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Nature | 傅熙等开发基础模型以研究转录调控的细胞特异性

2025-01-11 21:11 湖北

转录调控在生物过程中扮演着核心角色，但其细胞特异性一直是生物学研究中的重大挑战。2025年1月8日，哥伦比亚大学Raul Rabadan、傅熙，卡内基美隆大学Eric P. ...

BDR 综述 | 单细胞转录组学在植物系统生物学和合成生物学中的应用进展

2025-01-11 18:06 湖北

植物是分层组织的复杂系统，由各种细胞类型组成，单细胞RNA测序（scRNA-seq）已成为在细胞水平上揭示高分辨率基因表达模式和研究细胞类型异质性的强大工具。此外，植物生 ...

Nature Plants | 单细胞转录组测序揭示种子萌发过程中基因表达调控模式

2025-01-11 18:06 湖北

发芽涉及高度动态的转录程序，因为种子的细胞重新激活并表达在环境中建立所必需的功能。单个细胞类型在胚胎中具有不同的作用，因此必须具有细胞类型特异性的基因表达和基因调控网络。通 ...

如何准确预测顺式作用元件？我做坏6次才掌握的方法

2025-01-08 11:21 湖北

顺式作用元件预测：解析与展望顺式作用元件（cis-regulatory elements）是指位于基因启动子区域内的DNA序列，它们通过与转录因子结合来调控基因的表达。随着 ...

【文献速递】玉米基因组中广泛存在远距离顺式调控元件

2025-01-08 11:17 湖北

发表期刊：Nature plants影响因子：18发表时间：2019.12文章简介人类基因组的远距离顺式调控元件（Cis-regulatory elements, CREs ...

Plant Cell | 福建农林大学王凯团队构建禾本科物种高分辨顺式调控元件图谱

2025-01-08 11:17 湖北

2020年5月29日，The Plant Cell在线发表了福建农林大学王凯教授课题组题为Genome-wide Characterization of DNase I-h ...

NAR | 刘毓文/倪建泉团队开发基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法

2025-01-08 11:14 湖北

近年来，基于人工智能（AI）的蛋白质结构预测和蛋白质从头设计为整个生命科学领域带来了巨大变革，今年的诺贝尔化学奖也授予了该领域做出开创性工作的三位科学家。然而，相比于只占基 ...

Nature正刊|麻省理工-哈佛大学博德研究所:基于深度学习的合成顺式调控元件驱动细胞类型特异性基因表达

2025-01-08 11:14 湖北

期刊：Nature原题：Machine-guided design of cell-type-targeting cis-regulatory elements译题：顺式调 ...

[精读] 扬州大学刘鹏老师：<植物顺式调控元件研究进展>

2025-01-08 11:14 湖北

论文题目: 植物顺式调控元件研究进展期刊：浙江农业学报作者：张鑫，刘鹏*作者单位：扬州大学，江苏省作物遗传生理国家重点实验室，植物功能基因组学教育部重点 ...

【NATURE|重大突破】基于深度学习的顺式调控元件的设计与优化

2025-01-07 11:15 湖北

关注“极境赛斯”公众号，获取最新行业资讯、深度文章解析、科研绘图技巧和专业软件信息！研究背景基因表达调控是生命体复杂生物学过程的基础。顺式调控元件（CREs）作为基因上游的 ...

大规模平行报告基因测定：一种分析基因表达调控的新技术

2025-01-07 11:15 湖北

摘要: 大规模平行报告基因测定(massively parallel reporter assay，MPRA)是一种可以同时研究基因组数千个调控元件活性的高通量分析方法。 ...

顺式元件和自然变异介导的转录调控及其在主要作物基因编辑中的应用进展

2025-01-07 10:42 湖北

摘要转录调控对于控制基因表达至关重要。基因的时空表达模式和表达水平都由顺式作用元件和反式作用因子之间的相互作用决定。许多研究都集中在介导转录调控网络的反式作用因子上。然而， ...

PBJ | Tn1a启动子的自然变异调控水稻分蘖

2025-01-07 10:13 湖北

2024年8月27日，中国农业大学农学院李自超团队Plant Biotechnology Journal发表了题为“Natural variation in the Tn1 ...

NAR | 刘毓文/倪建泉团队开发基于人工智能的DNA顺式调控元件设计新方法

2025-01-07 10:13 湖北

近年来，基于人工智能（AI）的蛋白质结构预测和蛋白质从头设计为整个生命科学领域带来了巨大变革，今年的诺贝尔化学奖也授予了该领域做出开创性工作的三位科学家。然而，相比于只占基 ...

Annu Rev Plant Bio | 顺式元件在发育适应和进化的作用

2025-01-06 23:05 湖北

2023年1月，美国佐治亚大学的Alexandre P. Marand等在Annu Rev Plant Biol杂志上发表题为"cis-Regulatory Element ...

Nature | 单细胞分析揭示一个顺式元件导致C4光合作用的起源（代码公开+附审稿意见）

2025-01-06 22:52 湖北

导读：这篇文章以C3水稻和C4高粱为研究对象，利用单细胞（核）转录组技术，绘制了两种植物光形态建成期间不同发育时间阶段，不同发育组织（叶肉和维管束鞘细胞）的转录组和染色质可 ...

论文速递 | 杨志峰院士团队最新研究成果：氧化铈纳米颗粒调节脱落酸及含脱落酸响应顺式元件的基因以提高水稻抗旱性的分子机制

2025-01-06 22:41 湖北

近期，杨志峰院士团队马传鑫教授课题组在Environmental Science & Technology上发表题为“Molecular evidence of C ...

Nature亮点｜陕西师大等揭示全球变暖让水稻质量下降

2025-01-06 17:27 湖北

气候变化带来的炎热夜晚正在降低中国和日本的水稻作物质量。模型表明，如果不控制气候变化，稻米质量将继续下降陕西师范大学的刘宪锋领导的一个团队分析了中国水稻研究所和日本农业部收 ...

PNAS | 时模拟未来全球变暖对水稻物候响应和品质下降的实际影响

2025-01-06 17:27 湖北

文章信息文章标题：Real-time emulation of future global warming reveals realistic impacts on the ...

GRL | 气候变暖导致东亚稻米的质量降低！

2025-01-06 17:27 湖北

👆点击气候观察室 > 点击右上角“···” > 设为星标🌟引言：随着全球气候变化的加剧，粮食安全问题愈发受到关注。稻米作为东亚地区的主要粮食作物，不仅是数亿人 ...