柯萨奇病毒(coxsackievirus A16)反向遗传学拯救

学术   科学   2024-04-27 14:39   安徽  

今天给大家分享一篇文献«Construction and characterization of an infectious clone of coxsackievirus A16»。文献报告了CVA16感染性cDNA克隆的构建和表征。这种感染性克隆的可用性将大大加强未来的病毒学研究和用于CVA16疫苗的开发。

柯萨奇病毒CVA16毒株shzh05-1(GenBank:EU262658)含有7410 个核苷酸。作者提取病毒RNA并使用oligo(dT)引物进行反转录。

CVA16基因组分为3段扩增,第1段为1-4392bp,第2段为4381-7410bp,第3段为6087-7410-polyA。将第1段和第2段通过Xba1酶切位点连接得到pcDNA3.1-CV(1-7410)。再将第3段替换pcDNA3.1-CV(1-7410)中的相应片段最终得到pcDNA3.1-CV(1-7410-pA)。

最后扩增T7启动子和CVA(1-7410-pA)一起插入pMD19-T载体,得到pMD19-CV。

全长CVA16感染性克隆构建示意图(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534)

用Not1线性化后,经T7 RNA聚合酶体外转录得到CVA16 RNA,用琼脂糖凝胶电泳检测体外转录获得的CVA16 RNA是否成功。

琼脂糖凝胶电泳检测体外转录获得的CVA16 RNA(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

将体外转录获得的CVA16 RNA转染RD细胞,72小时后收集细胞检测检测了VP1蛋白表达和病毒负链RNA的表达。

WB检测VP1蛋白表达(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

RT-PCR检测CVA16 RNA转染细胞中病毒负链基因组的表达(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

随后,作者检测了野生型CVA16感染RD细胞(下图B)、CVA16 RNA转染RD细胞(下图C)和CVA16感染性克隆拯救病毒感染RD细胞(下图D)形成的CPE。

RD细胞感染后形态(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

接着,作者分别用VP0、VP1和VP4抗体检测了第一代拯救病毒,第二代拯救病毒和野生型病毒感染细胞后VP0、VP1和VP3的蛋白表达,发现没有差异,说明拯救的病毒和野生型病毒在蛋白表达和加工过程中没有差异。

VP0、VP1和VP3抗体检测蛋白表达(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

同样的,野生型CVA16和拯救的CVA16感染vero细胞时的蚀斑大小也一致。

野生型CVA16和拯救的CVA16感染vero细胞蚀斑(Liu et al. Virology Journal 2011, 8:534

这项研究报告了CVA16新型感染性cDNA克隆的构建和表征。该cDNA克隆能够产生感染性CVA16病毒,该病毒在遗传学和生物学上与野生型病毒相同。CVA16感染性克隆的构建将极大地促进对其毒力的遗传决定因素的研究。该克隆还将允许快速、合理地开发和测试针对CVA16的候选减毒活疫苗和抗病毒疗法。

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智者不学生物
中科院博士,讲解-生物学、生命科学-基础理论和实验方法,文章套路解读,分享protocol、软件、电子书和实用网站
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