不要自我怀疑了！找对了方向，孟德尔随机化还能发高分！上交团队21+Nature子刊，两步孟德尔随机化分析，真是秀到起飞！
文摘
科学
2024-07-06 19:00
上海
号外号外！！Nature高分子刊火热登场！！孟德尔随机化是不是被卷怕了？是不是还有点怀疑自己捏？千万别气馁，一切有可能！小途带你解读高分大子刊，中介分析+孟德尔随机化，轻轻松松帮你找回自信，咱们也要发高分！今天小途分享的文章是“Mendelian randomization evidence for the causal effect of mental well-being on healthy aging”，由上海交通大学医学院附属瑞金医院团队带来的21.4分新作。本研究利用两步孟德尔随机化分析方法评估心理健康对健康衰老的因果效应，并探索社会经济地位的潜在影响。为理解心理健康与健康衰老之间的关系提供了新的遗传学证据。这篇文章结构清晰，思路新颖，采用多种统计学方法进行分析。所应用大批量数据使得文章结果更有说服力。1.文章采用了两步孟德尔随机化分析方法，包括单变量孟德尔随机化和多变量孟德尔随机化来推断变量之间的潜在因果关系，减少了混杂因素和逆向因果关系的影响，使得结果更具稳健性和实用性。2.研究采用了大规模的GWAS数据，这些数据来源于UKB、EBI等公共数据库和研究项目，增强了研究的可信度和科学性。3.研究结果揭示了心理健康幸福感与健康衰老的多个方面之间存在正向的因果关联。强调了心理健康在促进健康衰老中的重要性，为制定公共卫生政策和干预措施提供了科学依据。 （学习这篇文章的研究思路和方法，还有很多同类型数据资源等待着同学们挖掘！如果自己规划很费劲的话，小途可以帮帮你哦~）PS：有小伙伴会担心，想做孟德尔随机化分析，没有足够的运算资源怎么办？Don’t worry！这不是还有小途嘛！来找多啦A途，服务器、工具资源样样全！）l题目：心理健康对健康衰老的因果效应：一项基于孟德尔随机化的研究证据l杂志：Nature Human Behaviour公众号后台回复“888"领取文献，文献编号240706心理健康与多种生活方式行为和疾病相关，是情感、心理和社会幸福感的体现，也是健康衰老的基础。但心理健康是以何种模式影响健康衰老，以及其潜在中介途径和因果关系尚未明确。
本研究中的心理健康特征（包括生活满意度、积极影响、神经质和抑郁症状的幸福谱系）的全基因组关联研究（GWAS）数据来自欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）数据库，衰老表型的GWAS数据来自英国生物银行（UKB）以及多个研究项目。社会经济指标数据来自UKB以及社会科学遗传协会联盟 (SSGAC)。
本文通过两个步MR（Two-step MR）进行分析。首先评估心理健康特征与衰老表型之间的因果关系，使用单变量（UVMR）和多变量MR（MVMR）确定因果关系是否独立于社会经济地位(SES)。其次筛选生活方式因素等相关特征和疾病在幸福谱系与aging - GIP的关联中的候选中介，使用2SMR量化中介效应。以了解衰老表型的根本原因和影响因素。 在心理健康的四个维度中，生活满意度和积极情绪表现出正相关，而神经质和抑郁症状与这些衰老表型表现出负相关（图1）。 图1 UVMR分析结果：估计心理健康和衰老表型之间的因果关系在UVMR分析中，基于幸福谱系及其四个维度所评估的心理健康状态发现，更高的遗传所决定的家庭收入、教育成就以及职业成就与更高的心理健康水平具有因果关系（图2a）。在MVMR分析中，即便调整了收入、教育和职业的影响，幸福谱系仍然与更高的aging-GIP显示出独立关联（见图2b）。图2 UVMR和MVMR分析结果：估计调整社会经济指标之后的心理健康和衰老表型之间的因果关系经过中介因素选择过程，一共筛选出了33个幸福谱系与aging-GIP之间关联的中介因素，福谱系对各中介因素的影响于下图显示（图3）。 图3 幸福谱系与aging - GIP之间因果关系的中介因素选择过程在MVMR分析结果中发现，遗传决定的不健康生活方式、行为和表现以及身体功能与较低的aging-GIP相关联。对aging-GIP影响最大的疾病是心力衰竭。5.心理健康幸福谱系与遗传独立衰老表型之间的中介因素根据Two-step MR分析结果发现。在生活方式因素中、行为表现和身体功能中，降压药物、看电视时间和开始吸烟年龄各自在幸福谱系对aging-GIP的总效应中起到了超过5%的中介作用。在疾病因素中，心力衰竭、注意力缺陷多动障碍和中风等各自在总效应中起到了超过5%的中介作用（图4）。 图4 各中介因素在幸福感谱与aging - GIP因果关系中的作用
本研究通过两步MR研究揭示了独立于SES的心理健康对衰老表型的因果影响，并描述了多方面的中介途径。该研究结果强调了心理健康在促进健康衰老中的核心作用，为制定相关公共卫生政策和干预措施提供了重要指导。想不到吧~公共数据的海洋里还蕴含着无数宝藏等着我们挖掘。看了这篇文章所使用的孟德尔随机化研究思路，小伙伴们内心是都已经燃起熊熊斗志了呢！滴滴小途带你飞！小途还提供思路设计、定制生信分析、文献思路复现；有需要的小伙伴欢迎直接扫码咨询小途，竭诚为您的科研助力！
