『BrainNova超脑深维』一站式脑影像数据处理工具 免费内测开放中

文摘   2024-11-06 19:09   上海  

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     为了让脑影像数据处理变得更加用户友好,我们开发了一款新的脑影像数据处理工具『BrainNova超脑深维』。过去很多类似的工具都是在Linux环境下通过命令行操作的,对于非常多的临床科研用户来说是个很大的挑战。我们开发的软件工具基于Windows操作系统,并且不依赖于命令行有完善的图形交互界面旨在简化安装、操作流程,让更多科研用户能够快速上手使用。目前软件还在测试阶段,我们欢迎任何反馈,以便我们继续改进。

     我们旨在尽可能地覆盖更多脑影像模态和更多功能,更好的提升磁共振脑影像科研工作者的工作效率,降低各种技术上的使用门槛。以下是本产品功能的简单介绍。

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功能简介


『BrainNova超脑深维』当前版本为v0.6测试版,具备以下特点:

1)无需通过Linux等复杂的环境windows系统直用

2)无需安装多个不同且复杂的软件工具

3)零代码操作,一键直接生成所需结果

4)可以实现批处理,并行计算效率显著提高

5)当前免费,配合脑影像线上培训课程,可获得技术支持


目前主要已开放的功能均为体素相关分析,包括颅骨剥离、皮层重建、批量皮层重建、配准、形态学指标提取、协变网络(形态学指标一键转换csv文件、一键计算协方差)、个体形态学网络计算(形态学指标一键转换csv文件、一键计算KLD/JSD)等。

01

格式转换(dicom to nifti)


只需要选取DICOM文件所在的文件夹,选择输出文件夹会自动导出结果。极快速度完成格式转化,简单方便实用。


02

配准

采用与ANTs相同的算法,输出高度可靠的处理结果在现有的工具中效率最高且效果最好。


03

颅骨剥离

从MRI图像中快速移除头骨和其他非大脑区域,只保留大脑组织,为后续的脑成像分析提供干净的数据,便于后续操作如大脑疾病分类和分割等。默认处理时间为30-60秒(取决于机器配置等因素)


04

皮层重建(Cortical Reconstruction)

该皮层重建的算法和freesurfer的recon-all过程完全一致,包含30+子流程,所需时间取决于机器配置,和recon-all所需时间一致,通常约数个小时。(视频仅展现操作,中间运算过程已剪辑掉,直接呈现处理结果)

05

批量皮层重建

该批量处理采用并行计算模式,在我们服务器(标准硬件配置,非顶配)上单个被试皮层重建结果需2小时,10个被试批量处理实测仅6小时,节省时间至原来的1/3左右。(视频仅展现操作,中间运算过程已剪辑掉,直接呈现处理结果)

06

形态学指标提取

从皮层重建结果一键提取形态学指标csv格式

07

协变网络

形态学指标一键转换csv文件、一键计算协方差

08

个体形态学网络计算

形态学指标一键转换csv文件、一键计算KLD(KL散度,Kullback-Leibler divergence)/JSD(JS散度,Jensen-Shannon Divergence)


试用方式


目前,本软件工具测试版限量免费开放给脑影像科研专业用户测试,请点击“阅读原文”填写您的信息,之后添加微信(二者均可)获取下载链接


  



硬件要求


  • 目前软件仅支持windows系统,需要windows 10/11以上操作系统

  • 至少为双核处理器(如Intel i5、i7、i9)

  • 内存最低要求为16GB RAM

  • 非系统盘磁盘需预留30G以上空间,以便于软件安装在非系统盘



本软件为免费开放测试,除了通过登记以获取软件的方式外,曾参加过超脑磁共振数据处理课程学习或采购数据处理服务者可直接获取自研软件工具,并直接享有后续更新版本获取。同时,您亦可以通过报名磁共振数据处理网课或者购买超脑工作站以获取上述权益。


超脑工作站配置如下:

费用为¥9999,14英寸轻薄窄边框商务办公笔记本电脑:八代四核八线程i5处理器,16G内存+2T固态硬盘,指纹识别。已预装Windows/Linux双系统,并预装好全部常用磁共振数据处理工具,以及超脑自研软件(后续会对接同步更新)




关于我们



超脑深科介绍




超脑深科是国内领先的脑医学技术创新团队,致力于打造最前沿的产学研一体化创新深脑科技平台。其中影像处理分析团队均来自于国内一线高校,具有高度交叉背景,涵盖生物医学工程、电子信息、临床医学等专业,均受过系统化的科研培训,具有扎实的科研背景。



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