Angew 烯还原酶选择性生物还原氰基炔烃生成(Z)-氰基烯烃 奥维耶多大学 Iván Lavandera

文摘   科学   2024-07-01 22:26   浙江  

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摘要

从炔烃直接合成烯烃通常需要使用过渡金属催化剂。不幸的是,这种转化的有效生物催化替代品尚未被发现。本文描述了电子缺乏的炔烃通过烯还原酶 (ERED) 催化选择性生物还原为烯烃。带有酮、醛、酯和腈部分的炔烃已被有效还原,转化率和立体选择性极佳,观察到 E/Z 比的明显趋势取决于吸电子基团的性质。在氰基炔烃的情况下,(Z)-烯烃是主要产物,反应范围扩大到各种芳香族底物(转化率高达 >99%,Z/E 立体选择性高达 >99/1)。含有醛、酮或酯官能团的其他炔烃也被证明是极好的底物,有趣的是,它们产生了相应的 (E)-烯烃。在 0.4 mmol 规模上进行了制备性生物转化,产生了所需的 (Z)-氰基烯烃,分离产率良好至极好(63-97%)。通过分子对接预测 ERED-pu-0006 活性位点中关键分子的结合姿势,这种新颖的反应性得到了合理化。

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研究内容

碳碳三键的选择性还原可用于构建有价值的烯烃,在大多数情况下,化学选择性还原炔烃并在烯烃阶段停止的有效系统需要使用昂贵的金属催化剂和危险的氢气氛围,还可能导致较差的立体选择性,生物催化是促进具有上述特征的转化的绝佳选择。

唯一能够催化多个碳碳键还原的酶是烯还原酶(ERED),Rosche 等人在 2007 年发现酿酒酵母中的OYE3能够将一种缺电子炔烃还原为相应的烯烃。直到2021年,Rühl等人从真菌中分离出的 ERED CaeEnR1 扩大了这种方法的范围,但该方法具有底物浓度低且转化率低的局限性,但这也为开发可以克服所有这些问题的新策略提供了机会。本文探索了一种新的氰基炔烃还原方法,利用来自Zymomonas mobilis的烟酰胺依赖性环己烯酮还原酶 (NCR) 和商用ERED选择性生产(Z)-氰基烯烃,还研究了不同炔烃的反应性以确定使用这些催化剂进行ERED催化选择性生物还原三键生成α,β不饱和化合物的潜力(图1)。


图1. ERED催化炔烃的还原

作者首先选择3-苯基丙腈 (1a) 作为模型底物。根据之前的研究,使用NCR酶在标准反应条件进行反应。5 mM 底物浓度下转化率高达 96%,产物氰基烯烃2a Z/E 比为 91/9,趋向于 Z 立体异构体。1a 浓度增加至 20 mM 可获得更好的结果,当底物浓度升高至 40 mM 时,转化率下降至 50%。将温度升高至 40 ºC导致 NCR 活性完全丧失(表1)。

表1. NCR催化氰基炔烃1a的生物还原

为了进一步对立体烯烃生产的改善,对商业酶进行筛选,几种酶可以进行预想的转化,表明腈基能够促进三键的选择性还原。ERED-pu-0006可完全转化为所需的氰基烯烃2a,作者使用 OYE3 (与这种酶具有很高的相似性)具有高选择性的 Z-2a,但产量较低(表2)。


表2. ERED催化氰基炔烃1a的生物还原

为了测试 ERED-pu-0006 催化其他类似底物的性能,作者优化了反应条件后将该酶应用于多种带有不同吸电子基团的炔烃。1b1c,和1d的转化率良好至优异,α,β-不饱和产物以E-选择性获得,与存在腈基时相反。通过对反应条件进行微调可以在烯烃阶段停止反应,或者使反应完全朝向相应的烷烃进行,转化率极佳。这项研究对该酶的反应性提供了初步的见解,确定了它在进行所需的炔烃部分还原时所具有的一些优势和局限性(表3)。

表3. 带有不同吸电子基团炔烃的ERED催化还原

在研究了 ERED-pu-0006 对不同 EWG 的反应性后,作者将重点放在了其他氰基炔烃上,对每种衍生物的反应条件进行优化以实现最高的性能。酶对芳香环上不同取代的耐受性良好,在大多数情况下可获得高至优异的产量和优异的异构体比。当使用脂肪族底物时,未观察到任何反应。这些结果表明酶对非芳香族底物的亲和力较低。在调整每种底物的条件后,可以在 0.4 mmol 下实现转化,没有观察到抑制,在所有情况下都以高至极好的产量和极好的异构体比率得到所需的 (Z)-烯烃(图2)。

图2. ERED-pu-0006催化氰基炔烃生物还原的底物范围

将炔烃 1a 建模到酶的活性中心表明,α 位上最近的酪氨酸残基(Y376)与黄素辅因子位于同一面上,从而得到顺式烯烃。在对接构象中,典型的催化酪氨酸残基 (Y197) 远离炔烃的α位,这使得 Y376 成为 ERED-pu-0006 中合理的非典型质子化残基图3


图3. 底物1a与ERED-pu-0006的对接构象分析


生成的(Z)-2a可获得许多不同的(Z)-构建砌块图4),因为无法实现3-苯基丙炔酰胺 (1f) 的直接生物还原,最初探索了一种并发级联,将钌催化剂与酶一起放入同一反应中,(Z)-2f的转化率最高只能达到40%。一锅顺序法的转化率不理想,当温度和金属负载分别升至60 ºC和6 mol%时,可以分离出所需的酰胺 2f,产率为 68%(表4)。

图4. 从(Z)-2a开始合成的不同衍生物


总之,本文开发了一种立体选择性部分还原炔烃的生物催化方法,提出并优化了一种以氰基炔烃 1a 为原料的一锅化学酶促工艺以高产率依次得到 (Z)-3-苯基丙炔酰胺。
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论文相关信息

作者信息及链接

Iván Lavandera:https://dptoqoi.uniovi.es/personal/pdi/-/asset_publisher/0022/content/personal_lavandera-garcia-ivan;redirect=/personal/pdi

研究方向:有机化学、可持续催化、生物催化

文章信息:BioLindlar Catalyst: Ene-Reductase-Promoted Selective Bioreduction of Cyanoalkynes to Give (Z)-Cyanoalkenes

文章链接:https://doi.org/10.1002/anie.202410283

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