2023年6月，厦门大学团队（组成人员含川大、复旦、剑桥）发布了论文《Ancient genomes reveal coexistence of demic and cultural diffusion in the development of Neolithic mixed millet and rice farming in southwest China》《古基因组揭示中国西南地区新石器时代粟稻混合农业流行与文化传播的共存发展》，论文揭示了新石器时代，中国西南地区的人口混合和发展情况。
论文题目
在该论文中，有一组数据非常引人注目，就是里面公布了四川成都高山城遗址的DNA数据，高山城遗址属于宝墩文化，曾经发现国内较早的象牙器，宝墩文化在网络上有个更为熟知的名称，就是大名鼎鼎的三星堆文化一期和三星堆文化二期。
一、高山城遗址数据（三星堆文化一期、二期）
共有五个古人个体DNA被成功提取，其中CDG2M86和CDG2M87两个古人距今4500-4200年，属于三星堆一期文化，CDG2M56、CDG2M60、CDG2M7三个古人样本，距今3850-3720年，属于三星堆二期文化。
五个样本的情况如下：
2015CDG2M56: 2344-2138 cal BCE (3800±30 BP)
2015CDG2M60: 2350-2193 cal BCE (3820±30 BP)
2015CDG2M71: 2231-2116 cal BCE (3750±30 BP)
2015CDG2M86: 4500-4200 BP
2015CDG2M87: 4500-4200 BP
文章对比了89处中国和世界各地古人类DNA数据，认为在中国西南地区（SWC地区）在8400-4000年前，生活的古代人类属于和平文化相关人群（Hòabìnhian-related ancestry），从8335–6400年前的广西宝剑山遗址古人DNA可知，这一时期，这些和平文化的古人成分较为单一，没有明显的外部成分融入。
和平文化是一支古老的石器狩猎文化，没有农业，以狩猎为生，因为最初发现于越南和平省而命名，这一个古老人群曾经遍布东南亚地区，2018年的《Ancient Genomics Reveals Four Prehistoric Migration Waves into Southeast Asia》一文中显示，古老的狩猎人群其父系类型为D（马来西亚）和C（老挝）。
进入到距今4000多年前的新石器时代后，农业人口从华北黄河流域进入四川盆地，为中国西南地区带来了新的人类基因和语言（汉藏语），这一新到人群的类型就是后来三星堆文化人群的主体，在此前的论文中，黄河流域人群的主要父系类型有N1b1（山东小荆山）、N1b1（山东博山）、N1b2（河南平粮城）、O1b-page59（河南汪沟）、O2a-F8（陕西杨官寨）、O2a-F8（甘肃磨沟）、C2s（陕西神木）等等。高山城遗址未测得Y染色体数据，因此无法直接判断三星堆人的父系类型，但可以确信其Y类型应当于黄河流域古人群基本一致。
通过admixture软件对于高山城遗址古人的DNA分析，论文认为，高山城遗址（三星堆文化一期、二期）古人，其成分是由89.1~95.1%的从黄河流域迁徙而来的农业古人和4.9~10.9%的西南土著和平文化狩猎古人混合而成，这就是三星堆文化古蜀人的最初来源。
（We could successfully model SWC derived from ~90% YR-related (92.1%±3% in Gaoshancheng and 88.7%±3% in Haimenkou) and ~10% Hòabìnhian-related ancestry (7.9%±3% in aoshancheng and 11.3%±3% in Haimenkou, see Table. S6A)
和东南亚、黄河流域的古人DNA对比
距今4500-3700年前的高山城古人（三星堆文化一期、二期）的全染色体基因谱系中，没有发现中国境外其他古人的基因来源，三星堆居民应当就是中国的土生居民。
境内境外古代DNA样本分布
二、云南海门口遗址
文章的另一处遗址为云南大理州海门口遗址，这是一个距今3200-2900年前的古代青铜文化早期的遗址，遗址中农业和畜牧业并存，经过DNA分析，其人口也是外来的黄河流域古人与当地石器狩猎人群融合而成，但黄河流域古人基因占据绝对主体（88.7%）。
海门口遗址的6个古人信息如下：
2016JHCM1-a1: 3200-3000 BP
2016JHCM1-a8: 3200-3000 BP
2016JHCM1-m19: 3200-3000 BP
2017JHCM8-t1: 1611-1503 cal BCE (3270±20 BP)
2017JHCM8-t6: 1221-1051 cal BCE (2940±25 BP)
2018JHCM2: 3100-2900 BP
文章提供了admixture软件K=2到K=8时的主成分分析，可以看到，四川成都高山城遗址和云南大理海门口遗址古人，于黄河流域的晚期新石器人群（Upper_YR_LN）最接近。
admixture数据
三、文章的观点
文章认为，中国西南地区（SWC地区），古代农业文化的发生，是通过外来人群的融入带来的，而不是当地土著狩猎人群发展出的农业，这种农业的扩散，伴随着人口的迁徙。
高山城和海门口古人，在黄河流域古人聚类
从语言学的角度看，四川成都高山城遗址和云南大理海门口遗址，都是古代黄河流域古人南下与当地土著人融合而成，这些地区至今仍然居住着与华北人群密切相关的汉藏语人群，与2018-2019年间根据现代DNA研究，认为汉藏语是从黄河中游区域扩散而来的观点吻合，这一过程再次论证了汉藏语系发展的历史过程。
和其他古人的关联度
