2024年1月30日，厦门大学王传超团队联合兰州大学，在国家基因组科学数据中心官网，公开了唐代高昌古城和高昌回鹘时期的DNA数据，共计44个个体，同一批上传了的还有4个采集自伊犁的古人个体。
这些样本将在《Ancient genomes reveal the temporal change of Yellow River millet farmers-related ancestry in Xinjiang》《古代基因组揭示黄河流域的谷物种植者对新疆地区的阶段性占据》一文中进行详细阐述。
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在这48个样本中，有44个来自7-10世纪的唐代高昌时期和回鹘汗国时期，地点是哈密市的拉甫却克遗址，其余4个来自于4400-2300年前（~战国时期）的个体，地点是伊犁州的吉仁台沟口遗址。高昌古国（460年-640年），以吐鲁番盆地为中心，建立的以汉人为主体居民的地方政权，控制了新疆东部大部分地区。历经阚氏高昌（460年-488年）、张氏高昌（488年-496年）、马氏高昌（497年-501年）及麴氏高昌（502年-640年）四个政权。贞观十四年（640年），高昌国为唐军所攻克，纳入中央版图。随着唐帝国在安史之乱后迅速衰落，在公元866年，来自漠北草原的回鹘人，在高昌建立了高昌回鹘汗国。这44个古人，其所属历史时期，为7-10世纪，唐代高昌-回鹘汗国时期的古人。![]()
44个高昌古人样本中，成功测序父系21人，最大类型为O类型，共计6个，其中O2四个，O1a有2个，比较有意思的是这两个
O1a-M119-F492-F619-TYT120735个体（M35-1和M42-1墓主），其Y类型相同，且常染色体也较为相近，均为60%东亚成分+40%西欧亚成分的混血，很可能还具有亲属关系。R类型也是6个，J类型4个，D类型1个，其余4个为低质量未细分下游样本。![]()
文章通过以为在新疆地区古DNA数据，发现了东亚成分在新疆地区的发展轨迹。文章在摘要部分认为：我们发现了一个发生在青铜时代晚期的遗传转化，伴随着土著祖先的消失和黄河流域祖先（YR成分）的基因流入。哈密古人在青铜时代晚期首次出现YR成分。我们还观察到随着时间的推移，黄河流域基因YR成分也随之增加。在铁器时代到历史时代，黄河流域基因的遗传贡献变得更加广泛和频繁，该成分在这一时期的人群中广泛存在，在唐代高昌古城的部分个体中，黄河流域的基因YR成分比例可以达到100%。这种黄河流域基因成分的增加，显示了人群的交流和融合，也是汉唐中央王朝对西域地区直接驻军和控制的结果。比如M54、M61-M3号这两个墓主古人，其黄河流域基因的占比高达100%，父系均为O2，常染色体总体成分接近今天河南-山东等地的汉族人，应该是2个来自黄河下游的唐代驻军。比如M35-1、M42-1、M60-3、M72-1这4个墓葬古人，其父系类型均为东亚的O1和O2类型，但常染色体却有30-50%的西欧亚成分，这些人都是汉唐驻军和商人与当地土著居民融合的结果，这些人应该不是第一代移民，而是早期中原移民与当地人通婚后若干代的后裔。
