全球数字健康观察 | 获得4000万美元A轮融资的Noetik如何用AI多组学重新定义精准疗法
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财经
2024-09-11 09:00
北京
由于近期公众号推送机制改变，欢迎您在公众号首页将Boom Health设为🌟“星标”🌟，第一时间获取数字医疗行业的最新趋势和专家洞见！8月29日，人工智能生物技术研究商Noetik获得4000万美元A轮融资。本轮融资由Polaris Partners和Amy Schulman领投，新投资者Khosla Ventures、Wittington Ventures等参投。本轮资金将用于扩大Noetik基于空间多组学的人类癌症生物学图谱及其高通量体内CRISPR Perturb-Map平台。此外，这笔投资还将使公司能够扩大其多模态癌症基础模型的训练规模。Noetik成立于2022年，总部位于美国旧金山，是一家AI多组学生物技术公司，利用机器学习方法来发现和开发癌症免疫疗法。Noetik将自我监督学习与人类多模态数据的工业规模生成相结合，这使得能够创建细胞和组织生物学的基础模型，从而推动治疗开发，构建一个从患者开始的精准免疫疗法的未来。Noetik的两位联合创始人为AI制药上市公司Recursion Pharmaceuticals前高管。公司创始人兼首席执行官Ron Alfa曾担任 Recursion的研究主管，另一位创始人Jacob Rinaldi此前是Recursion的肿瘤学负责人，还曾在基因泰克从事癌症研究。Noetik的成立旨在解决为患者提供有效新疗法过程中面临的重大挑战：改进靶点发现和生物标志物开发，以提高临床成功的概率。为了解决这些问题，公司建立了一个发现和开发平台，该平台将专为机器学习而构建的人类多模态空间组学数据与大规模多路复用体内CRISPR Perturbation平台（Perturb-Map）相结合。这些数据共同用于训练组织和肿瘤生物学的自监督基础模型，为生物学发现工作提供动力。AI制药领域的很多AI公司专注于设计更好的分子，或者从头设计更好的抗体。而Noetik专注于临床转化并弄清楚哪些患者会从特定药物中受益。Noetik的研究从患者的肿瘤样本开始，这些样本被转化为由软件分析的图像，最终目标是找到新的癌症靶点。Noetik采用的方法与一些药物研究中采取的方法不同。第一代AI药物发现依靠人类告诉AI模型去哪里寻找，称为监督式学习。相比之下，Noetik允许AI技术直接从数据中学习，而无需指示要查看什么或寻找什么，这种方法称为自我监督学习。公司创始人Alfa说：“我们希望这些模型能够拾取模型认为最相关且最具生物学相关性的事物，而人类可能不会想到这些事物”。Noetik的研究人员正在训练模型做一些人类无法做到的事情：以治疗上重要的方式将这些肿瘤分类为肿瘤免疫亚群。为此，他们使用自我监督学习，允许模型自己学习数据的内部表示。最终，他们希望从这些模型中学习肿瘤生物学。Noetik的平台被希望能揭示新的生物学，并在此过程中告知人类应该制造什么药物。Noetik将多模态人体数据图谱与创新的体内功能基因组学平台配对，以推动精准癌症免疫疗法的开发。该平台基于Perturb-map构建，Perturb-map是一项开创性的空间功能基因组学技术，允许在单个实验中对数百个转基因肿瘤克隆进行汇总并行分析。Perturb-map破译了遗传扰动对肿瘤表型的影响。Noetik的平台将以前所未有的体内规模评估遗传变异的影响。公司目前正在肺癌临床前模型中生成>650个突变的初始数据集，包括药理学扰动。![]()
Noetik开发的癌症生物学模型名为Oncology Counterffact Therapeutics Oracle（OCTO），是一个大规模多模态模型，该模型基于1,000个来自非小细胞肺癌患者的肿瘤样本。训练数据包括来自每个样品的多重蛋白质染色、空间基因表达、DNA测序和结构标记物（如H&E）。这些数据在多个尺度和数亿个细胞中捕获复杂的分子驱动因素和肿瘤-免疫相互作用。OCTO具有高度可扩展性和唯一可解释性，因此它能够利用数据和计算来改进其模型，利用OCTO可以建立人类生物学生成模型，与GPT-4o、Sora 和其他大模型具有相同的功能。它具有大规模多模态特性，能将所有类型的病人生物数据纳入一个统一的表示或嵌入空间。它能根据视觉提示输出16通道图像，捕捉肿瘤切片中的蛋白质。选择这种高维、高分辨率的数据类型作为主要输出，有两个原因：首先，它捕捉到了肿瘤和免疫生物学的治疗相关特征，其次，它易于扩展，适用于各种癌症生物学。![]()
公司称，OCTO模型能够做到：从大量多模态数据中模拟患者生物学；提取预测以提出治疗作用；在专有的实验体内系统中测试这些作用；使用临床结果作为进一步学习的输入数据。公司创始人Ron Alfa表示：凭借A轮融资，公司计划扩大该模型，扩展到研究其他类型的癌症，例如肉瘤、卵巢癌和结直肠癌，并在计算能力上投入更多资金。公司还预计将开始建立内部管线。
