裂解液RIPA自己配吧!!!

文摘   2024-09-30 06:39   山东  

细胞裂解液,又称细胞破裂液,是一种化学试剂,其主要作用是破坏生物细胞的结构,使得细胞组织中的细胞膜和细胞壁被破裂,细胞内部的生物大分子得以释放出来,通过变性处理使蛋白质稳定,防止其降解,通过抑制蛋白酶活性防止蛋白酶降解蛋白质。这些生物大分子包括DNA、RNA、蛋白质等,是进行分子生物学实验的主要物质。

根据不同的细胞类型和实验要求,裂解液有多种分类。例如,免疫组化中常用的RIPA裂解液,可有效提取膜结合性蛋白;核酸提取中常用的SDS裂解液,可以非常快速地破坏细胞并释放DNA和RNA;细胞质蛋白提取中常用的NP40裂解液,可以轻松地分离胞质和细胞核。

RIPA裂解液Radio Immunoprecipitation Assay buffer简介:RIPA是一种常用于从动物细胞或组织中提取蛋白质的裂解液。它通过去污剂/表面活性剂裂解细胞膜和核膜,以获取细胞和组织中的可溶性蛋白。

RIPA的组分:

去污剂:包括离子型、两性离子型和非离子型去污剂。

缓冲体系:如Tris-HCl,维持pH稳定。

等渗体系:如NaCl,保持细胞内外压力平衡。

变性剂/稳定剂:如EDTA,防止金属离子引起的蛋白质降解。

去污剂分类:

①离子型去污剂:

SDS(十二烷基硫酸钠):强变性,促进蛋白质溶解,破坏蛋白间相互作用。

Sodium deoxycholate:有效破坏蛋白间相互作用。

Sodium N-Dodecanoylsalcosinate:十二烷基肌氨酸钠。

②两性离子型去污剂:

CHAPS:胆酸衍生物。

③非离子型去污剂:

Triton X-100:增加细胞膜通透性,溶解脂质。

NP-40:破坏细胞膜,释放胞浆蛋白,对核膜破坏作用较弱。

DDM(n-Dodecyl-β-D-maltoside):洋地黄皂苷。

Tween家族:如Tween-20。

RIPA裂解液的强度:

强RIPA:含0.1% SDS,1% sodium deoxycholate,1% Triton X-100。

中RIPA:含0.1% SDS,0.5% sodium deoxycholate,1% NP-40。

弱RIPA:含0.25% sodium deoxycholate,1% NP-40。

裂解强度比较:

SDS > Triton X-100 > NP-40

选择RIPA裂解液时,应根据样本类型和下游实验的需求来选择合适的配方。不同的RIPA配方会溶解出不同量和种类的蛋白质,从而影响蛋白图谱的结果。

不同裂解液配方:

裂解液使用调整指南
磷酸化蛋白的考虑:如果目标蛋白是非磷酸化蛋白,可以不添加磷酸酶抑制剂。
免疫沉淀(IP)背景高:如果IP实验背景高,可以选择裂解度高的裂解液,这有助于提高抗原的提取效率,从而减少非特异性结合。

目的蛋白免疫沉淀效果不佳:如果目标蛋白在IP实验中沉淀不下来,可以尝试使用裂解度低的裂解液,这有助于保持蛋白的天然状态,减少蛋白的变性。

核蛋白的提取:当目标蛋白为核蛋白时,应使用强裂解液,因为核蛋白通常与DNA结合得更紧密,需要更强的裂解条件来释放。

注意事项:

①在调整裂解液时,应考虑蛋白的稳定性和裂解液对蛋白活性的影响。

②磷酸酶抑制剂和蛋白酶抑制剂的使用应根据实验的具体需求来确定。

③对于难以裂解的细胞或组织,可能需要使用物理方法(如超声或机械研磨)辅助裂解。

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