读文献就是学思路!这篇孟德尔随机化文章,看完你能发十篇!福建医科大陈志媛团队1区新作,MR+双疾病分析,选题新才是王道!

文摘   2024-10-20 19:00   上海  
孟德尔随机化(MR)已经盛行一段时间了,第一波人都吃到红利了!
当然,现在入场也并不晚,只是我们需要用到新思路和新方法了。
MR是确认“暴露”与“结果”之间是否存在因果关系的分析工具,那用来探讨“A疾病”与“B疾病”之间是否存在因果关系,即将MR与双疾病分析进行串联,则是目前创新性非常高的思路。后入场的小伙伴,千万不要错过这个方向。
但是我们面临的一个新挑战就是,如何选择两种疾病?两种疾病关系太近了,创新性低(比如一些常见的并发症),太远了,技术上没把握(虽然阴性结果也能发,但影响力偏低)。如何能选择到“不远不近”的双疾病关系?是个关键点!那么,生信路今天给大家推荐一篇文献,赶紧给大家分享,不只是分享一个思路,而是一系列思路。
俗话说,精气神精神是人的魂,会对机体功能有全面影响。那么,精神类疾病是否能影响其它各种疾病了?这不仅是对精神科研究有启发,更多的是提醒各位,将自己所研究的疾病与精神类疾病进行MR分析,确定其关联性,岂不是创新性满满。
如果你更在意文章数量,那XX病与自闭症、与抑郁症、与帕金森等等分别进行分析,你可以列举一大堆出来。所以小途也没有吹牛,这篇文章确实可以衍生出一系列文章了,哈哈
如果你想做高质量研究,那在一篇研究中,将各种精神类疾病打包来分析,那就不是双疾病,而是三疾病、四疾病。。创新性也非常高!大家根据情况,各取所需    
下面,生信路就带小伙伴看看这篇利用MR分析慢性阻塞性肺病 (COPD) 与抑郁症的因果关系。小伙伴可以学习一下。
MR与双疾病串联,是当前非常好的研究思路。除了本文提到的精神系统疾病,其实免疫性疾病、代谢性疾病、循环系统疾病、肿瘤等也都非常适用。小伙伴如果感兴趣,就多多点赞或者留言反馈,生信路会给大家推荐其它相关思路。(ps:生信路这里现在就有几个自我感觉很精彩的双疾病+MR的创新点子,被抢发了也确实可惜,如果对这个思路感兴趣,但暂时没想到好的研究角度,或者数据获取、分析等存在技术限制,欢迎找生信路来拿吧)。


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l题目:评估慢性阻塞性肺疾病与抑郁症之间的因果关系:一项双向孟德尔随机化研究
l杂志:Journal of Affective Disorders
l影响因子:IF=4.9
l发表时间:2024年2月
公众号后台回复“888"领取文献,文献编号:241020
研究背景    
慢性阻塞性肺病(COPD)表现为持续的呼吸道问题,常与抑郁共存。研究显示,COPD患者中抑郁比例为10%-57%,但两者的因果联系直接证据很少。       

 

数据来源
研究思路
本研究采用双样本孟德尔随机化法,遵循三个原则:遗传工具变量(IV)与暴露高度相关(P < 5×10-8,F统计量>10),无暴露与结果间的混杂因素,IV仅通过暴露影响结果。通过MR-Egger回归等五种方法探讨COPD与抑郁的遗传联系。分析运用R软件和TwoSampleMR包,显著性水平P < 0.05。 
    主要结果
1.工具变量选择
筛选与疾病关联紧密的SNP(P<5×10^-8,F>10)。从FinnGenPGCUKB等数据库中选出74个SNP作为初步工具变量,进一步协调数据后,选定的SNP将用于后续的孟德尔随机化分析。
2. 慢性阻塞性肺病对抑郁症的因果关系
IVW分析显示,COPD遗传倾向与抑郁无显著关联。Cochrane Q检验揭示数据异质性显著(P=0.000286),MR-Egger截距未发现COPD定向多效性证据(P=0.226)。(表1)(图1)。
表1 慢性阻塞性肺病与抑郁症之间关系的MR结果    
图1 慢性阻塞性肺病对抑郁症的因果效应
3. 抑郁症与慢性阻塞性肺病的因果关系
反向孟德尔随机化分析显示,高遗传性抑郁倾向可能促进COPD发展。Cochrane Q检验揭示数据异质性(P=0.003),MR-Egger截距未发现显著的定向多效性(P=0.186)(表2)(图2)。
表2 抑郁症与慢性阻塞性肺病之间关系的MR结果
 
图2 抑郁症对慢性阻塞性肺病的因果影响 
4. 补充分析检查抑郁症与慢性阻塞性肺病之间的因果关系
在补充孟德尔随机化分析中,发现了进一步的证据支持这样一种观点,即较高的抑郁症遗传易感性可能是导致COPD发病的一个因素(IVW OR=1.002,CI=1.0003至1.0046,P=0.028)。值得注意的是,Cochrane的Q检验显示这些结果中没有显著的异质性(0.720)。此外,MR-Egger截距表明在凹陷中不存在定向多效性(P = 0.629)(表3)(图3)。
表3 抑郁症与慢性阻塞性肺病之间关系的MR结果
图3 抑郁症对慢性阻塞性肺病的因果效应-补充分析
文章小结
研究利用MR分析,确定COPD不会增加抑郁症的风险,也就是说,本文是一个阴性结果。当然,相比一般的分子机制实验,阴性结果在MR分析中相对常见,也是能被期刊接受的。总之,MR+双疾病,既是兼顾临床和基础的理想思路,同时也是当前MR内卷中的一条极有价值的出路,各位医生朋友不要错过这个点哦。生信路从文献阅读中,想到几个创新性非常高的思路,快来拿吧!需要各种文章思路复现,记得来找我吧!

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