Nature | 单分子结合分子动力学模拟解析相分离聚集体内运动模式

学术   科学   2024-10-08 17:54   北京  

瑞士苏黎世大学(University of Zurich)Benjamin Schuler等研究人员结合单分子光谱技术(single-molecule spectroscopy; single-molecule FRET以及fluorescence correlation spectroscopy (FCS)等全原子分子动力学模拟(large-scale all-atom explicit-solvent molecular dynamics (MD) simulations)研究了粘稠的液液相分离聚集体(condensates)内部分子动态模式[1]。

研究人员用histone H1(net charge +53)和它的伴侣蛋白ProTα(prothymosin-α,net charge −44)组成的聚集体作为模型发现,虽然该聚集体黏度是水的300倍,但是分子层面运动参数溶液相同在纳秒数量级,解释了其内部可以快速化学反应的潜在原理[1]。

液液相分离聚集体在不同尺度的动态[1]

该项工作2023年7月19日发表在nature[1]。

Comment(s):

实验与模拟数据结合得很好。

后续可以结合突变以及更多的液液相分离聚集体模型进一步解析决定condensates内部分子动态模式的机制。

Last Author Info:

https://scholar.google.ch/citations?user=2WPntGMAAAAJ&hl=en

参考文献:

[1] N. Galvanetto et al., “Extreme dynamics in a biomolecular condensate,” Nature, vol. 25, no. February, Jul. 2023, doi: 10.1038/s41586-023-06329-5.

原文链接:

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06329-5

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