内脏神经系统在大脑和脊髓的多个区域均存在一个功能上的等级调节。等级调节通过内脏反射在人体纵轴的不同水平发挥影响。
1、脊髓
蠕动调节和排尿反射等自主反射在脊髓形成，大脑下行通路可对其修正、抑制或激发。
举例：排尿反射
位于骶髓的S2～S4 水平的节后副交感神经元参与构成控制膀胱的基础反射环路。
当膀胱膨胀的感觉信号传入到中枢，然后激发到副交感神经元时，副交感神经纤维发出冲动，激发膀胱逼尿肌收缩，抑制尿道括约肌，从而完成排尿。
排尿反射的神经通路
2、脑干
脑干位于大脑下方，在脊髓和间脑之间，是中枢神经系统的一部分。脑干的功能主要是维持个体生命，包括心跳、呼吸、消化在内的一系列重要生理功能。
延髓：延髓同脊髓的双向联系为灰质旁的有髓固有纤维束。舌咽神经和迷走神经传入纤维在孤束核终止，参与调节呼吸、心血管和消化功能。
大多数的反射活动同延髓的内脏传出性核团和网状结构有关，这些区域可能参与调节血糖水平、分泌唾液、排尿、恶心、打喷嚏、咳嗽和呕吐。
脑桥：臂旁核是位于脑桥内的神经核团，包括臂旁内侧核和臂旁外侧核。
臂旁内侧核与味觉信息加工有关。
臂旁外侧核与呼吸的中枢控制有关，主要控制呼吸节律性。
中脑：眼的调节反射、瞳孔对光反射及其其他反射活动在中脑第III对脑神经的神经元核团复合体附近实现整合。
3、下丘脑
下丘脑位于丘脑沟下，是自主神经的皮质下最高中枢，边缘系统、网状结构的重要联系点，垂体内分泌系统的激发处。下丘脑可接受很多神经冲动，所以是内分泌系统和神经系统的中心。
下丘脑的功能是调节人体的体温、摄食、水平衡、血压、内分泌和情绪反应等重要生理过程。
对摄食行为的调节
下丘脑作为自主协调的重要区域，其后部区域参与交感神经系统的调节，其前部区域参与副交感神经的调节。
4、边缘系统
边缘系统的作用是使中脑、间脑和新皮层结构之间发生信息交换。边缘系统也称为内脏脑，通过与下丘脑及自主神经系统的联系，参与调节情绪的内脏表现和驱动性行为、恐惧、愤怒、侵略、进食活动等。
边缘系统
激活该系统会出现下列自主活动：心血管及消化道反应、排尿、排便、竖毛反射、瞳孔变化。
5、大脑新皮质
大脑新皮质针对外界刺激(如坏消息或好消息)的反应可能激发诸如面部潮红或泛白等自主反应。低血压或者心率下降导致的晕厥可能是情绪刺激诱发迷走神经兴奋性增加导致的。
大脑皮质
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