神了!孟德尔随机化+机器学习也能构建预测模型 | 孟德尔随机化周报(11.17-11.23)

文摘   健康   2024-12-03 17:52   浙江  

孟德尔随机化,Mendelian Randomization,简写为MR,是一种在流行病学领域应用广泛的一 种实验设计方法,利用公开数据库就能轻装上阵写文章,甚至是高质量的论文。


通过PubMed数据库“ Mendelian randomization”检索发现,11.17-11.23共发表65相关主题论文,其中共4医学1区,10篇医学2区文章,部分文章介绍如下。



中国学者:


1.国学者文章介绍(一)

文章题目:对视神经脊髓炎谱系疾病治疗靶点的遗传学见解:一项孟德尔随机化研究
研究目的:视神经脊髓炎谱系疾病 (NMOSD) 是一种严重的中枢神经系统疾病,主要以视神经炎和脊髓炎为特征,可导致视力丧失和肢体麻痹。目前的治疗方案在预防复发和减缓疾病进展的能力方面受到限制,这凸显了迫切需要新的药物靶点来开发更有效的疗法。
研究方法: 本研究的目的是通过孟德尔随机化 (MR) 分析确定与降低 NMOSD 发作或复发风险相关的潜在药物靶点,从而解决现有治疗方法的局限性并为患者提供更好的临床选择。为了确定 NMOSD 的治疗靶点,进行了 MR 分析。顺式表达数量性状位点 (cis-eQTL, exposure) 数据来自 eQTLGen 联盟,其中包括 31,684 个样本量。
研究结果:NMOSD(结果)摘要数据来自两个最大的独立队列:一个队列由 86 个 NMOSD 病例和 460 个来自全基因组测序数据的对照组成,而另一个队列包括 129 个 NMOSD 患者和 784 个对照。我们进行了双样本 MR 分析,以评估单核苷酸多态性 (SNP) 与拷贝数变异与 NMOSD 之间的关联。MR 分析采用逆方差加权 (IVW) 方法,辅以 MR-Egger 、加权中位数、简单模式和加权模式方法。进行敏感性分析以评估水平多效性和异质性的存在。采用共定位分析来测试 NMOSD 风险和基因表达是否由共同的 SNP 驱动。此外,还进行了全表型组关联研究 (PheWAS) 以检测与 NEU1 相关的疾病结局。补充分析包括单核 RNA 测序 (snRNA-seq) 数据分析、蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络和药物可行性评估,以优先考虑潜在的治疗靶点。两个药物靶点 COL4A1 和 NEU1 在两个独立的数据集中显示出显着的 MR 结果。值得注意的是,NEU1 显示出与 NMOSD 共定位的大量证据。此外,除了 NEU1 与 NMOSD 之间的关联外,未观察到基因代理的 NEU1 抑制与其他 NMOSD 相关疾病风险增加之间的其他关联。

结论: 本研究支持靶向 NEU1 进行药物抑制以降低 NMOSD 风险的潜力。需要进一步的临床前研究和药物开发,以验证 NEU1 作为治疗靶点的有效性和安全性,并探索其在 NMOSD 治疗中的潜力。


2.国学者文章介绍(二)

文章题目良性前列腺增生与合并症之间的相关性:整合全球疾病负担和孟德尔随机化研究的系统分析
研究目的: 良性前列腺增生 (BPH) 是老年男性常见的慢性疾病。观察性研究已确定几种与 BPH 相关的合并症。然而,这些研究受到各种混杂因素的限制,并没有清楚地解释 BPH 与其合并症之间的关联。我们使用全球疾病负担 (GBD) 数据库结合孟德尔随机化 (MR) 方法研究了 BPH 与合并症之间的关联。
研究方法: 通过广泛的 PubMed 搜索,我们确定了 22 种与 BPH 相关的疾病,并从 GBD 数据库中选择了 9 种重要的合并症进行详细的相关性分析。我们还考虑了社会经济和环境对 BPH 的影响。利用 GWAS 数据库,我们收集了 BPH 和 20 种合并症的数据,采用连锁不平衡评分回归 (LDSC) 方法来挖掘遗传联系。通过单变量和多变量双向 MR 分析确定因果关系,并辅以 Steiger 方向性检验以确认因果关系。通过采用各种 MR 模型和进行严格的敏感性分析,该研究的完整性得到了加强。GBD 数据与 LDSC 和 MR 结果的综合提供了对 BPH 与合并症关系的细致入微的理解。此外,我们通过表型组范围关联研究 (PheWAS) 、共定位分析和中介 MR 探讨了 BPH 与合并症之间的遗传基础和介导因子的作用。
研究结果:GBD 数据的相关性分析发现,前列腺癌、慢性肾病和抑郁症与 BPH 之间存在关联。LDSC 结果表明,前列腺炎和膀胱癌与 BPH 有关。在双向单变量 MR 中复制了两个关联,将 BPH 与更高的前列腺炎和前列腺癌风险联系起来。进行敏感性分析以确认结果的稳健性,并且所有 Steiger 方向性测试都是正确的。多个多变量 MR 模型验证了这些结果。PheWAS 分析显示,MR 中的异常值不会显著影响 MR 结果。通过共定位分析,确定了 BPH 与前列腺炎和前列腺癌之间的三个共享位点。中介分析发现,在调整 BPH 后,水果食用与较低的前列腺炎风险相关,而早起的人和时间型与较低的前列腺癌风险相关。
结论:本研究揭示了 BPH 与各种合并症之间的关联,强调了 BPH、前列腺炎和前列腺癌之间的因果关系。我们的研究为理解 BPH 的共病关联提供了新的视角。


3.国学者文章介绍(三)

文章题目:阿尔茨海默病的大规模蛋白质组学分析揭示了新的病理生理学见解和潜在的治疗靶点
研究目的:早期阿尔茨海默病 (AD) 的病理生理学演变尚不清楚。
研究方法:我们使用了来自 51,296 名非痴呆中年人的 2923 个 Olink 血浆蛋白的数据。在 15 年的随访期间,发生了 689 例 AD 事件。应用 Cox 比例风险模型来识别不同时间间隔的 AD 相关蛋白。通过与蛋白质类别相关联,蛋白质 z 分数的变化序列可以反映病理生理学演变。使用血液蛋白定量位点数据的孟德尔随机化为潜在的可成药蛋白质提供了因果证据。
研究结果 : 我们鉴定了 48 种 AD 相关蛋白,其中 CEND1、GFAP、NEFL 和 SYT1 是近期的热门化合物 (HR:1.15-1.77;P:9.11 × 10-65-2.78 × 10-6) 和长期 AD 风险 (HR:1.20-1.54;P:2.43 × 10-21-3.95 × 10-6).这四种蛋白在 AD 诊断前 15 年增加并逐渐增加,表明突触和神经元早期和持续功能障碍。与细胞外基质组织、细胞凋亡、先天免疫、凝血和脂质稳态相关的蛋白质表现出早期紊乱,随后出现代谢功能障碍、适应性免疫以及最终突触和神经元丢失。将 CEND1、GFAP、NEFL 和 SYT1 与人口统计学相结合,产生了对 10 年 (AUC = 0.901) 和 10 年以上 AD (AUC = 0.864) 的理想预测,与完整模型相当。孟德尔随机化支持 CEND1、SYT1 和 AD 之间的潜在遗传联系作为结局。
结论:我们的研究结果强调了探索 AD 早期病理生理演变的重要性,这对于早期生物标志物和精准治疗的开发至关重要。


4.国学者文章介绍(四)

文章题目:哮喘与支气管扩张症的相关性:孟德尔随机化分析和观察性研究
研究目的: 既往研究表明,哮喘与支气管扩张症密切相关,然而,哮喘和支气管扩张症之间的因果关系尚未得到深入调查。因此,本研究旨在探讨因果关系并确定介导这两种疾病之间的潜在因素。
研究方法: 所有必要的汇总信息均来自公开可用的全基因组关联研究 (GWAS)。采用双样本孟德尔随机化 (双样本 MR) 来探索哮喘和支气管扩张症之间的因果关系,并使用额外的数据集进行验证。异质性和多效性分析用于验证结果的稳健性。随后,进行中介 MR 分析以确定潜在的中介因素。最后,进行了一项回顾性观察研究以验证研究结果。
研究结果初步逆方差加权 (IVW) 结果表明,哮喘对支气管扩张有因果效应 (比值比 [OR] = 1.228,95% 置信区间 [CI]:1.077-1.400,P = 0.002)。重复验证产生了一致的结果。中介 MR 分析显示,存在鼻息肉 (OR = 1.063,95% CI:1.015-1.113,中介比 = 30.492%,P = 0.009)、急性鼻窦炎 (OR = 1.062,95% CI:1.009-1.118,中介比 = 30.157%,P = 0.018)、慢性鼻窦炎 (OR = 1.085,95% CI:1.024-1.150,中介比 = 40.677%,P = 0.005)和外周嗜酸性粒细胞计数 (OR = 1.013,95% CI:1.000-1.026,中介比 = 6.514%, P = 0.042)是哮喘诱发支气管扩张症发生和发展的重要介质。此外,一项回顾性观察性研究观察到,支气管扩张症哮喘患者的鼻窦炎患病率较高 (5.043% vs 2.971%,P < 0.001)、鼻息肉 (0.536% vs 0.152%,P < 0.001) 和鼻炎 (13.197% vs 1.860%,P < 0.001)。外周血嗜酸性粒细胞的比率 (1.950 (0.500, 5.600) vs 1.500 (0.500, 2.600),P = 0.006) 和计数 (0.125 (0.040, 0.363) vs 0.090 (0.030, 0.160),P < 0.001) 在支气管扩张症哮喘患者中也升高。
结论: MR 分析揭示了哮喘和支气管扩张症之间显着的遗传关联,这部分是由鼻窦炎、鼻息肉和嗜酸性粒细胞介导的。随后的一项回顾性研究提供了进一步的证据,证明支气管扩张症哮喘患者患鼻窦炎、鼻息肉、嗜酸性粒细胞比例升高和嗜酸性粒细胞计数较高。


5.国学者文章介绍(五)

文章题目:肠道菌群、炎症因子和精神行为障碍:一项孟德尔随机化研究
研究目的: 孟德尔随机化方法已成为一种强大的工具,它利用遗传变异作为自然随机实验来最大限度地减少混杂并推断因果关系,具有独特的优势。以前的研究强调了肠道微生物群和炎症因子在精神行为障碍中的关键作用,尽管程度不同。然而,肠道菌群与精神行为障碍之间的确切因果关系仍然难以捉摸,炎症因子在此过程中作为介质的潜在作用尚不清楚。
研究方法:为了研究肠道菌群、炎症因子和精神行为障碍之间的关联,我们汇总了来自大规模全基因组关联研究 (GWAS) 的数据。我们的研究筛选了 27 种疾病,包括精神行为障碍的 9 种亚型:神经发育障碍、进食障碍、睡眠障碍、精神分裂症谱系障碍、压力和创伤相关障碍、情绪和情感障碍、认知和执行功能障碍、人格和躯体化障碍以及成瘾障碍。采用孟德尔随机化 (MR) 评估肠道菌群、炎症因子和这些精神行为障碍之间的因果关系,逆方差加权 (IVW) 作为主要统计方法。此外,我们探讨了炎症因子是否介导肠道菌群与精神行为障碍之间的关系。
研究结果: 在研究了肠道微生物群、炎症因子和精神行为障碍之间错综复杂的相互作用后,我们确定了九个关键的炎症因子,它们错综复杂地调节八种不同疾病亚型的进展。值得注意的是,其中 CC 基序趋化因子配体 28 (CCL28) 和 CC 基序趋化因子配体 25 (CCL25) 水平与注意力缺陷/多动障碍 (ADHD) 的进展相关,白细胞介素 18 (IL-18) 水平与厌食有关,IL-12β 水平与精神分裂症 (SZ) 进展有关,IL-8 水平与躁狂发作有关,IL-10 和单核细胞趋化蛋白-2 (MCP-2) 水平与持久人格改变 (EPC) 密切相关。此外,成纤维细胞生长因子 19 (FGF19) 水平与认知障碍相关,而 C-X-C 基序趋化因子配体 1 (CXCL1) 水平与执行功能有关。
结论:肠道微生物群和精神行为障碍具有因果关系,炎症因子介导从肠道微生物群到这些疾病的途径。


6.国学者文章介绍(六)

文章题目:基于孟德尔随机化和机器学习的三级淋巴结构相关基因特征与 HCC 的遗传关联和预后模型构建
研究目的:三级淋巴结构 (TLS) 在许多癌症类型中形成。然而,它们在肝细胞癌 (HCC) 中的价值和意义尚不清楚。
研究方法:我们基于癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库对 TLS 相关基因 (TLSG) 进行了差异基因表达分析,并使用表达数量性状位点进行了孟德尔随机化 (MR) 分析,然后获取它们的交叉基因。采用最小绝对收缩和选择运算符 (LASSO) 构建基于 TLSG 预后特征 (TLSGPS) 的风险评分,单因素和多因素 COX 回归分析,然后进行生存分析。我们使用国际癌症基因组联盟进行外部验证。我们还基于 TLSGPS 进行了生物学功能、肿瘤突变负荷、免疫浸润、单细胞分析、CeRNA 和药物敏感性分析。
研究结果:确定了 3 个 TLSGs (HM13 、 CSTB 、 CDCA7L ) 来构建 TLSGPS,显示出良好的预测能力,优于大多数预后特征。MR 提示 HM13 (OR = 0.9997, 95 %CI:0.9994-0.9999, P = 0.014) 和 CSTB (OR = 0.9997, 95 %CI:0.9995-0.9999, P = 0.048) 与 HCC 发病风险呈负相关,而 CDCA7L (OR = 1.0004, 1.0001-1.0007, P = 0.0161) 则相反。基于 TLSGPS 的高危组 (HRG) 和低风险组 (LRG) 之间的生物学功能差异涉及细胞增殖、分化和药物代谢。HRG 加高突变的生存率极低。HRG 具有更高的免疫细胞致癌表型丰度、更高的免疫逃逸能力,以及对 Afatinib 、 Dasatinib 和 Gefitinib 的敏感性更高。
结论:机器学习和 MR 鉴定的 3 个 TLSGs 可以预测 HCC 患者的发病、预后和临床治疗,与 HCC 具有显著的遗传相关性。


7.国学者文章介绍(七)

文章题目:动脉粥样硬化多种族研究和鹿特丹研究中新发 2 型糖尿病的血清代谢组学分析
研究目的:本研究旨在调查与新发 2 型糖尿病 (T2DM) 相关的血清代谢组生物标志物,并评价它们在改善 T2DM 风险预测方面的表现。
研究方法:在动脉粥样硬化多种族研究(MESA;n=3460;发现队列)和鹿特丹研究(RS;n=1556;复制队列)中进行了基于非靶向质子核磁共振 (1H NMR) 波谱的代谢组学分析。采用多变量原因特异性危害模型分析 23,571 例血清代谢组学谱变量与新发 T2DM 之间的关联。复制的代谢物需要在 MESA 中具有 FDR 调整的 P<0.01,在 RS 中需要 P<0.05,并且需要一致的关联方向。进行通路和网络分析以阐明 T2DM 发展的生物学机制。根据 Framingham 糖尿病风险评分评估复制代谢物在改善 T2DM 风险预测中的效用。进行了 2 样本孟德尔随机化以评估因果关系。
研究结果: 19 种代谢物与事件 T2DM 显著相关。通路分析显示氨酰基-tRNA 生物合成、支链氨基酸 (BCAA) 代谢、糖酵解/糖异生和甘油脂代谢紊乱。网络分析确定了与上游调节因子的相互作用,包括 p38 MAPK 、 c-JNK 和 mTOR 信号通路。将复制代谢物添加到 Framingham 糖尿病风险评分中显示 MESA 和 RS 的预测性能有中度至中度改善,MESA 的 Δ c 统计量为 0.05 (95% CI,0.04-0.07),RS 的 Δ c 统计量为 0.03 (95% CI,0.01-0.05)。基因性增加的 BCAAs 和甘露糖与 T2DM 相关。
结论:1H NMR 测量的涉及氨酰基-tRNA 生物合成、BCAA 代谢、糖酵解/糖异生和甘油脂代谢的代谢物与发生 T2DM 显著相关,并提供超越传统危险因素的中度至中度预测效用。


8.国学者文章介绍(八)

文章题目:乳腺癌和卵巢癌之间的因果效应:一项双样本孟德尔随机化研究
研究目的: 乳腺癌 (BC) 结局的改善凸显了继发性原发癌 (SPCs) 对幸存者预后的重要性。本研究的目的是调查原发性 BC 与卵巢癌 (OC) 之间的潜在遗传关联,为 BC 手术后 SPC-OC 预防策略的制定奠定基础。
研究方法: 本研究旨在使用双样本孟德尔随机化 (MR) 方法评估 BC 和 OC 之间的联系,该方法完全采用来自公开可用的全基因组关联研究 (GWAS) 的汇总数据。最后,采用遗传风险评分 (GRS) 方法进行二次分析,以进一步验证结果的稳健性。
研究结果: IVW 方法揭示了总体 BC 和 ER + BC 与浆液界性肿瘤之间的遗传相关性,而 ER-BC 与粘液界性肿瘤和高级别浆液性卵巢癌表现出遗传相关性。GRS 方法的结果与主要分析的结果一致,增强了研究的稳健性。
结论: 我们的 MR 研究确定了 BC 和 OC 之间的关联,强调了在临床实践中对有 BC 病史的人提高警惕的重要性。必要时应及时采取干预和治疗措施。


9.国学者文章介绍(九)

文章题目:学龄前年龄特异性肥胖和晚年肾脏健康:孟德尔随机化和共定位研究
研究目的:虽然在以前的研究中已经发现了肥胖与肾脏疾病之间的关联,但学龄前肥胖与晚年肾脏健康之间的关系仍不清楚,这为在这个关键的生命时期进行有效干预带来了挑战。
研究方法: 利用迄今为止最大的全基因组关联研究,我们进行了双样本孟德尔随机化 (MR) 来估计学龄前年龄特异性肥胖与肾脏健康和疾病的关系,包括血尿素氮 (BUN)、eGFRcrea、eGFRcys、慢性肾病 (CKD)、IgA 肾病和糖尿病肾病。然后,我们应用多变量孟德尔随机化 (MVMR) 和逐步 MR 来阐明成人肥胖和其他 12 个潜在因素在学龄前年龄特异性肥胖与肾脏健康之间通路中的作用。最后,我们采用共定位分析,通过检测共同的因果变异来进一步了解学龄前年龄特异性肥胖和肾损伤的机制。
研究结果: 我们的双样本 MR 结果表明,学龄前肥胖可能与肾脏健康和疾病有关。此外,我们观察到年龄特异性体重指数 (BMI) 与 CKD 之间的关联方向发生转变,表现为 3 岁前为负相关,3 岁后为正相关。此外,MVMR 和逐步 MR 结果表明学龄前肥胖与肾脏健康相关的潜在途径,涉及成人 BMI、循环高密度脂蛋白胆固醇水平和循环 C 反应蛋白水平等因素。最后,我们检测到学龄前 BMI 和肾功能可以共享因果变异,例如 2 号染色体区域的 rs76111507、rs62107261、rs77165542 和 18 号染色体区域的 rs571312。
结论: 我们的研究支持学龄前肥胖与肾脏健康之间的关联,强调成人 BMI 在这种关系中的作用。这些发现强调了从儿童早期开始并持续到成年的干预措施的重要性,以降低与肥胖相关的肾损伤的长期风险。


外国学者

1.国学者文章介绍(一)

文章题目:C 肽的遗传学和 1 型糖尿病的诊断年龄
研究内容:在 1 型糖尿病 (T1D) 患者中确定的 C 肽遗传位点和诊断年龄 (AAD) 仅解释了其变异的一小部分。在这里,我们旨在对 T1D 中的 C 肽和 AAD 进行大型宏基因组范围关联研究 (GWAS);并识别与 C 肽和 AAD 相关的 HLA 等位基因/单倍型。
研究方法:7,252 例和 7,923 例欧洲 T1D 个体分别被纳入 C 肽和 AAD GWAS。
研究结果:HLA-DQB1*06:02 对 T1D 具有很强的保护作用,与较高的 C 肽相关。增加 T1D 风险的 HLA-DQB1*03:02、HLADRB1*03:01 和 HLA-A*24:02 与较年轻的 AAD 独立相关。HLA-DR3-DR4 单倍型组合是最强的 T1D 易感因素,与较年轻的 AAD 相关。在 HLA 区域之外,Chr5 (GABRG2) 上的 rs115673528 与 C 肽相关,而 CTSH 内 Chr15 上的插入缺失 rs111970692(一个已知的 T1D 基因座)与 AAD 相关。基因预测的 CTSH 表达、甲基化和蛋白水平与 AAD 相关;孟德尔随机化分析表明,更高水平的 procathepsin H 可降低 AAD。总之,一些与 T1D 相关的 HLA 等位基因/单倍型也有助于 C 肽和 AAD 的变异性。
研究结论:在 HLA 之外,T1D 位点通常与 C 肽或 AAD 无关。CTSH 可能是延缓 1 型糖尿病发展/进展的潜在治疗靶点


2.国学者文章介绍(二)


文章题目:整合全基因组信息和可穿戴设备数据,探索焦虑和抗抑郁药与脉率变异性的联系
研究内容:本研究探讨了长期光电容积脉搏波衍生的脉率变异性 (PRV) 测量与焦虑症的遗传和流行病学相关性。
研究方法:具有全基因组测序、Fitbit 和电子健康记录数据(N = 920;61,333 个数据点)的个体是从 All of Us 研究计划中选出的。在对来自三个主要队列 - 英国生物样本库、FinnGen 和百万退伍军人计划 (N总=364,550 个)
研究结果: PRV 估计为完整 24 小时脉率测量 (SDANN) 中平均 5 分钟脉搏波间隔的标准差。抗抑郁药暴露被定义为在 EHR 中测量 PRV 时有效的抗抑郁药处方。测试焦虑 PRS 和抗抑郁药的使用与每日 SDANN 的相关性。通过单样本孟德尔随机化 (MR) 评估焦虑对 PRV 的潜在因果效应。焦虑 PRS 与 SDANN 降低独立相关 (beta = -0.08;p = 0.003)。在测试的 8 种抗抑郁药物和 4 类抗抑郁药物中,文拉法辛 (beta = -0.12, p = 0.002) 和安非他酮 (beta = -0.071, p = 0.01)、三环类抗抑郁药 (beta = -0.177, p = 0.0008)、选择性 5-羟色胺再摄取抑制剂 (β = -0.069;p = 0.0008) 以及血清素和去甲肾上腺素再摄取抑制剂 (β = -0.16;p = 2×10-6) 与 SDANN 降低相关。单样本 MR 表明焦虑对 SDANN 有负效应 (beta = -2.22,p = 0.03)。
研究结论: 焦虑和抗抑郁药与 PRV 降低独立相关,焦虑似乎对 PRV 降低产生因果效应。这些观察结果提供了对焦虑对 PRV 影响的见解。



3.国学者文章介绍(三)


文章题目:乳腺癌不一致的双胞胎的诊断前血液 DNA 甲基化分析表明环境风险因素的重要性
研究内容: 乳腺癌 (BC) 风险的评估通常依赖于乳房 X 光检查、家族史、生育史和主要突变的基因分型。然而,评估环境因素(如生活方式、健康相关行为或外部暴露)的影响仍然具有挑战性。DNA 甲基化 (DNAm) 捕获遗传和环境影响,提供了一个有希望的机会。以前的研究已经确定了关联并预测了在血液中使用 DNAm 的 BC 风险;然而,这些研究没有区分遗传和环境对这些 DNAm 位点的贡献。
研究方法:在这项研究中,使用配对双胞胎模型评估 DNAm 和 BC 之间的关联,该模型控制共享的遗传和环境影响,允许测试 DNAm 与非共享环境暴露和行为之间的关联。
研究结果: 收集了 32 对 BC 不一致的同卵 (MZ) 和 76 对双卵双胞胎的诊断前血样,平均年龄为 56.0 岁,诊断时的平均年龄为 66.8 岁,截尾为 75.2 岁。我们鉴定了 212 个 CpG (p < 6.4*10-8) 和 15 个与所有对 BC 风险相关的 DMR,使用配对 Cox 比例风险模型。除一种与 CpG 相关的 BC 风险外,所有 BC 风险均被低甲基化,198/212 个 CpG 的 DNAm 与 BC 风险相关,与遗传效应无关。根据以前的文献,至少有 5 个排名靠前的 CpG 与雌激素信号传导有关。在全面的双样本孟德尔随机化分析之后,我们发现有证据支持 DNAm 对 cg20145695 (NXN 的基因体,rs480351) 的双重因果影响,即雌激素受体阳性 BC 的风险增加和雌激素受体阴性 BC 的风险降低。
研究结论: 虽然 DNAm 对 BC 风险的因果效应很少见,但大多数已确定的与 BC 风险相关的 CpG 似乎与遗传效应无关。这表明 DNAm 可以作为 BC 环境风险因素的有价值的生物标志物,并可能作为当前风险评估程序的补充工具提供潜在的好处。



4.国学者文章介绍(四)


文章题目:左心房功能的遗传决定因素与卒中有关
研究内容: 虽然心房颤动 (AF) 是中风的关键危险因素,但最近的研究表明,在没有 AF 的情况下,房性心肌病也可能增加中风风险。本研究旨在评估左心房 (LA) 功能和体积的遗传决定因素以及中风风险。
研究方法: 在英国生物库中的 380 017 名个体中构建并使用了用于 LA 测量的多基因评分 (PGS),入组时没有缺血性中风、全身性动脉栓塞或 AF 病史。使用事件发生时间模型估计缺血性中风的风险,将全因死亡和事故 AF 视为竞争事件。系统性动脉栓塞作为次要终点进行研究。LA 被动排空分数的 PGS 与缺血性卒中的风险相关。

研究结果:与最高四分位数的个体相比,在最低四分位数中具有 LA 被动排空分数 PGS 的个体缺血性卒中的风险比 (HR) 为 1.12 (P=0.004)。这些关联在基线时没有普遍心血管疾病的亚组中是稳健的(最低四分位数与最高四分位数的 HR 为 1.22;P<0.001)。未发现其他 4 个 PGS 与 LA 措施或全身性动脉栓塞风险的关联。在 LA 测量和心源性栓塞性卒中之间进行双样本孟德尔随机化,并表明较高的 LA 功能测量具有保护作用。

研究结论: 当将 AF 视为竞争风险时,LA 被动排空分数的 PGS 与缺血性中风事件显著相关。在孟德尔随机化分析中发现了一致的结果。这些发现表明,心房功能障碍可能影响卒中风险,而与 AF 无关。

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