专注抗生素抗性基因检测服务——元哉生物

文摘   2024-12-10 08:30   浙江  

合肥元哉生物科技有限公司(简称“元哉生物”)于2019年在安徽巢湖经济开发成立,公司主要从事环境微生物抗生素抗性基因(ARGs)检测、微生物碳氮磷硫功能基因(CNPS)检测、微生物宏基因组测序、微生物16S可变区域测序、耐药菌和有害微生物检测、基于基因编辑等温扩增快速检测等方向。

超高通量qPCR芯片(Wafergen Smartchip)

一张芯片一次性完成5184个纳升级qPCR反应!

高通量qPCR芯片将针对目的基因设计的qPCR引物/探针包装至薄层金属合金微孔芯片得到高通量qPCR芯片,通过超高通量荧光定量PCR系统完成检测,该系统每次能够并行5184个纳升级qPCR反应,可对多个样本进行高通量、高效率、高精确性和高灵敏度的目的基因检测和定量,规避了传统qPCR方法的基因检测单一、费用成本高和效率低等缺点。

特色服务:超高通量qPCR芯片—微生物基因丰度绝对定量检测

基因检测芯片—针对微生物样本


针对微生物群体样本,包括抗生素抗性基因(ARGs)芯片、重金属抗性基因(MRGs)芯片、生物碳氮磷硫(CNPS)功能基芯片等。针对群体样本中的细菌与古菌,以16S rRNA作为内参基因,可以快速对大批量样本的特定研究方向的相关基因进行高效准确的基因定量。

相对丰度计算

以16S rRNA作为内参,参照以下公式进行数据计算:

(1) 相对拷贝数=10^(31-Ct)/(10/3)

(2) 基因相对丰度=基因相对拷贝数/16S rRNA相对拷贝数

(3) 对Ct值数据进行标准化,得到各基因在各样本中的相对丰度信息。

绝对丰度计算

注意:此处是绝对丰度计算,不同于数字PCR的绝对定量检测。

使用16S 扩增的PCR产物构建质粒标准品,使用数字PCR对质粒标准品进行绝对定量或者使用Roche/赛默飞的qPCR仪器进行qPCR检测,制作标准曲线。代入各样品对应的16S rRNA Ct值数据,对各样品的16s rRNA基因进行绝对定量。通过公式:16SrRNA相对丰度/16S rRNA绝对定量=基因相对丰度/基因绝对定量,换算即可获得其他基因的绝对定量信息。

生信分析流程

生信分析结果展示

感兴趣的老师关注元哉生物微信公众号:

联系人:朱经理:15549413644(微信同号)

            程经理:18005609152(微信同号)

元哉生物团队已支持该领域科学家发表SCI论文数百篇,部分高水平论文展示:



关于我们
合肥元哉生物科技有限公司(简称“元哉生物”)成立于2019年4月,位于安徽省合肥巢湖经济开发区,是国家高新技术企业认定,科技部科技型中小企业,安徽省创新型中小企业,合肥市大数据企业,2023年在安徽省股交中心挂牌(614443)。

优势平台

元哉生物搭建有高通量测序平台、高通量基因检测平台、生信分析平台、核酸快检产品开发平台,与众多高校、科研机构、研发企业、医院等建立了深入的合作关系,并推出了手提箱式野外基因检测设备,元哉生物聚焦于有害微生物监测的细分领域。

核心团队

汇聚了生化和分子生物学、生物信息学、实验室工程学领域的研发人员,拥有博士带头的技术团队,核心研发团队多次发表SCI论文,发布抗生素抗性基因检测相关标准,具有从科学发现到技术发明到产品化和产业转化能力。


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