嘿~各位亲爱的朋友们，大家晚上好~今天依旧是文献分享的一天鸭！
咋们先来了解下这本Cell“新贵”子刊，只所以称为“新贵”呢，是因为该刊2020年创刊，2021年便获得接近17分的影响因子，表现非常抢眼！即便最新的影响因子有所下降（也在10分以上），但在学术界依旧广受认可，是相关领域研究人员和学者颇为重视的学术资源。
该刊就是Cell Reports Medicine，基本信息如下：
期刊官方网站：
https://www.cell.com/cell-reports-medicine
期刊投稿网址：
https://www.editorialmanager.com/cr-medicine
分区：JCR Q1、中科院医学1区TOP（大类）、医学：研究与实验1区（小类）、细胞生物学2区（小类）
影响因子：11.7
审稿周期：据官网数据显示，从提交到第一次决定的平均时间为7天；审查后作出决定的平均时间为63天；从提交到正式接受平均在199天；正式接受到发表平均时间为27天，总体来说审稿速度还是可以接受的
版面费：OA出版模式，版面费为5620美元（约合人民币40028元）
是否预警：否
网友评价：
接着言归正传，看今天的文章吧~
文章的主题还是咋们的老朋友——肠道菌群，这次呢，江南大学团队也做的是肠脑轴（肠道菌群和神经炎症），只所以说也，那自然是生信路之前已经分享过不少了，不清楚基本概念的就往前翻合集看看哈，下面我们一起看看，这篇文章是怎么把脑-肠串起来的~
研究进行了多组学（微生物组学、代谢组学和转录组学等多种组学技术）整合分析，为全面理解益生菌如何影响宿主健康提供了系统性的分析方法；不仅在小鼠模型中验证了Bre1025的抗抑郁效果，还在人类受试者中进行了临床试验，增强了研究结果的普适性和临床应用潜力。
大家都知道临床应用价值是提分的关键，方法可能是找靶点的活性成分；亦或是做新剂型（纳米制剂）等；最常见的就是加临床试验了。这篇文章的临床实验就是妥妥的提分金标准，这不就是科研人er想发的文章思路吗？PS：肠道菌群应该算是近几年来比较热的研究方向了，想借此申请国自然或者设计课题的朋友可以扫码联系生信路，更多肠道菌群、肠脑轴研究模式为您奉上！
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题目：双歧杆菌产生吲哚-3-乳酸可通过减少神经炎症发挥有益精神潜力
杂志：Cell Reports Medicine
发表时间：2024年10月
研究背景
全球抑郁症患病率不断上升，需要有效的治疗策略，“精神益生菌（Psychobiotics）”作为一种有前景的解决方案应运而生。然而，由于精神益生菌的作用机制尚不明确，菌株的筛选和开发效率受限，也限制了其在临床及产业中的广泛应用。
研究主要结果
1.双歧杆菌的抗抑郁作用与肠道ILA的调节有关
将小鼠随机分为对照组、CUMS模型组、Bre1025干预组和Bre3M5干预组。行为测试发现，与对照组相比，Bre1025干预组小鼠在开放场测试（OFT）、尾悬挂测试（TST）和强迫游泳测试（FST）中表现出显著改善，表明Bre1025具有抗抑郁样行为的潜力；非靶向代谢组学方法分析显示，Bre1025干预显著改变了小鼠肠道微生物群的代谢物组成，特别是增加了ILA的含量。
相关性分析显示，ILA水平与强迫游泳测试和尾悬挂测试中的不动时间呈显著负相关，暗示ILA可能在调节情绪中起关键作用。此外，Bre1025干预能够显著提高小鼠血清和海马中的ILA水平，这与改善的行为表现相一致。Bre1025与控制菌株Bre3M5相比，在增加ILA水平和改善行为方面表现出显著差异，表明Bre1025具有特定的抗抑郁效果。
2.肠道和血清ILA水平升高归因于补充Bre1025
招募了15名健康志愿者，进行了Bre1025的摄入实验，在摄入Bre1025之前（第0天）、摄入后14天（第14天）以及停止摄入后14天（第28天）收集志愿者的粪便样本。分析发现健康志愿者摄入Bre1025后，该菌株在肠道中迅速积累，并在停止摄入后仍可在近一半志愿者的粪便中被检测到（称为“定植者”）。与摄入前相比，摄入Bre1025后志愿者粪便中的ILA水平显著升高。在停止摄入后，定植者组的ILA水平保持稳定，而在非定植者组中ILA水平显著下降。在存在Bre1025的个体中，粪便中的ILA和IPA水平与Bre1025的丰度呈正相关。Bre1025的摄入并未显著改变健康志愿者肠道微生物群的β-多样性和α-多样性，但促进了与ILA向IPA转化相关的属Lachnospira和Allobaculum的丰度。
在小鼠模型中，不同剂量的Bre1025摄入导致了肠道和血清中ILA/IPA水平的显著剂量依赖性趋势，并且粪便与血清中ILA/IPA水平之间存在正相关性。
3.Aldh是Bre1025中色氨酸依赖性ILA产生的关键基因
通过基因组比对、转录水平检测和基因突变等技术，筛选出了CCFM1025产生ILA的关键基因——芳香族乳酸脱氢酶编码基因（Aromatic lactate dehydrogenase，Aldh）。Aldh基因的功能缺失并不会影响CCFM1025的体外生长或体内定植能力，但会使其丧失调节抑郁小鼠肠-血-脑通路中ILA及下游代谢物的能力，并且无法有效缓解小鼠的焦虑和抑郁样行为。
4.肠道菌群源ILA激活AhR信号通路降低神经炎症缓解神经行为异常
使用ELISA试剂盒测定小鼠血清中的皮质酮水平。通过实时定量PCR（qPCR）分析小鼠海马区域与炎症因子相关的基因表达，使用免疫荧光和免疫组化技术检测小鼠大脑中Iba1的表达，通过Western blot检测小鼠海马区域AhR及其下游靶标CYP1A1的蛋白表达，使用CCK-8评估ILA对神经干细胞（NE-4C）和微胶质细胞（BV-2）在皮质酮诱导的神经炎症模型中的细胞活性影响，分析ILA对NE-4C和BV-2细胞中AhR信号通路的激活情况，以及对炎症因子表达的影响。
结果发现，Aldh+双歧杆菌干预有效减轻了CUMS诱导的血清皮质酮异常升高；抑制了海马区域中促炎细胞因子IL-1β和IL-6的基因过表达，并增强了抗炎细胞因子IL-10的表达；抑制了CUMS诱导的海马CA3区和齿状回微胶质细胞的异常激活。ILA预处理以剂量依赖的方式减轻了皮质酮诱导的NE-4C细胞毒性；ILA干预以剂量依赖的方式激活了AhR信号通路，促进了抗炎细胞因子IL-22的基因表达，并抑制了促炎细胞因子TNF-α和IL-1β的表达。使用AhR抑制剂CH223191可以抑制ILA在NE-4C细胞中激活AhR信号通路，从而抵消ILA对细胞活性的保护和抗炎作用，证实了ILA对神经炎症的缓解需通过AhR信号通路介导。
文章小结
(1)揭示了特定菌株Bre1025通过产生ILA发挥抗抑郁效果，为开发新型精神益生菌提供了科学依据；
(2)鉴定出芳香族乳酸脱氢酶（Aldh）基因是Bre1025产生ILA的关键，这一发现有助于理解益生菌如何通过代谢途径影响宿主的生理和心理健康；
(3)提出了微生物源性ILA通过减轻神经炎症发挥抗抑郁效果的机制，为抑郁症的免疫调节治疗提供了新的靶点。
总的来说，发现双歧杆菌通过Aldh产生ILA，激活海马AhR信号通路，减轻神经炎症，缓解抑郁症，填补了领域研究的空缺。“肠道菌群+神经系统疾病”的研究模式大家直接用起来吧！好了，今天就到这儿吧，最后再提一句，生信路团队不仅文章解读的好，科研做得也出色，干湿结合、临床科研、生信分析，都是行家里手！欢迎各位朋友垂询~
生信路有话说
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