孟德尔随机化加持,川大华西医院再造10分+新作!一篇兼具创新选题和高临床价值的生信研究,思路设计好,发文无烦恼!

文摘   2024-10-28 18:00   陕西  

大家好,欢迎来到生信狐!一篇有价值的研究才能受到国/省自然科学基金项目的支持,这就不仅仅要求创新选题了,更要求有临床应用价值!今天,胡哥分享一篇博士后项目研究,该研究借助孟德尔随机化(MR)分析,再加上实验验证,探讨了维生素B12VB12 )在急性胰腺炎中的作用,一起看看文章亮点吧~

1. 该研究首次评估了VB12 与急性胰腺炎风险之间的因果关系,并提供证据表明VB12  在治疗急性胰腺炎中的预防和治疗潜力。创新方法加持,让研究更具活力!如今孟德尔随机化这么火,各大知名医院、高校都在应用,你心动吗?

2. 目前临床中缺乏专门针对急性胰腺炎的药物治疗,有研究提出鹅去氧胆酸作为一种有潜力的方法来解决腺泡细胞坏死,而与鹅去氧胆酸相比,VB12 可能是治疗急性胰腺炎的更优治疗选择,因为它易于获取,安全性好!

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题目:维生素B12保护急性胰腺炎胰腺组织腺泡细胞坏死

杂志:MedComm

影响因子:10.7

发表时间:2024年10月

公众号后台回复“666”领取原文PDF,文献编号:20241028

研究背景

急性胰腺炎是胰腺的一种常见炎症性疾病,关于急性胰腺炎的最佳治疗方法仍然存在许多问题,其中最重要的是,需要药物或策略来抑制胰腺全身性炎症反应的早期器官损伤,并防止患者随后的器官衰竭。有研究显示,单碳代谢营养素(维生素B(VB 6 )、VB12 、同型半胱氨酸和叶酸)的失衡会对胰腺细胞分化和肠粘膜屏障的完整性产生负面影响,加剧毒性损伤和炎症反应。本研究旨在探讨叶酸、同型半胱氨酸和VB12 对急性胰腺炎的因果影响。    

数据来源

公开的急性胰腺炎汇总统计数据来自英国生物样本库研究(Neale实验室)和FinnGen联盟;血清叶酸、同型半胱氨酸和VB12 的全基因组学(GWAS)汇总数据来自deCODE GENETICS网站。

研究思路

首先,通过孟德尔随机化(MR)分析,使用单核苷酸多态性(SNP)作为工具变量来评估关键单碳代谢营养素与急性胰腺炎发生风险之间的潜在因果关系。其次,小鼠模型用于验证遗传相关性发现,加深对叶酸、同型半胱氨酸和VB12在急性胰腺炎中的作用的理解。

主要结果

1. MR分析

通过几项选择标准,确定了3个血清叶酸相关SNP、13个同型半胱氨酸相关SNP、12个VB 12 相关SNP作为工具变量。通过MR分析显示,在UK Biobank队列中,遗传预测的血清VB 12 浓度与急性胰腺炎风险降低有显著因果关系。通过荟萃分析显示,急性胰腺炎风险与遗传预测的血清同型半胱氨酸或叶酸水平之间没有显著相关性,血清VB 12 水平与急性胰腺炎风险之间存在暗示性负相关因果关系(图1)。在对遗传预测VB 12 水平的每个SNP的敏感性分析中,相关性仍然存在(表1)。以上结果表明,遗传预测的血清VB 12 水平与患者发生急性胰腺炎风险呈负相关    

图1 MR分析评估叶酸、同型半胱氨酸和VB12 与急性胰腺炎的关系

2. 实验验证

通过基因修饰小鼠模型来评估VB 12稳态对急性胰腺炎的影响,结果提示,在l -精氨酸诱导的小鼠急性胰腺炎中,细胞中VB 12 缺乏可加重腺泡细胞损伤,促进导管小管复合物的形成,触发T淋巴细胞浸润。通过CER诱导的胰腺炎来测试VB 12 对野生型小鼠胰腺组织内事件的影响,结果证实,VB 12在CER诱导的小鼠急性胰腺炎模型中,能够在胰腺炎早期恢复胰腺结构并预防腺泡细胞坏死,但不能预防诱导的小鼠急性胰腺炎胰腺组织的固有免疫应答。检测VB 12在l -精氨酸诱导的急性胰腺炎模型中的作用,结果表明,VB 12对l -精氨酸诱导的小鼠胰腺炎具有保护作用。检验VB 12是否能预防急性胰腺炎的发生,结果表明,VB 12预处理可预防l -精氨酸诱导的急性胰腺炎小鼠胰腺组织中腺泡细胞的损伤和T淋巴细胞的炎症反应(图2)。    

图2 VB12对l -精氨酸诱导的急性胰腺炎有预防作用

将谷胱甘肽(GSH)置于CD320消融小鼠中,并通过CER诱导急性胰腺炎,结果表明,GSH增强了小鼠模型中胰腺组织的坏死,试验排除了VB 12通过保留GSH清除活性氧来保护急性胰腺炎胰腺组织损伤的可能性。使用ATP治疗-消融小鼠CER诱导的急性胰腺炎,结果表明,ATP处理能显著减少CER诱导的急性胰腺炎野生型小鼠模型的细胞坏死,但不能减少胰腺组织的管状复合体、胰蛋白酶活性和血清淀粉酶水平,进一步验证了ATP对急性胰腺炎胰腺组织细胞坏死的保护作用(图3)。综上,VB 12在胰腺炎早期通过ATP生成途径恢复胰腺结构并保护腺泡细胞。    

图3 VB12通过产生ATP保护胰腺组织腺泡细胞

文章小结

该研究通过孟德尔随机化分析证明了遗传预测的血清VB 12 水平与患者发生急性胰腺炎风险间存在负相关关系,又通过动物模型验证了上述结果,并探讨了潜在的作用机制。该研究思路清晰,孟德尔随机化加持,这篇国自然、省自然、博士后科研项目更出彩!如果没有实验条件,该如何设计方案,才能满足高分SCI要求呢?感兴趣的朋友,快来Call胡哥~

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