英文标题：SNPs identified by GWAS affect asthma risk through DNA methylation and expression of cis-genes in airway epithelium
发表期刊：European Respiratory Journal
影响因子：16.6
发表时间：2020年4月
研究机构：UPMC匹兹堡儿童医院
本文为短讯，内容较为精炼。通过GWAS鉴定的哮喘相关SNP影响气道上皮基因表达，且多数通过DNA甲基化介导，具体内容如下：
1、研究背景与方法：过去12年，众多GWAS研究哮喘易感基因，但机制不明。本研究假设TAGC Meta分析中的SNP影响气道上皮基因表达，且DNA甲基化介导部分作用，以波多黎各儿童和青少年为研究对象，检测其基因组、DNA甲基化和RNA测序数据。
2、eQTL分析结果：经质控，对869个SNP和471个cis基因进行分析，确定1150个SNP-基因表达关联，涉及418个SNP和55个基因，多数SNP位于基因外，平均距离其配对基因TSS位点232,450bp，且部分SNP位于增强子区域，调控哮喘易感基因表达。
3、与哮喘相关性分析：55个eQTL基因中，24个在特应性哮喘中差异表达，部分已在GWAS中报道，部分为新发现基因；通过中介分析，发现30个额外在特应性哮喘中差异表达的基因，部分已在GWAS中报道，部分为新发现基因。
4、验证分析：在非洲裔美国儿童队列中，对64个差异表达基因中的50个进行验证，发现21个（42%）在特应性哮喘中也差异表达，且方向与EVA-PR研究一致。
5、研究结论：GWAS鉴定的哮喘易感SNP大多与鼻（气道）上皮基因的顺式表达和顺式甲基化有关，多数受影响基因与相应SNP不相邻，多数SNP-基因表达关联由DNA甲基化介导，支持甲基化在气道上皮基因表达中的重要调控作用，且近一半与TAGCSNP相关的基因在特应性哮喘中差异表达。
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