联川生物从2019年开始提供单细胞业务，是全国领先的全方位多生命组学整合者。经过多年发展与积累，在单细胞方面拥有积累了雄厚的生信基础和分析基础，并且我们意识到，单细胞测序的卡点已经突破生信方法的实现，逐渐转变为对结果解读的卡点。因此，联川生物想要成为的是更懂生物的测序服务商，从生物的角度解读生信结果，架起两者的桥梁。
目前我们的10X单细胞转录组报告已经收到了很多客户的好评。为适应生物信息学由从数据分析向以讲解生物学故事为核心转变的革命性变革，联川生物致力于提供远超行业常规标准的生信服务，为不断追求更好的用户体验，以助力客户高分文章的发表，此次我们再次对10X单细胞转录组分析报告进行升级，现正式更新10X单细胞转录组分析报告。
10X单细胞转录组分析报告到底新增了哪些内容呢？一起来看看吧。
对于现在的单细胞测序来说，我们已经对这项技术有了充分的了解，我们的关注点会更集中在细胞数、分群效果、细胞注释等重点信息上，通过对这些信息进行总览我们可以对项目数据有一个初步的了解。所以我们对信息进行了提炼，最重点的信息：分群数量、分群聚类降维图、自动细胞注释（如果有对应的结果），这一页信息基本概括了单细胞测序过程中最核心的数据结果。
对于10x单细胞测序的核心技术指标，我们已经有了充分的积累与探索，所以我们会汇总并展示最核心的数据指标，并进行充分的说明，保证我们对数据最重要的质控点有充分的把握；
Estimated Number of Cells，基于CellRanger的cell calling算法得出的每个样本检测到的细胞数。数据结果会根据实验预计捕获的细胞数有一定的上下浮动，如果细胞质量差或者细胞的形状大小比较特殊，浮动的程度会比较大，但整体来说只要捕获到的细胞质量足够好即可满足分析的需求。
Mean Reads per Cell即平均每细胞reads数，反映了测序量的多少。一般10x Genomics官方认为这个指标需要达到20k reads/cell 才能反映真实的细胞状况，比较好的数据推荐达到30k reads/cell。不过当测序饱和度比较高的时候，不一定需要严格地界定平均reads数的指标。
Median Genes per Cell即基因中位数，指将每个细胞检测到的基因数从高到低排列，得到的中位数。在测序量足够时，这个指标通常反映了细胞的整体质量，如果基因中位数有显著的下降，说明细胞存在明显的死亡、应激等情况，我们的分析流程会对这些低质量细胞进行过滤。基因中位数随样本的情况变化很大，如人的上皮来源细胞系样本通常比免疫细胞样本的基因中位数高2-3倍，而粒细胞等特定类型的细胞基因表达量又会非常的低，要根据细胞类型来做具体的界定。
Sequencing Saturation指测序的饱和度，可以理解为有多少分子被测到了2次及以上。
除此之外，我们还在数据使用建议的流程之后加入了几个模块相关的文献示例，以供客户进行重点参考：
当然，本次更新还保留了诸如PDF报告、文件树等优秀的功能，让我们的新版单细胞测序报告辅助您进一步在科研的浩瀚海洋中遨游！
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