<菌菌有约>科研版第56期
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本期看点
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图1 基于核心基因重建的双歧杆菌属系统发育树
内容要点
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1.基于16S rRNA基因序列相似性分析表明，菌株IMAU50987与Bifidobacterium mellis Bin7N的亲缘关系最近，序列相似性为98.5%，低于新物种划分的阈值；
2.基于88个核心基因的系统发育进化树分析表明，菌株IMAU50987属于B. asteroides类群，与其它双歧杆菌属模式菌株不同；
3.菌株IMAU50987与Bifidobacterium choladohabitans B14384H11和Bifidobacterium apis F753-1的ANI值最高，均为77.0%；与Bifidobacterium apis F753-1和Bifidobacterium xylocopae XV2的dDDH值最高，均为23.1%；与Bifidobacterium polysaccharolyticum W8117的AAI值最高，为73.2%。这些值均低于新物种划分的阈值；
4.菌株IMAU50987是革兰氏染色阳性、不运动、不产生孢子的杆状细胞（0.4-0.6×0.8-1.4 µm），通常单个或成对出现。在35℃严格厌氧条件下培养72 h后，mMRS琼脂上菌落呈圆形、半透明、凸状，直径约1.0 mm。在mMRS培养液中，细胞可在20-42℃（最适35℃）和pH 5-9（最适pH 6）下生长。F6PPK阳性；
5.菌株IMAU50987的主要细胞脂肪酸为C16:0和C18:1ω9c和Sum in Feature 7（C19:1ω7c/C19:1ω6c）；主要极性脂是二磷脂酰甘油（DPG）、磷脂酰乙醇胺（PE）、磷脂（PL）、磷脂酰甘油（PG）、三种未识别的磷酸糖脂（PGL）和五种未识别的糖脂（GL）；细胞壁肽聚糖类型是A3α L-Lys-Gly；
6.菌株IMAU50987基因组草图的DNA G+C含量为63.5%。16S rRNA基因序列登录号为PP390173。全基因组登录号为JBANDZ000000000。
图2 菌株IMAU50987与近缘菌株的ANI、dDDH和AAI值热图
图3 菌株IMAU50987的电镜图（A）和极性脂（B）
小菌君读后感
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