【选题案例】组蛋白乳酸化修饰H3K18la在KRAS突变型结直肠癌中的作用及机制研究.docx

学术   2024-12-13 23:54   上海  

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国自然选题案例!

组蛋白乳酸化修饰H3K18la在KRAS突变型结直肠癌中的作用及机制研究



立项依据

结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)是全球范围内高发的恶性肿瘤之一,其中KRAS突变是其关键驱动基因突变类型,占CRC病例的30%-40%。KRAS突变型CRC表现出高度侵袭性和对治疗的耐药性。然而,目前针对KRAS突变型CRC的治疗手段有限,迫切需要探索其发病机制和潜在靶点。

组蛋白乳酸化修饰是一种新型的翻译后修饰,能够通过调控染色质开放状态和基因表达,与癌症的代谢紊乱密切相关。初步研究显示,KRAS突变驱动的代谢重编程可能通过上调乳酸生成,促进组蛋白乳酸化修饰(如H3K18la)的富集,从而影响下游基因表达并参与癌症进展。然而,目前关于组蛋白H3K18la在KRAS突变型CRC中的具体功能及其分子机制尚未明确。

基于上述背景,本研究拟聚焦H3K18la修饰在KRAS突变型CRC中的作用,解析其调控机制及功能,为KRAS突变型CRC的分子机制研究和治疗提供新思路。


科学假说

KRAS突变通过代谢重编程增加乳酸生成,促进组蛋白H3K18la修饰的富集,从而调控关键致癌基因的表达,增强结直肠癌细胞的侵袭性和治疗耐药性。


研究内容

  1. H3K18la在KRAS突变型CRC中的表达及临床相关性

  • 检测H3K18la在KRAS突变型CRC与KRAS野生型CRC中的表达水平及其与患者临床特征(如分期、侵袭性、预后)的关系。

  • H3K18la在KRAS突变型CRC中的功能

    • 验证H3K18la对KRAS突变型CRC细胞增殖、迁移、侵袭及治疗敏感性的调控作用。

  • KRAS突变介导的H3K18la修饰机制

    • 探讨KRAS突变如何通过代谢重编程(乳酸生成)调控H3K18la的富集及相关酶(如P300/CBP)的活性。

  • H3K18la调控下游靶基因的分子机制

    • 筛选H3K18la富集的关键基因,分析其在KRAS突变型CRC中的功能和机制。


    研究方案

    1. H3K18la表达及临床相关性研究

    • 收集KRAS突变型与野生型CRC患者组织样本,通过Western blot、免疫组化(IHC)和ChIP-qPCR检测H3K18la水平。

    • 分析H3K18la表达与患者临床特征(如分期、存活率)的相关性。

  • 体外功能验证

    • 构建H3K18la相关酶(如乳酸脱氢酶LDHA、P300/CBP)的敲低或过表达CRC细胞株,观察H3K18la对细胞增殖、迁移、侵袭及化疗敏感性的影响。

    • 采用体外侵袭实验、增殖实验(CCK-8)和化疗耐药检测评估H3K18la的功能。

  • KRAS突变介导H3K18la修饰机制研究

    • 在KRAS突变型CRC细胞中,通过代谢组学检测乳酸生成水平,并分析乳酸对H3K18la修饰的影响。

    • 利用抑制剂或基因敲低调控LDHA活性,验证乳酸介导的H3K18la修饰过程。

  • H3K18la下游靶基因筛选及功能研究

    • 通过ChIP-seq结合RNA-seq筛选H3K18la富集的关键基因,利用qPCR和Western blot验证其在KRAS突变型CRC中的表达变化。

    • 利用CRISPR/Cas9敲除或过表达关键靶基因,验证其在KRAS突变型CRC细胞中的功能。

  • 体内模型验证

    • 构建KRAS突变型CRC异种移植模型,通过基因干预H3K18la相关酶,观察其对肿瘤生长和治疗反应的影响。

    • 利用免疫组化和分子分析验证H3K18la及其靶基因在体内的功能。


    创新点

    1. 首次揭示H3K18la在KRAS突变型CRC中的作用
      本研究将解析H3K18la这一新型组蛋白修饰在KRAS突变型CRC中的功能,为理解表观遗传与代谢重编程的关系提供新视角。

    2. 探索KRAS突变驱动H3K18la修饰的代谢机制
      研究KRAS突变通过乳酸代谢调控H3K18la修饰的机制,为代谢-表观遗传互作研究提供新思路。

    3. 鉴定H3K18la调控的关键靶基因及通路
      阐明H3K18la调控的下游基因网络,为KRAS突变型CRC的分子治疗提供潜在靶点。


    预期结果

    1. H3K18la在KRAS突变型CRC中显著上调,其水平与患者预后和疾病侵袭性相关。

    2. H3K18la通过调控关键基因表达,增强KRAS突变型CRC细胞的增殖、迁移和耐药性。

    3. KRAS突变通过代谢重编程(乳酸生成)驱动H3K18la修饰的富集。

    4. 靶向调控H3K18la或其相关酶可显著抑制KRAS突变型CRC肿瘤生长。


    应用前景

    本研究将为KRAS突变型CRC的发病机制和治疗策略提供新思路。H3K18la及其相关代谢和表观遗传调控机制的发现可能为KRAS突变型CRC的诊断和靶向治疗提供潜在的生物标志物和干预靶点,为改善患者的治疗效果和生存率提供理论基础。


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