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今天智星为大家带来的这篇，是由广州医科大学附属脑科医院精神科研究团队发表于“BMC Medicine”的IF 7.0分文章，该研究是关于抑郁症（DEP）和体重指数（BMI）之间的共享遗传结构，作者基于全基因组关联研究（GWAS）数据，通过双向孟德尔随机化（MR）分析探索了DEP和BMI之间的因果关联。
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l题目：剖析抑郁症和身体肥胖指数之间的共同基因结构
l杂志：BMC Medicine
l影响因子：IF=7.0
l发表时间：2024年10月
请前往文末获取文献DOI哦~
研究背景
抑郁症（DEP）是一种普遍和严重的神经精神疾病，其特征是高度复杂的遗传和表型特征，其终生患病率估计约为15%至20%。肥胖是现代社会另一个普遍存在的健康问题，已被认为是包括DEP在内的各种神经精神疾病的独立危险因素。越来越多的证据支持抑郁症（DEP）和肥胖之间的共病，但这种关联背后的遗传机制仍不清楚。因此本研究探讨了DEP与BMI的共同遗传结构和因果关系。
研究方法
本研究基于全基因组关联研究（GWAS），采用双变量因果混合模型和连锁不平衡评分回归（LDSC）分析了DEP （N > 130万）与BMI （N = 806834）之间的多基因重叠和遗传相关性。通过双向孟德尔随机化（MR）探讨因果关系。通过跨性状荟萃分析确定了常见的风险位点。分层LDSC和多标记基因注释分析应用于研究跨组织类型、细胞类型和功能类别的单核苷酸多态性富集。最后，通过基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR）方法探索了抑郁症和肥胖症患者的共同功能基因，并进一步检测了抑郁症和肥胖症患者脑组织中的差异表达基因（DEG）。
本研究统计分析概述如下：
图1
研究结果
研究发现DEP与BMI呈正相关，且在局部基因组区域更为明显。跨性状荟萃分析确定了16个共享基因位点，其中5个是新发现的，它们在同一方向上对两种疾病都有影响。MR分析显示DEP和BMI之间存在双向因果关系，在两个方向上都有相当的效应值。结合基因表达信息，发现DEP与BMI的遗传相关性在6个脑区富集，主要集中在伏隔核和前扣带皮层。此外，还发现6种特定的细胞类型和23种功能基因对整个大脑区域的DEP和BMI都有影响。其中，NEGR1被认为是最重要的功能基因，与DEP和BMI在全基因组显著水平上相关。与健康对照组相比，抑郁和肥胖个体的脑组织中NEGR1基因的表达水平显著降低。
1、DEP和BMI有共同的遗传倾向如图2所示。
图2
2、孟德尔随机化
图3结果一致地表明DEP和BMI之间存在双向因果关系，并且在两个方向上估计的效应大小相当。
图3
3、分割遗传相关
与DEP相关的SNP在29个功能类别中富集了7个，而与BMI相关的SNP在17个功能类别中富集，并且都以灵长类动物的保守区域为主（图4）。
图4
4、组织水平SNP遗传力富集
作者使用公开的GWAS数据和来自GTEx的13个不同脑区，通过LDSCSEG评估DEP和BMI遗传能力的组织水平富集。共有12个脑组织被发现在DEP的背景下显着富集（图5）。
图5
文章小结
在本研究中，作者利用大规模表型GWAS和组织/细胞型特异性表达数据，对DEP和 BMI之间的遗传相关性进行了全面的分析。研究结果表明，DEP和 BMI之间存在显著的正遗传相关性，特别是在特定的局部基因组区域。MR分析进一步提示DEP与BMI之间存在双向因果关系。推测功能基因NEGR1可能与DEP和肥胖之间的共病有关。研究为DEP和BMI的共同遗传发病机制提供了新的见解，有助于开发治疗抑郁症和肥胖症合并症的治疗靶点。看到这里我们是不是感觉这篇文章使用的工具可以为我们所用呢？那我们举一反三进行复现，一篇7分+SCI不久手到擒来了吗？还在等什么，赶紧联系智星，匹配适合你的方案吧！
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