黄傲、周俭教授团队绘制肿瘤单细胞异质性景观,揭示肿瘤抗转移靶点

学术   2024-10-30 18:06   北京  


【CMT&CHTV 医学前沿·临床经典】


导语:近期,Molecular Cancer杂志上发表的一项突破性研究,通过单细胞RNA测序技术和空间转录组分析,揭示了肝癌中三种主要的肿瘤细胞亚型,以及其与成纤维细胞之间的相互作用,增进了对肝癌肿瘤细胞内在特性的理解,还为阻碍肝癌转移提供了新的潜在治疗靶点。


8月2日,复旦大学附属中山医院黄傲、周俭教授团队在Molecular Cancer上发表了题为“Single-cell tumor heterogeneity landscape of hepatocellular carcinoma: unraveling the pro-metastatic subtype and its interaction loop with fibroblasts”的文章。研究人员通过整合52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组数据,建立了HCC恶性细胞的异质性景观。深入探索肝癌细胞的异质性,识别具有高转移潜力的肝癌细胞亚型,并揭示这些细胞亚型与肿瘤微环境中成纤维细胞的相互作用机制。希望能够为肝癌的精准治疗提供新的靶点和策略,进而改善患者的预后。



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研究背景


肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,其发病率和死亡率均居高不下。HCC的分子机制复杂,不同患者之间、甚至同一患者不同肿瘤区域之间的肿瘤细胞存在显著的异质性。这种肿瘤异质性是导致治疗抵抗、疾病进展和预后不佳的关键因素。


单细胞RNA测序技术(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)的快速发展,为深入理解肿瘤细胞的异质性提供了新的工具。通过在单细胞水平上解析肿瘤细胞的分子特征,揭示不同肿瘤细胞亚群之间的差异,但目前对于HCC在单细胞水平上的异质性研究仍然有限。此外,肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)在肿瘤的发生、发展和转移中扮演着重要角色。成纤维细胞作为TME中的关键细胞成分,与肿瘤细胞之间的相互作用对肿瘤的进展和转移具有重要影响。然而,目前对于HCC中肿瘤细胞与成纤维细胞相互作用的分子机制仍知之甚少。


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研究设计


本研究通过整合分析52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组数据,建立了肝癌恶性细胞的异质性图谱。研究团队应用多种方法对HCC肿瘤细胞的亚型进行了探究,分析了不同亚型肿瘤细胞的功能特征、转录因子、临床意义以及与微环境的关联。此外,研究还分析了肿瘤细胞亚型与成纤维细胞的相互作用。研究共纳入了92 411个细胞,包括来自52个HCC样本的35 981个肿瘤细胞。


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研究结果


结果表明,肝癌肿瘤细胞可以被分为三种亚型:ARG1+代谢亚型(Metab-subtype)、TOP2A+增殖表型(Prol-phenotype)和S100A6+促转移亚型(EMT-subtype)。这三种亚型分别表现出代谢、增殖和上皮-间质转化(EMT)的不同特征。轨迹分析显示,Metab-subtype和EMT-subtype均起源于Prol-phenotype。进一步的转录因子分析发现,EMT-subtype细胞中SMAD3和TGF-β信号通路被特异性激活(图1)。此外,研究还发现了肿瘤细胞和成纤维细胞之间通过SPP1-CD44和CCN2/TGF-β-TGFBR1相互作用,促进了肿瘤细胞向EMT-subtype的转化和肿瘤的转移。


图1 HCC的单细胞异质性景观


进一步的功能性分析揭示了这三个亚型在生物学过程中的独特模式(图2A)。Metab-subtype在代谢过程中显著富集,特别是与胆汁酸代谢和外源性代谢相关的途径。Prol-phenotype亚型则在细胞周期和增殖相关途径中表现出高度活性,而EMT-subtype亚型则在细胞趋化和迁移过程中显著富集,并且与EMT和缺氧过程密切相关(图2B)。


图2 三种HCC肿瘤细胞亚型的功能特征和进化过程


轨迹分析显示,Metab-subtype和EMT-subtype均起源于Prol-phenotype(图2C),揭示了肿瘤细胞异质性的进化关系,为理解肝癌进展提供了新的视角。


研究发现以EMT-subtype细胞为主的肝癌(EMT-HCC)预后不佳,且其肿瘤微环境呈现出“沙漠化”特征,即免疫细胞浸润较少(图3)。此外,EMT-subtype细胞还表现出干细胞特性的显著上调,这与其高度转移潜力相一致。


图3 三种亚型的组成


肿瘤细胞与成纤维细胞的相互作用:研究揭示了EMT-subtype细胞与成纤维细胞之间的相互作用。EMT-subtype细胞通过分泌SPP1,特异性地招募并激活成纤维细胞,使其转变为FAP+成纤维细胞(图4)。这一过程中,FAP+成纤维细胞通过分泌CCN2,进一步激活TGF-β-SMAD信号通路,促进肿瘤细胞向EMT-subtype的转化。


图4 EMT-HCC中成纤维细胞的活化


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总结讨论


本研究通过单细胞水平的深入分析,揭示了肝癌细胞异质性的新图谱,并识别出S100A6+肿瘤细胞亚型在肝癌转移中的重要作用。此外,研究还发现了肿瘤细胞与成纤维细胞之间的相互作用,为肝癌的抗转移治疗提供了新的潜在靶点。这些发现不仅增进了我们对肝癌肿瘤细胞内在特性的理解,也为开发普遍的干预策略提供了新的方向。通过解析肿瘤细胞和成纤维细胞之间的复杂反馈回路,本研究为阻碍HCC转移提供了新的潜在治疗靶点。


参考文献

GUO DZ, ZHANG X, ZHANG S Q, Et al. Single-cell tumor heterogeneity landscape of hepatocellular carcinoma: unraveling the pro-metastatic subtype and its interaction loop with fibroblasts[J]. Mol Cancer. 2024; 23(1): 157. Published 2024 Aug 2. DOI:10.1186/s12943-024-02062-3.


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编辑:赤芍
二审:梨九
三审:清扬
排版:半夏
封面图源:Pexels

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