9种“机器学习”斩获《Lancet》大子刊！昆明医科大团队最新作，这样的预后模型可以0实验搞定顶刊，简单到出乎意料！

文摘 2024-11-05 19:01 上海

“人工智能”（AI）一直是B格满满的话题，在斩获了24年诺贝尔物理学和化学双奖后，更是一飞冲天了！

在医学领域，AI的常见形式就是机器学习（ML）和深度学习（DL）。

其中，影像组学相对更多使用深度学习，而机器学习则在临床模型和生信挖掘中频频出场。而且，特别的是，机器学习用在临床模型中，可谓是门槛最低，方法最简单，却高分频出（相比于ML在生信数据挖掘，生信路也不知道原因，可能是基础生信更卷吧。。。）

是不是临床模型中，方法更简单，分数还更高？生信路给大家介绍一篇范文。

本文是由云南省肿瘤医院（昆明医科大学第三附属医院）团队的一篇多中心研究，借助9种机器学习方法，用于乳头状甲状腺癌（PTC）患者的远处转移（DM）早期预测，最终实现9.6分的eClinicalMedicine顶刊。

PS:机器学习已经是生信人的必备技能了，如果你还不会利用机器学习来发文章，那可就痛失1个亿。不论是基础数据，还是临床数据；不论是公共数据，还是自有数据，都可以进行ML分析。如果您有意向，那就抓紧来联系生信路复现吧，超多个性化的课题思路助您早日发文！

定制生信分析

云服务器租赁

加微信备注99领取使用

题目：预测甲状腺乳头状癌远处转移风险的可解释机器学习模型的开发与验证:多中心研究

期刊：eClinicalMedicine

影响因子：9.6

发表时间：2024年11月

公众号后台回复“888"领取文献，文献编号：241105

研究背景

甲状腺癌转移患者生存率下降，亟需新模型预测其转移风险。作者旨在开发可解释的机器学习模型，以多中心数据早期预警PTC患者的转移风险。

数据来源和研究思路

在2013至2023年间，作者收集了PTC患者的入院数据。使用云南省癌症医院的1430例数据进行模型训练和内部验证，以及昆明医科大学第一附属医院的434例数据进行外部测试。通过随机森林等九种机器学习方法构建模型，并用AUC等指标评估其预测能力。最后，使用SHAP方法对特征的重要性进行了排序，以解释模型。

主要结果

1.临床特征和数据处理

本研究从电子病历中提取了2013至2023年患者的详细信息，包括个人基础数据、TNM分期、实验室结果和术后病理报告。数据涵盖了年龄、性别、BMI、肿瘤分期、病理特征及多项血液指标。此外，还分析了炎症标志物和甲状腺功能相关指标，所有数据均源自客观医疗记录，用于预测模型的构建。

2.选择变量、模型开发和验证

本研究采用递归特征消除(RFE)技术筛选关键变量，优化模型预测力和稳定性。通过10轮10倍交叉验证，确保了模型的鲁棒性和泛化力。

作者运用多种机器学习模型，逻辑回归模型、决策树模型、随机林模型、K近邻模型、支持向量机模型、天真贝叶斯模型、极端梯度升幅模型、随机梯度升幅模型、神经网络模型等方法，预测甲状腺癌患者远传转移的风险。通过10轮10倍交叉验证，结合网格搜索，确定了最优特征和超参数，优化了模型性能（这么多种机器学习，对硬件设备要求较高，个人电脑很难满足需求。生信路给大家准备了高速度、高储存的云服务器，常用的R包都已安装。如担心不会使用服务器，生信路提供免费的7天一对一的指导服务，小伙伴们可以滴滴生信路了解。）。

3.模型性能比较

评估模型可靠性采用多种指标，如AUC、敏感性、特异性等。霍斯默-莱姆斯检验衡量预测概率与实际一致性，对数损失评估预测准确性。校准曲线和德龙检验验证模型间差异，决策曲线分析(DCA)评价模型净效益，最终选出最优模型。

文章小结

总之，本研究基于作者收集的患者数据，利用机器学习方法构建甲状腺癌患者远传转移的风险模型，同时进行了模型验证。通篇阅读，小伙伴们有没有什么新的收获呢？看了生信路分享的这么多期的生信文章，有没有觉得数据挖掘是真的香，再有机器学习的助力，可以帮助我们0实验0成本收获一篇SCI。那么感兴趣的小伙伴就快快找生信路来复现吧！

生信路有话说

生信路还提供思路设计、定制生信分析、文献思路复现；有需要的小伙伴欢迎直接扫码咨询生信路，竭诚为您的科研助力！

定制生信分析

思路评估

服务器租赁

2.孟德尔随机化正值“当打之年”！疾病亚型分析，创新思路大进阶！首都医科大学团队一招斩获7分+！快快码住~

3.玩转NHANES数据库，TOP团队有妙招！北京大学团队10.5分横断面研究，生信小白也可轻松复现，赶紧码住！

4.高福院士主编的“国产”第一神刊《Science Bulletin》拳打PNAS，脚踢Nature、Science？真实水平如何？

http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzk0MDQ2MTU0Mg==&mid=2247499756&idx=1&sn=c19684ff0d66b23180ac037217edc9e7

生信路

小途持续给大家分享最新生信热点思路，提供专业生信分析服务：思路设计、生信分析、文献复现、数据库搭建等。助力您的科研之路！

药学“神刊”！这篇5分+SCI，最快3周接收，无版面费，国人占比9成~不容错过！

“水刊之王”Nature Communications真有“排面”！中南大学团队挖掘UKB数据库，超25万人数据，再夺C位！

药食同源化合物就这么华丽的登上了Nat Commun！重庆医科大郭风劲团队这篇做的是非肿瘤细胞衰老方向，好思路学起来！

出息了，我的宝！国内数据库CHARLS勇夺58.7分《Nature》子刊，，且数据代码公开，赶紧来学！

从实验台到租服务器：师弟的生信逆袭之路

不愧能狂中81项国自然！选的都是TOP热点呀！复旦华山医院巧用国自然热点，纯测序解锁一区7分+！这波新热点抢发期，不容错过~

老师，别让你的得力干将维护生信服务器了

20天光速接收4.8分！宁波大学团队这是“卷”麻了！两篇的体量合到一篇发？！双疾病、孟德尔随机化和机器学习，这都还不够？

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

告别水文，做真科研！小小“葛根”成“药食同源”新突破！上海交大团队Nature重磅，能赶超“GLP-1”吗？

肠道菌群又登上Cell“新贵”子刊！江南大学陈卫院士团队这次做的“脑肠轴”是肠道菌群和神经炎症，“多组学”整合分析思路值得细品！

9种“机器学习”斩获《Lancet》大子刊！昆明医科大团队最新作，这样的预后模型可以0实验搞定顶刊，简单到出乎意料！

样本量爆棚？分析深度加码？选对服务器，省心科研无忧！

机器学习不愧“高分收割机”！复旦大学冯建峰团队新作，UKB数据库+预后模型，代码也公开了，临床人做这个准没错！

大人！时代变了！IF 11.8，中医药工业4.0时代！网药新方向，中药质控大变革，人工智能与生物信息的碰撞！

又是“国家杰青”，又是“深度学习”的！复旦大学这篇新作亮点满满！神导+神刊，生信人都要来追一追！

从实验台到租服务器：师弟的生信逆袭之路

3分的研究，直升到21.7分顶刊，“机器学习”挑战极限！预后模型研究，错过了多少篇顶刊了！

IF21.7，机器学习开挂了！传统分析模型OUT，新风险分层模型IN！2024年顶刊带你玩转数据分析，临床想发高分看这篇就够了！

在“杰青”手里，“转录组”都能玩到Cell顶刊！北京大学杜鹏团队力作，单细胞+表观，“测序”不等于没技术！

IF=11.4网药干湿结合完美范例！机器学习强大助攻，中国药科大&无锡人民医院团队登顶1区Top，2个多月发文，中医药果真牛掰！

严格保真！几乎不拒稿的2区纯生信友好“神刊”+乳酸化修饰，川大华西团队1个月搞定！机器学习+单细胞，专为无法做实验的你！

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

快！NHANES数据库这么好用，又刚更新！8.5分文章38天接收！中医科学院团队，0实验，数据还公开，分析小白快来复现！

IF 31.7/ 子刊，饮食习惯并不是造成痛风的主要原因！青岛大学团队权威研究：遗传才是痛风的罪魁祸首！

9种机器学习模型飞上《Lancet》大子刊！东南大学团队最新成果，ML结合MIMIC数据库，简直是太赞了！

IF 31.7/ 子刊，饮食习惯并不是造成痛风的主要原因！青岛大学团队权威研究：遗传才是痛风的罪魁祸首！

沾边就收的医学1区TOP刊！审稿快，无版面费！华南理工团队“101种机器学习算法+药物筛选”，一发一个准！

样本量爆棚？分析深度加码？选对服务器，省心科研无忧！

亮瞎审稿人双眼！8种“研究热点”整合，发12分都嫌低！江南大学这篇新作太全面了！MR/NHANES/网药。。。标题都放不下

山东中医药大学到底有谁在啊？！本科生2个月发IF 12.5 SCI，居然只做了MR！复现性很强，值得一看！

我要向全世界安利“GBD数据库”，又登《Lancet》子刊！电子科大团队9.6分新作，0实验超高性价比，赶紧来get！

IF 45.5，不愧是顶刊Cell!樊荣教授团队开发新技术，结合单细胞测序，这篇简直是空间转录组天花板！

堪称“中医药”的天花板！清华大学团队：网络药理学+分子对接+干湿结合，中药复方要这么做！

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

31.7分神刊，还卷啥实验！孟德尔随机化的突破口来了！260万的队列数据，震惊全场！这波潮流我跟定了！

从实验台到租服务器：师弟的生信逆袭之路

9种机器学习模型斩获《Lancet》大子刊！东南大学团队结合MIMIC数据库，0实验搞定顶刊，简直是太赞了！

样本量爆棚？分析深度加码？选对服务器，省心科研无忧！

突发！这本水刊之王被踢出SCI了，赶紧撤稿！

低调的一区Top，行业翘楚，无版面费，国人发文近五成！机器学习+新药筛选，创新思路2个月就接收！

这泼天的富贵还是轮到网络毒理学了！西交大附属医院团队发大招：网毒+机器学习联手拿Q1，这波热度一定得蹭上！

单基因分析out了？NoNoNo！文章/标书双赢！安徽医科大这波亮眼操作：机器学习+公共数据挖掘，换个疾病又是一篇~

哦买噶！孟德尔随机化分析这个思路真是太猛了，广州医科大附属医院：一套操作猛如虎，IF 7分SCI拿到手！速来学！

读文献就是学思路！这篇孟德尔随机化文章，看完你能发十篇！福建医科大陈志媛团队1区新作，MR+双疾病分析，选题新才是王道！

IF 27.7！TCGA+GTEx老树开花，纯生信轻松卷上Mol Cancer！不是实验做不起，而是纯生信更有性价比！

“灌水”神刊，影响因子6连涨！生信发文必备！恭喜扬州大学团队凭借“乳酸化”，3个月拿下！

从实验台到租服务器：师弟的生信逆袭之路

Cell旗下“灌水”神刊偷偷升1区！纯生信友好，想发要趁早！升区后质量大提升，这篇双疾病+单细胞+NHANES，就挺经典！

分类

时事

民生

政务

教育

文化

科技

财富

体娱

健康

情感

旅行

百科

职场

楼市

企业

乐活

学术

汽车

时尚

创业

美食

幽默

美体

文摘

原创标签

时事社会财经军事教育体育科技汽车科学房产搞笑综艺明星音乐动漫游戏时尚健康旅游美食生活摄影宠物职场育儿情感小说曲艺文化历史三农文学娱乐电影视频图片新闻宗教电视剧纪录片广告创意壁纸头像心灵鸡汤星座命理教育培训艺术文化金融财经健康医疗美妆时尚餐饮美食母婴育儿社会新闻工业农业时事政治星座占卜幽默笑话独立短篇连载作品文化历史科技互联网

发布位置

广东北京山东江苏河南浙江山西福建河北上海四川陕西湖南安徽湖北内蒙古江西云南广西甘肃辽宁黑龙江贵州新疆重庆吉林天津海南青海宁夏西藏香港澳门台湾美国加拿大澳大利亚日本新加坡英国西班牙新西兰韩国泰国法国德国意大利缅甸菲律宾马来西亚越南荷兰柬埔寨俄罗斯巴西智利卢森堡芬兰瑞典比利时瑞士土耳其斐济挪威朝鲜尼日利亚阿根廷匈牙利爱尔兰印度老挝葡萄牙乌克兰印度尼西亚哈萨克斯坦塔吉克斯坦希腊南非蒙古奥地利肯尼亚加纳丹麦津巴布韦埃及坦桑尼亚捷克阿联酋安哥拉

​9种“机器学习”斩获《Lancet》大子刊！昆明医科大团队最新作，这样的预后模型可以0实验搞定顶刊，简单到出乎意料！

9种“机器学习”斩获《Lancet》大子刊！昆明医科大团队最新作，这样的预后模型可以0实验搞定顶刊，简单到出乎意料！