遵义医科大学 陈永正 ACS Catal P450DA单加氧酶催化未活化烯烃的化学选择性和对映体发散性环氧化

文摘   2024-10-24 21:53   辽宁  

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摘要
虽然 P450s 对活性烯烃进行酶促环氧化已得到充分证实,但对未活性烯烃进行化学和对映选择性环氧化仍然是一项艰巨的挑战,这主要是由于存在烯丙基 C-H 键的竞争性羟基化。此外,P450 单加氧酶催化的烯烃环氧化通常提供具有高对映纯度的 S-构型产物,而 P450 酶在环氧化反应中表现出高R-对映选择性的例子仍然很少。本研究报告了使用工程化的 P450DA 单加氧酶对未活性烯烃进行化学选择性和对映发散性环氧化。突变体是通过基于P450DA-WT和P450DA-M3的 X 射线的结构引导定向进化获得的,只需采用不同的 P450DA 突变体即可实现对映体发散合成,从而产生环氧产物的两种对映体。对产品进行了各种转化,说明了这些方法的合成效用。此外,分子对接和分子动力学模拟揭示了突变体高环氧化选择性和互补立体选择性的起源。

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研究内容

P450单氧化酶(P450s)是一类有吸引力的生物催化剂,广泛用于氧化反应,尤其是对活化C−H键的羟基化和烯烃的环氧化。然而,针对未活化烯烃的直接手性环氧化仍然具有挑战性,因为其反应活性低且难以控制手性。最近发现了来自Deinococcus apachensis的P450单氧化酶(P450DA),能够高选择性地催化羟基化反应。通过结构引导的定向进化,本研究成功开发了P450DA突变体,显著提高了对未活化烯烃的环氧化选择性,并实现了同时合成两种手性环氧化物(图1)。


图1. P450s催化未活化末端烯烃的氧化


研究发现,P450DA中位于血红素顶部的F90和I331残基在控制苯甲酸甲酯和卤代烯烃的C−H键立体选择性中起关键作用。作者调查了这两个残基对未活化末端烯烃选择性氧化反应的影响。通过饱和突变文库构建,筛选出两个突变体P450DAER1和P450DAES1,它们成功地将选择性从羟基化转变为环氧化,并分别获得手性环氧化物(R)-3a和(S)-3a。然后通过工程改造P450DAER1并采用迭代饱和突变策略,提高了环氧化选择性。突变体I331F/I265A(P450DAER2)将选择性提升至91%。后续多个突变体(如P450DAER3T、P450DAER3E等)进一步增强了R选择性环氧化,表明I265及其他残基在底物进入活性中心中起关键作用。接下来通过迭代饱和突变策略构建了P450DAES1突变体,以实现S选择性环氧化。经过五轮演化,关键残基的突变使得环氧选择性超越了原模板,其中P450DAER4TL对(R)-3a的选择性比为>1:99,P450DAES5对(S)-3a的选择性比从97:3提升至5:95。(图2)。


图2. R-和S-选择性环氧化突变的进化


通过定向进化和P450DA结构分析,发现I81和M187对(R)-3a和(S)-3a的选择性均有影响。在P450DAER5中,I331变为较大的氨基酸,而I81、M183、M187和I265变为较小的氨基酸,增加了F90和I331之间的空间,有利于(R)-3a选择性。相反,P450DAES5中I81和M187变为较大的氨基酸,Y78和F90变为较小的氨基酸,增强了(S)-3a的选择性。最终,P450DAER5和P450DAES5分别接受了八个和九个突变,实现了从苯基C−H羟基化到C=C键环氧化的功能转变(图3)。


图3. P450DA用于烯丙基苯环氧化的定向进化


P450DAER1和P450DAES1成功生成高对映选择性的(R)-和(S)-环氧化物。I331F突变显著提高了R选择性,使(R)-3a的对映体比达到94:6,而F90I突变则显著增强了S选择性。F90和I331对底物1a的氧功能化选择性和立体选择性至关重要。通过200 ns的分子动力学模拟,验证了底物1a的化学选择性,并发现P450DAER5和P450DAES5突变体的C1更接近血红素中心。模拟结果显示(R)-环氧化物来自Re面,(S)-环氧化物来自Si面,且与实验结果一致(图4)。


图4. MD模拟


进化后的突变体成功对单取代末端烯烃进行环氧化,生成高选择性的(R)-和(S)-环氧化合物。分子对接分析显示,P450DAER突变体的活性中心更紧凑,稳定了底物的C=C键位置,保持高选择性。P450DAES突变体的空间较大,导致选择性降低。总之,进化后的P450DA酶在底物处理时展现出完整的环氧化选择性(图5)。


图5. 底物范围研究


为评估进化变体在药物化学中的应用,使用P450DAES5的全细胞在5 mM底物浓度下环氧化1a,获得(S)-3a的产率为40%,对映体比95:5。利用(S)-3a合成了三类化合物,可作为生物活性化合物或药物的关键部分,展现了手性单取代末端环氧化物的应用潜力(图6)。


图6. 手性环氧物3a的选择性开环
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论文相关信息

文章信息:P450DA Monooxygenase-Catalyzed Chemoselective and Enantiodivergent Epoxidation of Unactivated Alkenes

文章链接:https://doi.org/10.1021/acscatal.4c04941

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