益知君 Prosci-Lab | Food Bioscience-新型噬菌体基因组和生物学特性在发酵粘液乳杆菌的诱导下有何特点?

文摘   教育   2024-02-21 11:57   内蒙古  

<菌菌有约>科研版第31期

····

····

····

本期看点

····

····

····

图1:发酵粘液乳杆菌噬菌体LFP01的形态特征
溶原性在乳酸菌中很常见,但关于噬菌体攻击工业上重要的异源发酵乳酸菌(如发酵粘液乳杆菌)的信息鲜少报道。当暴露于特定的外部因素,如过氧化氢、紫外线和丝裂霉素C时,这些噬菌体可以被触发进入裂解周期,对发酵过程和最终产品的质量产生不利影响。因此,探索乳杆菌噬菌体的诱导潜能和特性具有重要意义。近日,内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室在《Food Bioscience》(Q1, IF:5.2)杂志发表题为“Genomic and biological characteristics of a novel phage induced from Limosilactobacillus fermentum”的研究性论文。该研究以基因组中含有两个完整噬菌体的溶原性发酵粘液乳杆菌为对象,旨在诱导不同条件下的噬菌体形成,并分析其全基因组和生物学特性。本研究可以丰富人们对发酵粘液乳杆菌噬菌体的认识,并为噬菌体功能表征的进一步研究提供理论支持。



内容要点

····

····

····


1.  利用丝裂霉素C成功从发酵粘液乳杆菌中诱导出噬菌体,纯化后的噬菌体命名为LFP01。根据ICTV的最新分类标准,将噬菌体LFP01归入Caudoviricetes纲;

2.  利用PacBio Sequel II测序平台获得噬菌体LFP01的基因组序列。在组装过程之后,整个噬菌体基因组被排列成一个单一的contig。该噬菌体具有线性双链DNA基因组,全长40562个碱基对,GC含量为46.25%。在其基因组中,有54个编码序列(CDSs),其中50个在正链上,4个在负链上

3.  噬菌体LFP01与Lafunavirus成员乳杆菌噬菌体LF1基因组间相似性仅为50.1%,远低于建立新属的70%阈值。且噬菌体LFP01与Lafunavirus属噬菌体之间进化关系较远,证实了LFP01的新颖性。因此,噬菌体LFP01属于Caudoviricetes纲的新属,命名为Lacfervirus属,分类方案已提交至ICTV;

4.  噬菌体LFP01表现出对高温和低pH条件的敏感性,这影响了其生存能力和吸附能力 细胞壁吸附实验表明,噬菌体LFP01的吸附受体组分可能是细胞壁肽聚糖的一部分。此外,该噬菌体表现出对特定物种的特异性,并表现出狭窄的宿主范围。

图2:发酵粘液乳杆菌噬菌体LFP01基因组图谱

图3:噬菌体LFP01的蛋白共享网络图


小菌君读后感

····

····

····

发酵剂的噬菌体感染仍然是食品发酵工业的主要威胁。迄今为止,关于发酵粘液乳杆菌噬菌体基因组和生物学特征的信息是缺乏的。由于从自然界中分离噬菌体难度较大,不同的噬菌体采用不同的诱导方法。与宿主乳酸菌属的种类和数量相比,很少有噬菌体被很好地表征。因此,鉴定新的噬菌体对于丰富噬菌体数据库和了解其多样性具有重要意义。

第一作者:温倩男
通讯作者:陈霞教授
原文链接https://authors.elsevier.com/c/1iQGW7t35H-BjS

稿:温倩男 

编辑:孙雅如

审核:九卿臣


菌菌有约
欢迎踏进叁博士益生菌奇幻乐园!这里有耳目一新的科研动态、通俗易懂的科普知识、津津有味的生信方法,更有颜料十足的益生菌产品。我们将带您走进神奇的肠道世界,领略益生菌的奥妙,共同享受这场“益”不可挡的愉悦盛宴!
 最新文章