【Mod Pathol】世和RNA-Capseq技术揭示罕见肾上皮样肿瘤分子病理密码

健康   2024-08-01 16:00   江苏  

导   语

EWSR1/FUS与CREB转录因子家族融合的软组织肿瘤是一种新兴且高度异质性的间叶肿瘤,表现出不同的形态、免疫表型和生长行为。既往研究显示,这类融合软组织肿瘤偏好发生于覆有间皮的体腔,内脏器官受累的情况极为罕见。


复旦大学附属肿瘤医院王坚教授与宁波市临床病理诊断中心赵明教授,基于多年临床经验,与世和基因展开合作对3例罕见累及肾脏的EWSR1/FUS::CREB融合软组织肿瘤的临床表现、组织学、免疫组化和分子病理学特征进行了全方位的研究总结。相关研究成果已发表于国际病理学顶级期刊Modern Pathology(IF=7.1),以期帮助临床工作者深化对这类罕见肿瘤病理诊断的理解。

研究内容

研究团队通过详细的病例回顾,筛选出3例伴有EWSR1::CREB融合基因的原发性肾上皮样间叶性肿瘤。为了深入解析肿瘤的临床行为、组织病理学和遗传学特征,研究者们综合运用了免疫组化抗体标记、原位荧光杂交技术(Fish)以及世和基因靶向RNA测序技术(RNA-Capseq)进行深入研究。


临床表现

3例患者中,2例发生在左肾,1例累及右肾,无其他部位转移。所有患者均行根治性肾切除术,未接受辅助治疗。随访中,1例患者术后5个月出现脊柱骨转移,而另2例分别在9个月和120个月的随访期内未见疾病复发(表1)。


表1. 伴EWSR1::CREB融合的肾上皮样肿瘤的临床病理学和分子特征


组织学特征

肿瘤呈现围绕肾小管和肾小球的浸润性生长,由上皮样细胞组成,胞质从淡色到透明不等,位于硬化胶原基质中;肿瘤细胞伴随血管外皮细胞瘤样生长模式,炎症浸润显著,淋巴浆细胞散布于病变内或病变周围;肿瘤细胞核呈圆形至椭圆形,以单形为主,核轮廓光滑,染色质呈微小的斑点状,核仁不明显;有丝分裂活性均较低(1~2/10高倍场)。


免疫组化特征

所有肿瘤均显示上皮分化(EMA、AE1/AE3阳性),部分病例MUC4、CD34、CD99、CA9阳性,Ki67增殖指数低(3%-5%),SMARCB1/INI-1和H3K27me3染色正常(表1)。其他标记物均为阴性(SMA、Calponin、Melan-A、HMB45、Synaptophysin、Chromogranin-A、S-100、STAT6、PAX8、SOX10、Pan-TRK、WT1、Calretinin和SATB2)。


分子病理学特征

在分子层面,世和基因RNA-Capseq技术展现出了检测融合变异的独特优势,不仅能够高效辨识融合基因是否具备生物活性,还能精确定位融合的具体断点,这对于理解肿瘤的遗传机制至关重要。本研究中,该技术成功鉴定出2例EWSR1::CREM融合以及1例EWSR1::ATF1融合,均确认为功能性融合,并精确锁定了融合基因的断裂与重组位置。后续的FISH分析进一步印证了RNA测序数据的准确性,为融合基因的存在提供了有力的验证(图1)。


图1. 肾上皮样肿瘤的EWSR1::CREB融合

总   结

EWSR1::CREB融合软组织肿瘤累及肾脏的情况极为罕见,鉴别诊断充满挑战。本研究通过综合临床病理、免疫组化和分子遗传学特征,全面展示了此类肿瘤的复杂面貌,凸显了世和基因RNA-Capseq技术在精准医疗中的核心作用。这项成果不仅丰富了医学知识库,更为临床医师提供了关键的诊断依据,有助于提升罕见肿瘤的诊疗水平,为患者带来更精准的治疗方案。

专家简介


王坚 教授

复旦大学附属肿瘤医院

病理科主任、主任医师、博士生导师


  • 中华医学会病理分会常委

  • 中国医师协会病理分会副主委

  • 中国抗癌协会肿瘤病理专业委员会副主委

  • 中国研究型医院病理专业委员会主委

  • 中华医学会病理分会骨和软组织病理学组组长

  • 上海市抗癌协会病理专业委员会主任委员

  • 上海市临床病理质控中心主任

  • 《中华病理学杂志》、《临床与实验病理学杂志》、《中国癌症杂志》副主编

  • 主编专著《软组织肿瘤病理学》、《临床病理诊断与鉴别诊断:软组织疾病》,参编《中华医学百科全书-肿瘤学》,参编第五版WHO肿瘤分类之软组织和骨肿瘤、胸部肿瘤和妇科肿瘤的编写

  • 国际癌症报告合作组织(ICCR)软组织肉瘤专家组成员



赵明 教授

宁波市临床病理诊断中心

分子病理科主任、硕士研究生导师


  • 世界卫生组织(WHO)《第五版泌尿男生殖系统肿瘤分类》编委

  • 中华医学会病理学分会泌尿男性生殖病理学组委员兼工作秘书

  • 浙江省卫健委“病理诊断技术能手”

  • 浙江省抗癌协会肿瘤分子诊断与新技术转化专委会常委

  • 浙江省医学会病理学分会青委会副主任委员

  • 浙江省医师协会病理科医师分会委员兼秘书

  • 浙江省医师协会泌尿肿瘤专委会委员

  • 2023年宁波市医疗卫生高端团队重大攻坚项目(第一层次)项目负责人

  • 美国圣路易斯华盛顿大学病理学系访问学者

  • 《International Journal of Surgical Pathology》SCI期刊编委

  • 《中华病理学杂志》通讯编委《临床与实验病理学杂志》编委

  • 以第一作者或通讯作者发表研究论文100余篇(其中SCI论文50余篇;中华期刊论文50余篇)


参考文献

Zhao M, Gan H, Zhong S, Xia Q, Bai Y, Xu J, Teng X, Wang J. Intra-Abdominal Epithelioid Neoplasm With EWSR1::CREB Fusions Involving the Kidney: A Clinicopathologic and Molecular Characterization With an Emphasis on Differential Diagnosis. Mod Pathol. 2024 May;37(5):100468.



作者:XY      审核:河豚       排版:Moro




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世和基因专注于高通量测序技术的临床转化应用,为肿瘤精准医疗提供分子诊断服务和产品,并为医院提供一站式NGS解决方案。 


IVD试剂盒产品

  • 益胜康™基因突变检测试剂盒(2018年):EGFR/ALK/ROS1/BRAF/KRAS/HER2基因突变检测(国械注准20183400408)

  • 世和一号®非小细胞肺癌组织TMB检测试剂盒(2023年):国内首个肿瘤高通量测序大Panel试剂盒(国械注准20233401452)


临床检测服务

  • 权威认证:CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证;江苏省精准医学基因检测工程中心、江苏省肿瘤精准医疗工程技术研究中心、江苏省认定企业技术中心

  • 室间质评:263次通过国家卫健委临检中心室间质评


创新研究成果

CALIBRATE系列多癌种围术期临床研究:

  • 2021年5月,肠癌术后ctDNA MRD研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2021年9月,直肠癌新辅疗效预测研究成果发表于PLoS Med

  • 2021年11月,肺癌术后ctDNA MRD研究成果发表于Nature Comms

  • 2022年5月,NSCLC放化疗疗效预测研究成果发表于Mol Cancer

  • 2022年7月,食管鳞癌放化疗疗效预测研究成果发表于Clin Transl Med

  • 2022年10月,肺癌术后MRD ctDNA克隆分析研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2023年10月,胃癌MRD队列研究成果发表于Cancer Commun

  • 2024年3月,食管鳞癌放化疗联合免疫治疗研究成果发表于Cancer Commun;肺癌免疫巩固治疗研究成果发表于Clin Transl Med

  • 2024年4月,肺癌放化疗后免疫治疗研究成果发表于J Natl Cancer Cent

MERCURY技术MRD应用:

  • 2022年10月,直肠癌新辅疗效预测研究成果发表于Clin Chem

  • 2023年5月,NSCLC术后复发风险预测研究成果发表于Cancer Res Commun


DECIPHER系列多癌种早筛研究:

  • 2021年10月,肠癌早筛研究成果发表于J Hematol Oncol

  • 2021年12月,肝癌早筛研究成果发表于Hepatology

  • 2022年6月,泛癌种早筛研究成果发表于Mol Cancer;肺癌早筛研究成果发表于eBioMedicine

  • 2022年11月,肺癌早筛研究成果发表于Am J Respir Crit Care Med

  • 2024年6月,胃癌早筛研究成果发表于Genome Med

  • 2024年7月,肠癌早筛研究成果发表于Cancer Res

  • 2024年7月,子宫内膜癌早筛研究成果发表于BMC Med

  • 2024年7月,食管鳞癌早筛研究成果发表于Cell Rep Med


世和基因致力于通过领先的基因检测技术和多组学分析,推动肿瘤早筛与精准治疗的进步。



世和基因
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