<菌菌有约>科研版第45期
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本期看点
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图1 假小链双歧杆菌系统发育树（右图：去重组区域）
内容要点
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1. 对247株中国、越南、日本等地区人群肠道分离的假小链双歧杆菌进行基因组分析，发现与其他双歧杆菌物种（如双歧杆菌、长双歧杆菌和动物双歧杆菌）相比，假小链双歧杆菌种内具有较高的遗传异质性，系统发育树呈现放射状种群结构。
2. 同一地域个体的假小链双歧杆菌分离株遗传多样性降低，且系统发育树呈现区域聚类性，这表明不同人群肠道中发生了适应性进化。
3. 饮食在塑造肠道菌群的组成和影响本地肠道微生物的进化方面起着至关重要的作用，与越南分离株相比，参与植物源碳水化合物代谢的酶 （如GH13、GH43和GH5）在中国和日本中更普遍。与此同时，同一地域中参与碳水化合物代谢的相关基因遗传变异趋势一致。这一观察结果与越南人口的饮食习惯随着时间的推移发生了显著变化的事实相一致。
4. 中国分离株基因组携带有大量tetW基因，而tetO在越南分离株中更为广泛，这些tet 基因大多分布在基因组岛中。此外，基因组岛数量与基因组大小和CDS之间存在显著的正相关。因此，由基因组岛介导的基因水平移动事件推动了地域间的巨大差异。
图2 假小链双歧杆菌碳水化合物酶相关位点突变率；碳水化合物相关基因的PCA分析
小菌君读后感
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