ESMO Open:世和MERCURY多组学有效鉴别良恶性肺结节

健康   2024-08-12 16:00   江苏  

导   语

低剂量计算机断层扫描(LDCT),作为肺癌筛查的常用方法,尽管效果显著,却也不乏挑战。既往报道显示,约25%经LDCT标记为“可疑”的肺结节在手术切除后被证实为良性,这不仅加剧了患者的身心负担,也对医疗资源构成了额外压力。因此,临床亟需一种高效、非侵入性解决方案,以精准区分肺结节的良恶性,从而减轻患者痛苦,优化医疗资源分配。


世和基因基于自主研发的MERCURY cfDNA片段组学技术,已成功发表了一项关于肺结节良恶性鉴别的研究成果[1]。本次,我们与中国医科大学附属第一医院许顺教授团队合作,对MERCURY技术的性能作进一步验证,基于4种cfDNA片段组学特征构建的肺结节良恶性鉴别模型,在独立验证队列和外部测试队列中,AUC分别达到了0.857和0.860[2]研究成果已于近日发表在国际权威期刊ESMO Open(IF=7.1)。

研究亮点

1、样本量大,研究共纳入355例受试者,其中289例为恶性结节,66例为良性结节。


2、在独立验证队列和外部测试队列中,AUC分别达到了0.857和0.860;在89.6%的敏感性下,独立验证队列实现了68.2%的特异性。


3、研究探讨了不同结节大小和吸烟史对诊断性能的影响,进一步强化了MERCURY技术在肺结节鉴别中的应用价值。

研究方法

研究共纳入355例经LDCT提示为高危肺结节并接受手术切除的患者(病理证实,289例为恶性结节,66例为良性结节),收集患者血浆样本并进行低深度WGS测序,以分析cfDNA片段组学特征,并将所有患者按2:1分配至训练队列和独立验证队列。


训练队列(193例恶性结节,44例良性结节)用于构建机器学习模型。研究使用自动化机器学习方法,对基于4种不同cfDNA片段组学特征(FSR、FSD、BPM、Neomer)的基础模型进行优化,并将其组合为最终的集成模型。


独立验证队列(96例恶性结节,22例良性结节)用于评估集成模型的性能。此外,研究还纳入了一个包含58例恶性结节和41例良性结节的外部测试队列,以进一步验证模型性能(图1)。


图1. 研究流程

研究结果

在训练队列中,基于单个片段组学特征的基础模型在区分良恶性结节方面表现出不同水平的预测能力,AUC介于0.677至0.743之间,4种特征叠加后集成模型预测性能显著提高,AUC为0.848(图2A)。


在独立验证队列中,集成模型的AUC为0.857(图2A);在89.6%的敏感性下,出色地实现了特异性68.2%,整体准确性达到了85.6%。


在外部测试队列中,集成模型表现同样良好,AUC为0.860(图2B),特异性在89.7%时敏感性达到了63.4%。


独立验证队列的亚组分析显示,在恶性结节组中,检测不同结节大小亚组(<1cm:91.7%;1-3cm:88.1%;>3cm:100%;未知:100%)和吸烟史(有:88.2%;无:89.9%)的敏感性均保持较高(图3)。


图2. 集成模型在训练队列、独立验证队列和外部测试队列中的AUC值

图3. 独立验证队列亚组分析敏感性

结   语

本研究将世和MERCURY cfDNA多组学液体活检技术应用于肺结节良恶性鉴别,并成功地将恶性肺结节与放射学上疑似但病理学证实为良性的结节区分开来。该技术将助力修正LDCT假阳性结果,降低不必要的侵入性临床干预,为肺结节的早期诊断提供了更为精准和人性化的解决方案。

专家简介


许顺 教授

中国医科大学附属第一医院

胸外科主任、博士生导师、主任医师


  • 国家二级教授、国务院特殊津贴专家、辽宁名医

  • 中华医学会胸心血管外科分会委员会委员

  • 中华医学会胸心血管外科学分会肺癌学组委员

  • 中华医学会胸心血管外科学分会微创学组委员

  • 中国医疗保健国际交流促进会理事、胸外科分会副主任委员、常委 

  • 中国医疗保健国际交流促进会肺癌防治学会副主任委员、常委

  • 中国医疗保健国际交流促进会胸部肿瘤分会常务委员

  • 中国医疗保健国际交流促进会加速康复外科分会胸外科学组副组长

  • 中国医药教育协会肺癌医学教育委员会副主任委员、常委

  • 中国医师协会胸外科医师分会纵隔与胸壁外科专家委员会委员

  • 东北地区肺部结节诊断与治疗中心主任

  • 辽宁省医学会胸外科学分会主任委员

  • 辽宁省肺癌防治协会会长兼法人

  • 2017年国际胸外科学术大会暨第五届国家癌症中心学术年会副主席

  • 辽宁省医师协会外科医师分会副会长

  • 辽宁省抗癌协会副主任委员

  • 笹川医学奖学金同学会会副理事长


参考文献

[1] Wang S, Meng F, Chen P, Lv Y, Wu M, Tang H, Bao H, Wu X, Shao Y, Wang J, Dai J, Xu L, Wang X, Yin R. Cell-free DNA assay for malignancy classification of high-risk lung nodules. J Thorac Cardiovasc Surg. 2024 Apr 24:S0022-5223(24)00370-2. doi: 10.1016/j.jtcvs.2024.04.026. Epub ahead of print. PMID: 38670484.

[2] Xu S, Luo J, Tang W, et al. Detecting pulmonary malignancy against benign nodules using noninvasive cell-free DNA fragmentomics assay[J]. ESMO open, 2024, 9(8): 103595.



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世和基因专注于高通量测序技术的临床转化应用,为肿瘤精准医疗提供分子诊断服务和产品,并为医院提供一站式NGS解决方案。 


IVD试剂盒产品

  • 益胜康™基因突变检测试剂盒(2018年):EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突变检测(国械注准20183400408)

  • 世和一号®非小细胞肺癌组织TMB检测试剂盒(2023年):国内首个肿瘤高通量测序大Panel试剂盒(国械注准20233401452)


临床检测服务

  • 权威认证:CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证;江苏省精准医学基因检测工程中心、江苏省肿瘤精准医疗工程技术研究中心、江苏省认定企业技术中心

  • 室间质评:263次通过国家卫健委临检中心室间质评


创新研究成果

CALIBRATE系列多癌种围术期临床研究:

  • 2021年5月,肠癌术后ctDNA MRD研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2021年9月,直肠癌新辅疗效预测研究成果发表于PLoS Med

  • 2021年11月,肺癌术后ctDNA MRD研究成果发表于Nature Comms

  • 2022年5月,NSCLC放化疗疗效预测研究成果发表于Mol Cancer

  • 2022年7月,食管鳞癌放化疗疗效预测研究成果发表于Clin Transl Med

  • 2022年10月,肺癌术后MRD ctDNA克隆分析研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2023年10月,胃癌MRD队列研究成果发表于Cancer Commun

  • 2024年3月,食管鳞癌放化疗联合免疫治疗研究成果发表于Cancer Commun;肺癌免疫巩固治疗研究成果发表于Clin Transl Med

  • 2024年4月,肺癌放化疗后免疫治疗研究成果发表于J Natl Cancer Cent

MERCURY技术MRD应用:

  • 2022年10月,直肠癌新辅疗效预测研究成果发表于Clin Chem

  • 2023年5月,NSCLC术后复发风险预测研究成果发表于Cancer Res Commun


DECIPHER系列多癌种早筛研究:

  • 2021年10月,肠癌早筛研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2021年12月,肝癌早筛研究成果发表于Hepatology

  • 2022年6月,泛癌种早筛研究成果发表于Mol Cancer;肺癌早筛研究成果发表于eBioMedicine

  • 2022年11月,肺癌早筛研究成果发表于Am J Respir Crit Care Med

  • 2024年6月,胃癌早筛研究成果发表于Genome Med

  • 2024年7月,肠癌早筛研究成果发表于Cancer Res

  • 2024年7月,子宫内膜癌早筛研究成果发表于BMC Med

  • 2024年7月,食管鳞癌早筛研究成果发表于Cell Rep  Med


世和基因致力于通过领先的基因检测技术和多组学分析,推动肿瘤早筛与精准治疗的进步。


世和基因
世和基因致力于高通量测序技术的临床转化应用,主要面向肿瘤患者开展基因检测,为肿瘤精准医疗提供分子诊断服务和产品;国家高新技术企业,江苏省发改委、科技厅及工信厅三认证精准医学中心,实验室具备CAP/CLIA/ISO15189资质。
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