【选题案例】组蛋白乳酸化激活ac4C乙酰化促进葡萄膜黑色素瘤发展的作用机制研究.docx

学术   2024-12-13 23:54   上海  

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国自然选题案例!


组蛋白乳酸化激活ac4C乙酰化促进葡萄膜黑色素瘤发展的作用机制研究


立项依据

葡萄膜黑色素瘤(Uveal Melanoma, UM)是成人眼内恶性肿瘤中最常见的一种,其侵袭性强、转移率高,目前尚无有效治疗方法。近年来,表观遗传修饰在UM发生发展中的作用逐渐受到关注,其中组蛋白修饰和RNA修饰作为关键调控手段,对基因表达和细胞功能的调控具有重要意义。

组蛋白乳酸化是一种新型表观遗传修饰,被发现通过代谢-表观遗传耦合机制调控肿瘤相关基因的表达。另一方面,RNA乙酰化修饰(如N4-乙酰胞苷酸修饰,ac4C)是一种可逆的表观遗传RNA修饰,通过影响RNA的稳定性和翻译效率,参与癌症的发生发展。然而,目前关于组蛋白乳酸化是否通过激活RNA ac4C修饰促进UM发展的机制尚未被研究。

已有研究提示,UM肿瘤细胞可能利用代谢相关表观遗传修饰,如乳酸化和RNA乙酰化,调控肿瘤促进基因的表达,从而增强其侵袭和转移能力。揭示组蛋白乳酸化与ac4C修饰之间的联系,将为理解UM的分子机制提供新的视角,也可能为UM的治疗提供新的靶点。


科学假说

组蛋白乳酸化通过激活RNA ac4C乙酰化修饰,调控关键肿瘤基因的表达,促进葡萄膜黑色素瘤的发生与发展。


研究内容

  1. UM中组蛋白乳酸化和ac4C修饰水平的分析

  • 检测UM组织和细胞中组蛋白乳酸化和ac4C修饰的动态变化及其与患者预后的相关性。

  • 组蛋白乳酸化对ac4C修饰的调控作用

    • 探讨组蛋白乳酸化是否通过调控RNA修饰酶(如NAT10)活性影响ac4C修饰水平。

  • 组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴对UM发展的作用

    • 验证该调控轴对UM细胞增殖、侵袭、转移等恶性生物学行为的影响。

  • 组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴的分子机制

    • 分析关键肿瘤基因在组蛋白乳酸化-ac4C修饰调控下的表达变化及其在UM发展中的功能。


    研究方案

    1. UM组织样本和细胞模型的组蛋白乳酸化与ac4C修饰分析

    • 样本来源:收集UM患者的肿瘤组织及正常葡萄膜组织,通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测组蛋白乳酸化(如H3K18la)和RNA ac4C修饰水平。

    • 相关性分析:结合临床信息,分析组蛋白乳酸化与ac4C修饰水平及患者肿瘤分期、转移情况的相关性。

    2. 组蛋白乳酸化对ac4C修饰的调控作用

    • 体外实验:利用UM细胞株(如92.1、MEL270),通过过表达或敲低乳酸化修饰酶(如P300)和RNA乙酰化修饰酶(如NAT10),检测组蛋白乳酸化与ac4C修饰的关联。

    • 功能验证:通过ChIP-qPCR和RNA免疫共沉淀技术(RIP),验证组蛋白乳酸化是否通过调控NAT10基因表达或酶活性影响ac4C水平。

    3. 组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴对UM发展的作用

    • 细胞增殖与侵袭检测:通过CCK-8、Transwell和克隆形成实验评估组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴对UM细胞增殖、迁移和侵袭的影响。

    • 小鼠模型验证:构建UM细胞裸鼠皮下移植模型,观察组蛋白乳酸化和ac4C修饰的干预对肿瘤生长和转移的影响。

    4. 分子机制解析

    • 转录组分析:通过RNA-seq分析组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴调控的差异基因及信号通路,筛选UM发展的关键靶点。

    • 特异性验证:利用功能实验验证靶基因(如MET、BCL2L1)的调控作用及其在UM发展中的功能。


    预期创新点

    1. 揭示组蛋白乳酸化与ac4C修饰的耦合作用
      首次探讨组蛋白乳酸化与RNA ac4C修饰之间的联系,揭示其在UM发展中的分子机制。

    2. 明确代谢相关表观遗传修饰在UM中的作用
      阐明乳酸介导的表观遗传调控在UM发生发展中的新机制,为UM的代谢表观遗传研究提供新思路。

    3. 提供新的治疗靶点
      以组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴为潜在靶点,探索UM治疗的新策略。


    预期结果

    1. 发现UM患者中组蛋白乳酸化和ac4C修饰水平显著升高,并与患者预后相关。

    2. 阐明组蛋白乳酸化通过调控NAT10活性促进ac4C修饰的分子机制。

    3. 验证组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴对UM细胞恶性行为及肿瘤进展的调控作用。

    4. 提供具有临床相关性的潜在靶点,为UM的治疗开发新策略。


    应用前景

    本研究将为理解UM发展的表观遗传机制提供新视角,并探索组蛋白乳酸化-ac4C修饰轴作为UM治疗的新靶点,为开发靶向表观遗传修饰的UM治疗策略提供理论依据和实验支持。



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