<菌菌有约>科研版第31期
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本期看点
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内容要点
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1. 利用丝裂霉素C成功从发酵粘液乳杆菌中诱导出噬菌体,纯化后的噬菌体命名为LFP01。根据ICTV的最新分类标准,将噬菌体LFP01归入Caudoviricetes纲;
2. 利用PacBio Sequel II测序平台获得噬菌体LFP01的基因组序列。在组装过程之后,整个噬菌体基因组被排列成一个单一的contig。该噬菌体具有线性双链DNA基因组,全长40562个碱基对,GC含量为46.25%。在其基因组中,有54个编码序列(CDSs),其中50个在正链上,4个在负链上;
3. 噬菌体LFP01与Lafunavirus属成员乳杆菌噬菌体LF1基因组间相似性仅为50.1%,远低于建立新属的70%阈值。且噬菌体LFP01与Lafunavirus属噬菌体之间进化关系较远,证实了LFP01的新颖性。因此,噬菌体LFP01属于Caudoviricetes纲的新属,命名为Lacfervirus属,分类方案已提交至ICTV;
4. 噬菌体LFP01表现出对高温和低pH条件的敏感性,这影响了其生存能力和吸附能力; 细胞壁吸附实验表明,噬菌体LFP01的吸附受体组分可能是细胞壁肽聚糖的一部分。此外,该噬菌体表现出对特定物种的特异性,并表现出狭窄的宿主范围。
图2:发酵粘液乳杆菌噬菌体LFP01基因组图谱
图3:噬菌体LFP01的蛋白共享网络图
小菌君读后感
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供稿:温倩男
审核:九卿臣