3.8/Q2,湖北医科大学NHANES+双样本孟德尔+GWAS研究脂质生物标志物与骨关节炎之间的关联

文摘   2024-10-05 22:10   美国  

今天小骨为大家分享的文章选择了3个GWAS进行MR分析,初次接触MR分析的小伙伴们不妨参考一下这篇文章的思路。
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文章标题:The association between lipid biomarkers and osteoarthritis based on the National Health and Nutrition Examination Survey and Mendelian randomization study 

中文标题:基于全国健康与营养检查调查和孟德尔随机化研究的脂质生物标志物与骨关节炎之间的关联

发表期刊Scientific Reports

发表时间2024年1月

影响因子3.8/Q2

研究背景

骨关节炎 (OA) 等退行性关节疾病,临床表现为关节疼痛、关节活动受限和骨摩擦音,严重影响患者的生活质量。近年来,研究已经确定了可能与 OA 发展相关的脂质生物标志物,包括甘油三酯 (TG)、总胆固醇 (TC)、高密度脂蛋白 (HDL) 和低密度脂蛋白 (LDL)。尽管这些研究已经探讨了脂质生物标志物与 OA 之间的关联,但两者之间的关联仍不清楚。

究方法

首先,使用全国健康与营养检查调查 (NHANES) 数据库筛选具有脂质标志物、 OA 和相关协变量的参与者,并使用 logistic 回归分析脂质标志物与 OA 之间的关联;然后,在孟德尔随机化 (MR) 的理论框架下,使用脂质标志物和 OA 的 GWAS 数据进行双样本 MR,探讨两者之间的因果关系,并通过逆方差加权 (IVW) 方法进行分析。还进行了异质性检验、敏感性分析和多效性分析。

数据来源

MR 研究使用双样本 MR。暴露因子为 TG 、 TC 、 HDL 、 LDL。TG、HDL 和 LDL 的 GWAS 数据来自 Richardson 等人在 2020 年发表的论文,TC 数据来自论文 Borges CM et al. 2020,OA 的结果因素来自医院确诊的 OA,包含 Zengini E 等人于 2018 年测序的 50,508 个样本量和 15,845,511 个单核苷酸多态性 (SNP)。

结果分析

1. 基线特征

在 2003 年至 2020 年期间,有 82,601 名参与者接受了 OA 评估,77,131 名参与者获得了脂质生物标志物结果,在组合所有协变量后,共有 91,834 名参与者。删除具有缺失值的参与者后,仍有 9492 名参与者。3706 名参与者年龄超过 50 岁,其中 836 名患有 OA,2870 名没有 OA。加权后,这代表 40,802,041 名参与者。

2. NHANES 中的脂质生物标志物和 OA

单因素logistic结果显示,TG 、 TC 、 HDL 和LDL的OR(95% CI)分别为1.00 (1.00, 1.00)、1.00 (1.00, 1.00)、1.01 (1.00, 1.01) 和 0.99 (0.99, 1.00),P 值分别为 0.12 、 0.08 、 0.02 和 < 0.001。多因素logistic(模型 3)结果显示,TG 、 TC 、 HDL 和 LDL 的 OR (95% CI) 分别为 1.00 (1.00, 1.00)、1.00 (1.00, 1.00)、1.01 (1.00, 1.01) 和 1.00 (0.99, 1.00),p 值分别为 0.62 、 0.37 、 0.049 和 0.049。

3. MR 中脂质生物标志物与 OA 之间的因果关系

相同的统计过程用于脂质生物标志物和 OA 的因果分析。TG 的 IVW 结果显示 OR (95% CI) 为 1.059 (0.969 至 1.157),TC 显示 OR (95% CI) 为 0.950 (0.851 至 1.061),HDL 显示 OR (95% CI) 为 0.936 (0.858 至 1.021),LDL 显示 OR (95% CI) 为 0.892 (0.797-0.998)。F 值均大于 10。异质性检验、敏感性分析和多效性分析均为阴性。根据 MR 的三个假设,LDL 和 OA 之间存在因果关系,TG、TC、HDL 和 OA 之间没有因果关系

文章小结

我们的研究使用横断面研究和 MR 来证明脂质生物标志物与 OA 之间的关系。LDL 是 OA 的保护因子。TG、TC 和 OA 之间不存在关系,而 HDL 仍需进一步研究证明。我们的研究结果为 OA 的预防和治疗策略提供了新的生物标志物,但仍需要进一步研究其潜在机制。如果您对生信分析和公共数据库挖掘感兴趣,但时间和精力有限或者缺乏相关经验,小骨非常乐意为您提供如下服务:免费思路评估、付费方案设计生信分析等,有意向的老师欢迎联系小骨哦!

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