中国人每当过年过节，都少不了要“吃席”，对小朋友们来说，这无疑是一件开心的事，但对许多有“痛风”困扰的人来说，确实一件让人头疼不已的事！“痛风”是一种在男性中比较常见的慢性疾病，是由尿酸水平高引起的“关节炎”。被痛风困扰的人们，通常要克制自己的饮食，比如海鲜、啤酒等食物或饮品，只能看不能吃，真是让人爱也不得，恨也不得啊！
今天要分享的这篇是青岛大学咏勇&李长贵团队发表在Nature子刊的一篇文章，是一项涉及260万人关于痛风的全基因组关联研究（GWAS），其中包括120,295名痛风患者。研究通过优先级方案确定了痛风炎症过程中的候选基因，包括参与表观遗传重塑、细胞渗透压调节和NOD样受体蛋白3（NLRP3）炎症体活性调节的基因。通过孟德尔随机化分析，为不确定潜能的克隆造血在痛风中的作用提供了证据。Ps：这篇Nature子刊含金量实在MAX，不管是研究思路还是数据分析，都是严谨又不失创新性的，并且这项研究确定了适合后续研究的候选基因和分子过程，具有重要的临床意义。如果你也喜欢本篇的研究思路和分析模式，但又苦于不会分析，尽管咨询智星，让智星帮你出谋划策！
l题目：全基因组关联分析揭示了痛风的新致病途径
l杂志：Nature genetics
l影响因子：IF=31.7
l发表时间：2024年10月
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研究背景
痛风是一个重要的公共卫生问题，其患病率和负担不断增加，并因与心脏代谢和肾脏疾病的合并症而加剧。痛风通常表现为极度痛苦的急性炎症性关节炎的复发性自限性发作。它是一种慢性疾病尿酸钠（MSU）晶体沉积主要在关节，发生在高尿酸血症的情况下。炎症基因的遗传变异与痛风有关，但没有一个被广泛复制。本研究提出迄今为止最大的痛风GWAS的研究结果，优先考虑先前未确定的痛风炎症过程候选途径。
研究思路
研究内容
1、痛风基因座、遗传风险预测及基因精细定位
在祖先特异性和跨祖先分析中，痛风与377个基因位点相关，代表410个独立的信号（图1）。
图1
在去除UKB队列后，使用效应量从欧洲血统队列中应用痛风多基因风险评分（PRS）。UKB的参与者根据他们的PRS值分为十组，痛风患病率从0.0%增加到22.6%（图2）。
图2
2、痛风遗传控制与尿酸的关系
尿酸盐是痛风的病因，这两种特征有共同的生物学途径。作者使用LDSC来研究欧洲痛风GWAS与UKB 934个性状之间的遗传相关性，目的是确定以前未在准确的GWAS数据中发现的相关性（图3）。
图3
3、候选基因、组织和途径
富集分析使用1764个独特基因与候选因果错义变异相关，共定位GTEx eQTL、肾脏eQTL和MAGMA基因。观察到104个途径的富集，包括尿酸代谢过程（基因本体（GO）），染色质组织和染色质修饰酶（Reactome）和II型糖尿病（KEGG）（图4）。
图4
4、痛风相关的炎症机制
为了优先考虑可能参与痛风炎症反应 的基因，作者制定了一套标准，将其应用于所有已鉴定的GWAS位点边界内的5358个独特的基因以及边界外的顺式eQTL和反式eQTL基因。58个位点的108个基因被优先排序（图5）。
图5
文章小结
一项优先方案确定了痛风炎症过程中的候选基因，包括参与表观遗传重塑、细胞渗透压和NOD样受体蛋白3 （NLRP3）炎症小体活性调节的基因。孟德尔随机化分析为克隆造血在痛风中不确定电位的因果作用提供了证据。本研究确定了痛风炎症发病机制中的候选基因和分子过程，为后续研究提供理论基础。这么赞的文章，还不点个收藏，细细品味？另外智星也可以像该研究一样，提供全方位的生信分析，为你的SCI之路保驾护航！面面俱到，只等你来~
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