让抗癌CD8+T细胞持久战斗!《Science》:美国圣裘德儿童研究医院基因改造T细胞,使其免于“功能性耗竭”

文摘   2024-10-14 13:45   江苏  



©细胞王国细胞研究院 - 原创出品

作者:陈访达 | 主编:摩西


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你有没有想过,为什么T细胞会在抵抗肿瘤的战役中变得“疲惫不堪”


答案可能藏在表观遗传学的迷宫里。


最近,来自美国圣裘德儿童研究医院的科研团队揭示了3种常见的表观遗传调控因子 -- Dnmt3aTet2 Asxl1 -- 是如何在慢性抗原暴露下影响T细胞的干性及其免疫反应的。


研究发现,缺乏这些因子的CD8 T细胞保持前体耗竭型T细胞Tpex)长达一年之久不引发恶性转化。接下来就让我们看看他们到底是如何实现的吧!


在现实世界中,我们知道如果一块金属在长时间承受重复应力后会逐渐失去弹性最终断裂并失去功能,这种现象叫做“金属疲劳”;人体的免疫系统也存在类似的现象:如果CD8 T细胞长期受到刺激,这会导致它们进入“功能性耗竭”的状态,这是一种细胞的终末命运,常常被认为是限制了T细胞免疫疗法效果的主要原因


具体来说,这种耗竭状态是由多能祖细胞TTpex)逐步转变为终末分化的T细胞Tex)所引起的,而这些Tex细胞免疫检查点抑制ICB疗法通常无反应。目前,科研人员正在研究决定这一分化过程的分子机制,试图通过工程手段阻止T细胞耗竭的发生,从而提升免疫疗法的效果持久性


原来T细胞也会“过劳死”···


为了探索 Dnmt3aTet2Asxl1 这些基因在 T 细胞的发育免疫检查点抑制(ICB)疗法中的作用,研究人员对 T 细胞进行了基因改造,使其携带这些基因的突变。然后,这些突变 T 细胞移植到感染了 LCMV淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒克隆 13 的小鼠体内,以模拟一种 慢性抗原暴露的状态


维持治疗性持久多能 Tpex 群体的核心表观遗传调节因子


在传统的 T 细胞耗竭模型中,T 细胞会因长期抗原刺激而丧失功能,变得“疲惫”。但令人惊讶的是,这些经过基因调控的 T 细胞不仅在慢性抗原环境下维持了活力超过1年,还在 ICB 治疗中表现出良好反应。值得注意的是,即使经历了一年的抗原驱动增殖,这些 T 细胞也并未表现出恶性生长的迹象


进一步分析发现,这些突变 T 细胞中有大量的干细胞样 Tcf1+ T 细胞Tpex 细胞)。这些 Tcf1+ 细胞可以自我更新,并分化为具有强大杀伤能力的效应细胞。这一过程通过命运追踪实验得到了验证:缺乏 Asxl1 的 T 细胞Asxl1 KO T 细胞)展现出了出色的自我更新能力效应细胞生成潜力


Asxl1 KO 干细胞样 CD8 T 细胞可以分化为有效的效应细胞


Asxl1 的研究揭示了它是 PR-DUB 复合物关键调控因子,负责控制组蛋白 H2A 的去泛素化组蛋白 H2A 第 119 位赖氨酸上去泛素化Tpex 细胞耗竭 T 细胞Tex)的转换过程中的一个重要分子检查点


当这种调控机制被引入到肿瘤模型中时,Asxl1 突变 T 细胞表现出对肿瘤微环境诱导的疲惫的抵抗力。更有意义的是,当这些 Asxl1 KO T 细胞抗 PD-L1 阻断剂联合使用时肿瘤控制效果出现了显著增强。这表明,Asxl1 的破坏可以提高免疫检查点疗法的效果


最后,研究人员在临床数据中也发现了类似的现象。在接受 PD-L1 阻断疗法骨髓增生异常综合征MDS患者中,T 细胞中的 Asxl1 破坏患者体内 T 细胞扩增的增加关系密切,这也进一步支持了其在免疫治疗中的潜在应用


Asxl1 表达与小鼠和人类癌症免疫治疗期间的生存率偶联


文章的结尾,让我们通过问答的形式再来回顾一下T细胞表观遗传调控网络如何赋予抗肿瘤免疫持久力的奥秘的吧!


1. 表观遗传限制是如何影响T细胞发育的?

血液细胞中,科学家们发现了一种保守的表观遗传调控网络,专门用于限制细胞的发育潜力。当T细胞应对慢性抗原刺激时,这种表观遗传调控就成为了关键因素,尤其是在干细胞样祖细胞向耗竭T细胞或终末效应T细胞转变的阶段。研究发现,这种转变类似于克隆性造血(CH)过程中观察到的现象 -- 例如造血干细胞的扩展受到DNMT3ATET2ASXL1基因突变的调控


2. CH相关调控史如何影响免疫检查点抑制剂(ICB)疗效的?

通过评估T细胞中的CH相关基因,研究人员发现,Asxl1、Dnmt3a和Tet2的突变显著影响免疫疗法的效果。研究表明,缺乏Asxl1的T细胞不仅能够保持干细胞样状态,还展现出更强的自我更新能力,并在免疫检查点抑制剂(如抗PD-1抗PD-L1)治疗下实现爆发性增殖。这一机制帮助也解释了为何在某些骨髓增生异常综合征(MDS)患者中,ASXL1突变更好的生存预后有关。


3. ASXL1的调控机制如何增强抗肿瘤反应?

传统上,Asxl1被认为与PRC1和PRC2通路密切相关。但研究表明,它还可以通过PR-DUB通路(负责去除H2AK119Ub修饰的复合体)发挥作用。这与之前研究的结果形成了鲜明对比:PRC2缺失往往导致T细胞记忆的形成受损,而Asxl1缺乏则能维持T细胞的多能性,并增强其抗肿瘤活性。这些新发现表明,Asxl1缺失的T细胞在肿瘤微环境中的表现更为优异


4. 表观遗传程序与T细胞干性:一场“时间赛跑”

伪时间分析和RNA速度分析揭示,DNA甲基化调控的阶段可能比Asxl1的作用更早介入T细胞的发育路径。进一步研究发现,DNMT3A可以结合H2AK119Ub修饰位点,并为PR-DUB复合物提供基因底物,从而影响表观遗传调控的层级。这一过程表明DNA甲基化与去甲基化在时间上存在先后顺序影响着T细胞的最终命运


5. ASXL1与长效免疫治疗的未来

研究表明,CH相关表观遗传因子的突变使T细胞在应对高抗原负荷时,能够稳定维持数量不出现异常增生。特别是Asxl1缺陷的T细胞在PR-DUB通路的作用下,能够有效从干细胞样状态向终末效应细胞转变。鉴于此,未来有望通过靶向这些表观遗传因子实现T细胞的可控调控,或将成为开发持久性免疫疗法的重要方向


总的来说,本研究揭示了CH相关表观遗传调控网络在T细胞分化中的核心作用,并为临床上预测ICB疗法的疗效提供了重要的生物标志物基础靶向Asxl1等表观遗传因子的干预手段,不仅有助于延长T细胞的寿命,还能提高其在肿瘤免疫微环境中的抗肿瘤功能。这为构建高效、持久的免疫疗法铺平了道路为癌症患者带来更光明的未来


References

[1]Kang TG, Lan X, Mi T, Chen H, Alli S, Lim SE, Bhatara S, Vasandan AB, Ward G, Bentivegna S, Jang J, Spatz ML, Han JH, Schlotmann BC, Jespersen JS, Derenzo C, Vogel P, Yu J, Baylin S, Jones P, O'Connell C, Grønbæk K, Youngblood B, Zebley CC. Epigenetic regulators of clonal hematopoiesis control CD8 T cell stemness during immunotherapy. Science. 2024 Oct 11;386(6718):eadl4492. doi: 10.1126/science.adl4492. Epub 2024 Oct 11. PMID: 39388542.


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