Nature | “活化” RNA结合小分子,特异降解RNA

学术   科学   2024-10-07 17:44   北京  

靶向降解RNA的小分子有药物潜力,但是很大比例和RNA结合的小分子是“惰性”的,基本不影响RNA功能(1)。

那么如何“活化”这些惰性的RNA结合小分子?

为此,The Scripps Research Institute Matthew D. Disney等研究人员就通过库对库小分子RNA结构互作分析,解析了小分子与RNA的结合模式,分析了 “惰性” 结合的特点,并进一步结合RIBOTACs (ribonuclease targeting chimeras)技术,将能够募集并活化RNA酶的小分子对接到RNA结合小分,从而达到了 “激活” 惰性RNA结合小分子,特异降解RNA的目的(1–3)。

RIBOTACs 与PROTACs技术(2)。

结合RIBOTACs技术“激活”RNA结合小分子(1)。

研究人员初步用此技术降解了疾病相关的前体miRNA(pre-miR-155)以及JUN mRNA 和 MYC mRNA来证明理念(1)。

该项工作2023年5月24日发表在nature(1)。

Comment(s):

这项技术进一步应用的挑战主要在通用特异性。如果换成募集活化E3 ligase的小分子对接RNA结合小分子,来降解核糖核蛋白(ribonucleoprotein,RNP)或有独到发挥空间。

通讯作者简介(4–6):

参考文献:

1.        Y. Tong, Y. Lee, X. Liu, J. L. Childs-Disney, B. M. Suresh, R. I. Benhamou, C. Yang, W. Li, M. G. Costales, H. S. Haniff, S. Sievers, D. Abegg, T. Wegner, T. O. Paulisch, E. Lekah, M. Grefe, G. Crynen, M. Van Meter, T. Wang, Q. M. R. Gibaut, J. L. Cleveland, A. Adibekian, F. Glorius, H. Waldmann, M. D. Disney, Programming inactive RNA-binding small molecules into bioactive degraders. Nature (2023), doi:10.1038/s41586-023-06091-8.

2.        F. Notably, RIBOTACs : Small Molecules Target RNA for Degradation. Cell Chem. Biol. 26, 1047–1049 (2019).

3.        M. G. Costales, Y. Matsumoto, S. P. Velagapudi, M. D. Disney, Small Molecule Targeted Recruitment of a Nuclease to RNA. J Am Chem Soc, 8–11 (2018).

4.        ‪Matthew D. Disney - ‪Google Scholar, (available at https://scholar.google.com/citations?user=sYLAwlMAAAAJ&hl=en).

5.        ‪Frank Glorius - ‪Google Scholar, (available at https://scholar.google.com/citations?user=U5xmC3IAAAAJ&hl=it).

6.        ‪Herbert Waldmann - ‪Google Scholar, (available at https://scholar.google.de/citations?user=zKLmy6MAAAAJ&hl=en).

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06091-8

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