3.5/Q3,纯生信,天津中医药大学双向MR+敏感性分析两步发文

文摘   2024-10-21 20:14   海南  
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文章标题:A Bidirectional Mendelian Randomization Study of Sarcopenia-Related Traits and Knee Osteoarthritis

中文标题:肌肉减少症相关特征和膝骨关节炎的双向孟德尔随机化研究

发表期刊Clin Interv Aging

发表时间2023年9月

影响因子3.5/Q3

研究背景

随着全球人口老龄化的发展,肌肉减少症和膝骨关节炎 (KOA) 这两种与年龄相关的疾病将继续给社会带来越来越大的医疗和经济负担。以前的研究已经发现了两者之间的关联,但因果关系仍然存在争议,并且很难消除混杂因素。因此,进行了一项孟德尔随机化 (MR) 研究来克服这些混杂因素并调查肌肉减少症与 KOA 之间的因果关系。

究方法

双样本双向 MR 分析分两步进行,第一步是肌肉减少症,而 KOA 是第一步的结果,反之亦然。关于低握力 (n=256,523)、步行速度 (n=459,915)、四肢瘦体重 (ALM,n=450,243) 和 KOA (n=403,124) 的全基因组关联研究 (GWAS) 数据来自英国生物样本库。采用逆方差加权 (IVW) 和加权中位数等方法评估 KOA 伴肌肉减少症的因果关系,并进行敏感性分析。


数据来源


结果分析

1. 肌肉减少症相关性状对 KOA 的影响

在以 ALM 、 LHS 和 WP 作为暴露,KOA 为结局的 MR 分析中,过滤后共包括 598 个、 10 个和 28 个 SNP。MR 分析结果显示肌肉减少症相关特征与 KOA 发生之间存在因果关系。结果表明,与肌肉质量减少相关的特征与 KOA 的发生有因果关系。此外,提高步行速度和增强骨骼肌质量可能会在一定程度上降低患 KOA 的风险。此外,MR-Egger 回归的截距结果表明不存在多效性 (p > 0.05)。


2. KOA 对肌肉减少症相关性状的影响

在反向 MR 分析中,选择后,分别包括 4 、 3 和 5 个 SNP 用于 ALM 、 WP 和 LHS 的分析。MR 分析结果显示 KOA 与肌肉减少症相关性状之间没有因果关系

3. 敏感性分析

为了确保我们的 MR 分析结果可靠,需要一个多步骤的验证过程。首先,使用 Cochran Q 统计量测试 IV 之间的异质性。接下来,进行了多效性测试。最后,通过依次去除每个 SNP 并计算剩余 SNP 的元效应来进行留一法分析,以观察每个 SNP 被去除后结果是否发生显着变化。

文章小结

我们的研究表明 KOA 与肌肉减少症之间存在明显的单向因果关系,并支持肌肉减少症患者更容易发生 KOA 的观点。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!

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