十投九中+纯生信友好=神刊！复旦肿瘤医院李大卫团队2区6分模板文，单细胞数据挖掘+乳酸化修饰，科研人错过血亏！

文摘 2024-10-27 18:00 上海

今天胡哥提到的这个期刊，可真是压箱底的内容了，完成了我无数次的KPI。

毕竟，又要接收纯生信（至少是大部分生信内容），分数还要过得去，两者都兼具，备选项可不多。那就请出鼎鼎大名的“神刊”--Journal of Translational Medicine!!

网络上关于该期刊的资料不少，胡哥就不再来贴数据了，简单总结：

分高（中科院2区6.1分）、事少（纯生信友好）、接收快（最快1个月）、容易投（50%接收率）。除了3790美刀的版面费稍贵点外（话说，现在OA期刊逐渐成主流，版面费这事，很多时候横竖都是一刀），几乎没有缺点。

为了和期刊相配，胡哥今天也特意找了一篇“乳酸化修饰”主题的文章，毕竟这个主题也是当红炸子鸡了。

2019年Nature提出“乳酸化修饰”，迅速成为表观遗传学的关键调节机制，相关论文数量逐年翻倍。现在也正是研究这一领域的黄金时期，发展快而关注度尚未饱和（预计今年约300篇）（想商讨“乳酸化修饰”具体的实施思路和方法，就可以直接联系胡哥哦！）

最后，回到胡哥给大家找的这篇模板文，由复旦肿瘤医院李大卫团队发表，文章以“乳酸化“为出发点，结合公共数据库中的单细胞数据，对单个细胞进行乳酸化评分，并构建预后模型。可谓生信挖掘的标准方法：

1.单细胞数据挖掘：单细胞是当前的热门研究方法，但是测序成本较高。作者利用GEO和TCGA中的结直肠癌的单细胞测序数据，进行数据挖掘，节省了大量时间和经费成本。

2.以组蛋白乳酸化修饰的角度，来探讨结直肠癌的发病和治疗机制：乳酸化是如今新出现的机制，在多种疾病中都属于研究空白，这也算是填补了部分研究空白。

PS：各位小伙伴，Journal of Translational Medicine作为难得的高分且纯生信友好期刊，再结合这么香“乳酸化修饰”思路，还能做纯生信数据挖掘，不信你不心动。对于各位急需积累科研基础的人，胡哥随时在线静候你的到来，丰富多样的生信服务、课题设计已准备就绪。

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题目：一个多维的方法来解开乳酸化相关的特征的复杂性在结肠直肠癌的预后和治疗见解

杂志：Journal of Translational Medicine

影响因子：IF=6.1

发表时间：2024年2月

研究背景

结直肠癌（CRC）的早期诊断和治疗能显著提升患者生存率。乳酸化作为一种新兴的蛋白质修饰方式，与癌症相关研究进展迅速，但在CRC领域研究尚浅。深入研究乳酸化在CRC中的作用对揭示其生物学意义和临床应用至关重要。

研究思路

作者通过分析CRC样本，发现乳酸化水平升高与肿瘤发展相关，是预后独立因素。利用单细胞数据，筛选出乳酸化相关基因（LRGs），构建风险模型，有效预测CRC预后。进一步探讨了LRGs与临床特征、突变、生物学功能、免疫浸润、治疗反应和药物敏感性的关系。体外实验证实了核心基因的作用，为CRC治疗提供了新靶点。

研究结果

1.结直肠癌中整体乳酸化水平上调并与肿瘤进展相关

图2 总体乳酸化水平在结直肠癌中上调，并与肿瘤进展相关

2.从单细胞转录组中鉴定 CRC 中的乳酰化相关基因 (LRG)

图3 从单细胞转录组中鉴定 CRC 中的乳酰化相关基因 (LRG)

3.新LRG特征揭示对结直肠癌预后的强大预测能力

图4 新LRG特征揭示对结直肠癌预后的强大预测能力

4.LRG特征对免疫治疗的预测价值

图5 LRG特征对免疫治疗的预测价值

5.结合LRG评分和临床参数的列线图进行精确预测

图6 结合LRG评分和临床参数的列线图进行精确预测

文章小结

本研究首次探讨了乳酸化对 CRC 临床预后的显著影响，在单细胞水平上筛选出乳酸化修饰相关基因，用于发病机制和预后模型构建。PS：所以，各位小伙伴，纯生信友好期刊Journal of Translational Medicine+乳酸化热点，这么一对搭档所向披靡。除了用于硕博毕业外，“乳酸化修饰”作为肿瘤“代谢重编程”的热门分支，做一篇这样主题的文章或数据挖掘分析，也能很好的用于国自然申报，一举多得。对于各位急需积累科研基础的人，如果您对缺乏可行的思路和技术，胡哥随时在线静候你的到来，丰富多样的生信服务、课题设计已准备就绪，让你轻松复现高分文章！

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