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一项Meta分析表明ctDNA检测在乳腺癌中对于PIK3CA突变的诊断具有高准确性。
乳腺癌位居全球女性恶性肿瘤发病率首位[1],其中约50%的HR+/HER2-晚期乳腺癌患者会发生PI3K/AKT/PTEN通路改变,以PIK3CA基因为主[2]。既往研究数据报道中国乳腺癌人群中PIK3CA突变率约为32%-50%,全球突变率为31-40%[3]。因此,如何进行精准检测识别出这类患者是当下关注的热点问题。一项荟萃分析探究了循环肿瘤DNA(ctDNA)在乳腺癌中检测PIK3CA突变的准确性,并比较了肿瘤组织与血浆中PIK3CA突变的改变以及改变的影响因素,结果显示二代测序(NGS)进行ctDNA检测可以作为转移性乳腺癌患者的首选检测策略[4]。该研究为PI3K/AKT/PTEN通路改变乳腺癌患者的精准检测提供了重要的循证依据。现攫取重要内容整理如下,以飨读者。
研究方法
研究纳入标准:经组织学证实诊断为早期(I/II/III期)或晚期(IV期)乳腺癌的患者;在组织和血浆样本中检测PIK3CA致病性变异的研究;通过血浆ctDNA分析检测PIK3CA突变的研究。不符合纳入标准的研究和正在进行的临床试验被排除在分析之外。
从纳入的研究中提取数据,包括:第一作者姓名、发表年份、研究设计、患者数量、生物亚型、研究治疗、肿瘤负荷、部位、诊断技术的检测限和PI3K参考范围、ctDNA突变等位基因分数(MAF)、采样时间、以及真阳性(TPs)、真阴性(TNs)、假阳性(FPs)和假阴性(FNs)的数量。同时采取QUADAS-2量表来评估研究的偏倚风险。
研究结果
本研究共筛选775篇文献,经评估后最终纳入24项研究(包含25个队列)进行分析,其中一项研究包括前瞻性和回顾性两个队列,作为独立的数据集进行分析,共1966例患者。
●整体诊断准确性分析
研究分析结果显示,ctDNA的敏感性和特异性分别为0.73(95% CI 0.70-0.77)和0.87(95%CI 0.85-0.89),sROC曲线下的面积(AUC)为0.93。根据约登指数,在检测时实现假阳性率最小化的最佳截断值为0.6。在最佳截断值的标准下,汇总一致性、阴性预测值(NPV)和阳性预测值(PPV)分别为0.87、0.86和0.89,而汇总的阳性似然比(PLR)、阴性似然比(NLR)和诊断比值比(DOR)分别为7.94、0.33和33.41。Fagan图分析显示,在预测试概率为37%的情况下,利用ctDNA进行PIK3CA突变检测能提高后测试诊断率至77%,未检测到突变则降低至15%。
图2. 汇总ctDNA的敏感性、特异性及sROC曲线图
●亚组分析
本研究根据肿瘤负荷、样本量、诊断技术、采样时间、生物亚型及热点突变等因素,将患者分为不同的亚组,并对每个亚组进行了单独分析。
肿瘤负荷:研究分析显示,ctDNA检测在早期乳腺癌(55名患者)的敏感性为0.76,特异性为1.00,AUC为1.00;ctDNA检测在晚期乳腺癌(1836名患者)的敏感性为0.77,特异性为0.86,AUC为0.92,显示出ctDNA检测对突变和野生型患者的极佳区分能力。尽管早期亚组的样本量有限,但也发现了与晚期亚组相当的综合诊断值。
图4. 肿瘤负荷亚组的研究数据
样本量:结果显示,小样本研究(≤45名患者,274名患者)中ctDNA检测的敏感性为0.78,特异性为0.96,DOR为48.4,AUC为0.90;大样本研究(>45名患者,1698名患者)中ctDNA检测的敏感性为0.72,特异性为0.85,DOR为27.11,AUC为0.87。结果显示较小样本量的研究在特异性和DOR方面表现更好。
诊断技术:亚组分析结果显示,使用下一代测序(NGS,307名患者)进行ctDNA检测的敏感性为0.83,特异性为0.98,AUC为0.98;数字滴式聚合酶链反应/BEAMing(ddPCR/BEAMing,1485名患者)进行ctDNA检测的敏感性为0.74,特异性为0.84,AUC为0.92;传统聚合酶链反应(PCR,174名患者)进行ctDNA检测的敏感性为0.51,特异性为0.96,AUC为0.77。结果表明,NGS技术在敏感性、特异性和AUC方面优于基于PCR的方法,并且在特异性方面没有导致异质性,同时显示出有利于NGS的PLR、NLR和DOR率。
采样时间:分析结果显示,低时间间隔(≤18天,219名患者)的ctDNA检测的敏感性为0.85,特异性为0.99,AUC为0.94;高时间间隔(>18天,679名患者)的ctDNA检测的敏感性为0.66,特异性为0.83,AUC为0.89。结果表明,当组织和血浆样本的采集时间间隔较短(≤18天)时,ctDNA检测的性能最佳,显示出更高的敏感性、特异性和AUC值。
生物学亚型:研究结果显示,ctDNA检测在HR+/HER2-(1357名患者)的敏感性为0.73,特异性为0.83,AUC为0.87;ctDNA检测在HER2+(52名患者)的敏感性为0.57,特异性为1.00,AUC为0.86。结果表明,ctDNA检测在两种亚型中都具有较高的准确性,但HR+/HER2-亚型的ctDNA敏感性略高于HER2+亚型。
热点突变:分析结果显示,ctDNA检测在E542/545X突变(421名患者)患者的敏感性为0.70,特异性为0.95,AUC为0.88;ctDNA检测在H1047X突变(520名患者)的敏感性为0.74,特异性为0.98,AUC为0.93。结果表明,ctDNA检测在检测H1047X突变方面表现稍好。
表1. 本研究的Meta分析结果
研究结论
审批编号:CN-146509 过期日期:2025-10-30
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