哦买嘎,0实验网络药理学,17天接受!晋升神刊简直快到飞起!网药+分子对接+分子动力学模拟,中医药绝妙思路墙裂推荐!

文摘   2024-10-29 18:00   上海  


叮咚,胡哥驾到!

Hindawi倒闭,MDPI收稿量降低88%....以往好投的热门刊秒拒率高达70%!最近就连纯生信友好期刊-Heliyon也被On Hold了,大家是不是觉得又被偷家了~然而,申请副高的截止时间已出,怎么做才能3个月快速发文呢?

胡哥今天发现的这本神刊,或许能保你副高!大家有需要的,速速拿出小本子记起来,毕竟杂志选的好,成功少不了

该期刊就是Foods,中科院2区4.7分,不算顶刊,不过对晋升来说也是锦上添花。值得一提的是,这期刊速度杠杠滴,甚至只要半个月左右就可接受!简直是快到离谱!估计这里就有不少朋友说,怎么可能这么快。那咋就用事实说话,胡哥今天分享的这篇网药纯生信文献就是17天接受,3天出版!没错!17天接收!还是纯生信~宝子们服不服!

可以看出,这本期刊对生信友好,并且可以接受纯生信,此外,该刊还发文量大:4417篇(2023-2024年),你是不是心动了,心动咱们就文章投起来~(不可多得的宝藏杂志!赶紧投稿!)

言归正传,咋们的主线任务-文献分享也不能落下,快跟着胡哥一起看下这篇17天接收的网药纯分析文章吧!(ps:科研遇到困难?思路陷入僵局?别担心,别焦虑!快来滴滴胡哥吧!团队全程专业服务,助力您的副高梦!期待您的好友申请哦~) 

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研究背景

茶多酚是茶叶中的重要天然成分,儿茶素是茶多酚的主要成分,因其对健康的诸多益处,尤其是在治疗和保护高血压方面的益处而备受关注。高血压已成为全球医疗保健领域的一个重要问题。目前,儿茶素抗高血压的潜在靶点和作用机制仍不清楚

研究主要材料和方法

1. 主要材料:

儿茶素成分:研究涉及了8种主要的儿茶素成分。

2. 主要方法:

(1)网络药理学:通过构建儿茶素成分与潜在靶点之间的网络,分析了它们如何相互作用,并预测了23个潜在的降血压作用的靶点。

(2)GO和KEGG通路富集分析:使用“clusterProfiler”软件包进行GO和KEGG富集分析,并使用在线工具进行分析结果的可视化。

(3)分子对接:利用AutoDock Vina 1.2.5软件进行分子对接模拟,并使用Discovery Studio 2019软件进行对接结果的分析和可视化。

(4)分子动力学模拟:使用GROMACS 2020.6软件进行模拟,并使用MM/GBSA方法计算结合自由能。

研究结果

1.儿茶素成分抗高血压作用潜在靶点的筛选

通过公共数据库PubChem、SEA Search Server和SwissTargetPrediction)预测了8种儿茶素成分的23个潜在降血压靶点;通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,确定了三个关键靶点:MMP9、BCL2和HIF1A。

(A)茶-儿茶素-靶标网络的构建;

(B)预测儿茶素靶点和高血压相关靶点的维恩图;

(C)交叉靶点的PPI网络;

(D)茶-儿茶素-靶点-高血压网络图。

2.关键靶点功能富集分析

KEGG通路和GO富集分析揭示了这些关键靶点在调节血管平滑肌收缩、促进血管生成和介导血管内皮生长因子受体信号传导方面发挥重要作用。

(A)关键靶点的KEGG通路分析;

(B)关键靶点的GO富集分析。

3.主要儿茶素成分与MMP9、HIF1A和BCL2的分子对接

分子对接结果表明,关键靶点(MMP9、BCL2和HIF1A)能有效地与儿茶素成分(CG、GCG、ECG和EGCG)通过氢键和疏水作用结合。

图3. PPI网络分析结果

(A)MMP9和GCG之间的相互作用图;

(B)MMP9和CG之间的相互作用图;

(C)HIF1A和ECG之间的相互作用图;

(D)BCL2与EGCG之间的相互作用图。

4.分子动力学模拟和结合自由能计算

分子动力学模拟进一步证实了儿茶素与靶点之间的结合稳定性,表明CG、GCG、ECG和EGCG可能是对抗高血压的儿茶素关键成分。

(A)四种复合物的RMSD值;

(B)四种复合物的Rg值;

(C)四种复合物的溶剂可及表面积(SASA)值;

(D)四种复合物中氢键的数量;

(E)四种复合物的结合自由能(ΔGbind)。

文章小结

综上,该研究结合网络药理学、分子对接和分子动力学模拟,系统阐明了儿茶素治疗高血压的潜在机制,并为儿茶素作为预防高血压的功能添加剂的开发和应用提供了理论基础。文章指出需要进一步的药理学和临床研究来验证这些发现,并探索儿茶素在体内外调节高血压相关途径的机制。

该说不说,本文网药纯分析17天就被接收,与自身研究内容相匹配的完美选刊,属实功不可没!如果不是投到Foods这个杂志,分数再高点,可能文章指出的进一步研究就需要现在做了;分数再低点,自己也会遗憾。所以,Foods这种纯生信友好的二区杂志大家速速收藏吧~另外想在中医药领域大展拳脚的朋友,时刻跟紧胡哥的步伐吧~胡哥一路斩妖除魔,为你的SCI之路保驾护航!

DOI: 10.3390/foods13172685

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